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Biblioteca(s): | Embrapa Soja.
Data corrente: | 05/03/2008
Data da última atualização: | 06/03/2008
Autoria: | VESPERO, E. C.; BARCELLOS, F. G.; PENHA, R. E. S.; PERUGINI, M. R. E.; CUNHA, M. H.; SARIDAKIS, H. O.
Afiliação: | Eliana Carolina Vespero, UEL; Fernando Gomes Barcellos, UEL / CNPSo; ;Rafael Elias da Silva Penha, UEL; Marcia Regina Eches Perugini, UEL; Mariangela Hungria da Cunha, CNPSo; Halha Ostrensky Saridakis, UEL.
Título: | Comparação de métodos moleculares utilizados no estudo epidemiológico de isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae produtora de esbl.
Ano de publicação: | 2007
Fonte/Imprenta: | In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 24., 2007, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2007.
Descrição Física: | 1 CD-ROM.
Idioma: | Português
Notas: | Nome correto do quinto autor HUNGRIA, M.
Conteúdo: | Diferentes técnicas de tipagem para a espécie de Klebsiella pneumoniae tem sido relatadas com a finalidade de determinar se os isolados são geneticamente relacionados.Dentre os métodos moleculares genotípicos utilizados na diferenciação de amostras de K.pneumoniae destacam-se os seguintes: análise do perfil plasmidial, técnica de rep-PCR e RAPD, ribotipagem, PFGE AFLP. Este trabalho foi realizado com 141 amostras de K.pneumoniae produtoras de ESBL isoladas de pacientes do Hospital Universitário da Universidade Estadual de Londrina, no período de cinco anos (2000-2004), com o objetivo de entender a epidemiologia desta bactéria e avaliar as técnicas de rep-PCR, RAPD e PFGE utilizadas na tipagem molecular de K. pneumoniae. Foram utilizados os seguintes primers para as técnicas baseadas em PCR: ERIC1R, ERIC2, REP1R, REP2I, BOXA1R e o primer 793  para RAPD. Para a técnica de PFGE, o DNA cromossomal das bactérias foram digeridos com XbaI (Invitrogen) e os fragmentos de DNA foram separados usando o sistema CHEF-DRIII (Biorad, USA). Os géis foram analisados no programa Bionumerics (version 2.0; Applied Mathematics Kortrijk, Belgium) e a capacidade de discriminação de cada método foi calculado, utilizando o índice de Simpson ou de discriminação (DI). O índice de Simpson demonstrou poder elevado de discriminação com PFGE (DI=0,990), REP-PCR (DI=0,969) e com a combinação dos métodos (DI=0,999); seguidos de RAPD (DI=0,946), ERIC-PCR (DI=0,938) e BOX-PCR (DI=0,937). As técnicas baseadas em PCR tem sido frequentemente utilizada nos estudos epidemiológicos hospitalares por serem rápidas, baratas e de fácil execução. Embora o método de PFGE foi mais discriminatório, os métodos baseados em PCR mostraram -se mais eficientes na separação dos clones. De acordo com os resultados, os métodos baseados em PCR são apropriados para análise de diversidade de K.pneumoniae quando usados incialmente e PFGE como análise complementar, para confirmar a disseminação de uma cepa epidêmica.
Categoria do assunto: | --
Registro original: | Embrapa Soja (CNPSO)
Exemplares: | CNPSO - (27991-1) - UPC - PL - -- - CD 0183 -  -  - DIS