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| Registros recuperados : 1 | |
| 1. |  | SALGADO, C. C.; CRUZ, C. D.; NASCIMENTO, M.; BARRERA, C. F. S. O uso da variância como metodologia alternativa para integração de mapas genéticos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 66-73, jan. 2011. Título em inglês: Variance utilization as an alternative methodology for integrating genetic maps.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| Registros recuperados : 1 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
20/04/2011 |
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Data da última atualização: |
11/12/2017 |
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Autoria: |
SALGADO, C. C.; CRUZ, C. D.; NASCIMENTO, M.; BARRERA, C. F. S. |
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Afiliação: |
Caio Césio Salgado, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Cosme Damião Cruz, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Moysés Nascimento, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Carlos Felipe Sanches Barrera, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento. |
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Título: |
O uso da variância como metodologia alternativa para integração de mapas genéticos. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 66-73, jan. 2011. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Variance utilization as an alternative methodology for integrating genetic maps. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação. |
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Palavras-Chave: |
Frequência de recombinação; Grupos de ligação; Internal tension; Recombination frequency; Tensão interna. |
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Thesagro: |
Marcador molecular. |
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Thesaurus NAL: |
Genetic markers; Linkage groups. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/105560/1/O-uso-da-variancia.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação.
650 $aGenetic markers
650 $aLinkage groups
650 $aMarcador molecular
653 $aFrequência de recombinação
653 $aGrupos de ligação
653 $aInternal tension
653 $aRecombination frequency
653 $aTensão interna
700 1 $aCRUZ, C. D.
700 1 $aNASCIMENTO, M.
700 1 $aBARRERA, C. F. S.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 1, p. 66-73, jan. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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