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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
11/11/2015 |
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Data da última atualização: |
18/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, G. A. F.; DANTAS, J. L. L.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
G. A. F. OLIVEIRA, UFRB; JORGE LUIZ LOYOLA DANTAS, CNPMF; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Development and validation of minisatellite markers for Carica papaya. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Biologia Plantarum, v. 59, n.4, p 686-694, 2015. |
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DOI: |
10.1007/s10535-015-0551-9686 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Whereas microsatellite markers are well described, there are few studies investigating minisatellites. Therefore, this study aimed to identify, characterize, and validate minisatellite loci for papaya (Carica papaya L.). The entire papaya genome, which covers 330 Mb, was used to mine minisatellites with motifs ranging from 6 to 500 bp, and at least six replicates and 82 loci were validated in a set of 24 accessions. A total of 1 730 minisatellite loci were identified, located in 695 sequences, with an average of one minisatellite every 156 kb. Variation in GC content ranged from 0.00 to 83.84 % with an average of 28.84 % indicating that these papaya minisatellites are AT rich. Motifs of up to 20 bases represented 71.45 % of the markers. In addition, the observed variation in the number of motif repeats was from 6 to 186 with an average of 9.27 per minisatellite. Independent of the classification, the frequency of minisatellites decreased with an increase in the number of repeating units. Among the validated loci, 48.78 % were found to be polymorphic, and the number of alleles (NA) ranged from two to seven with a mean of 3.10. The average polymorphic information content (PIC), expected heterozygosity (He), and observed heterozygosity (Ho) were 0.38, 0.43, and 0.11, respectively. According to genetic diversity parameters, such as NA, He, and PIC, no significant correlations were found among the size of motifs, the number of repeats, and the GC content of these minisatellites. This study clearly demonstrates the polymorphism of minisatellites and their potential use in detection of intraspecific genetic variations in C. papaya. The results will be useful when managing genetic resources and plant breeding. MenosWhereas microsatellite markers are well described, there are few studies investigating minisatellites. Therefore, this study aimed to identify, characterize, and validate minisatellite loci for papaya (Carica papaya L.). The entire papaya genome, which covers 330 Mb, was used to mine minisatellites with motifs ranging from 6 to 500 bp, and at least six replicates and 82 loci were validated in a set of 24 accessions. A total of 1 730 minisatellite loci were identified, located in 695 sequences, with an average of one minisatellite every 156 kb. Variation in GC content ranged from 0.00 to 83.84 % with an average of 28.84 % indicating that these papaya minisatellites are AT rich. Motifs of up to 20 bases represented 71.45 % of the markers. In addition, the observed variation in the number of motif repeats was from 6 to 186 with an average of 9.27 per minisatellite. Independent of the classification, the frequency of minisatellites decreased with an increase in the number of repeating units. Among the validated loci, 48.78 % were found to be polymorphic, and the number of alleles (NA) ranged from two to seven with a mean of 3.10. The average polymorphic information content (PIC), expected heterozygosity (He), and observed heterozygosity (Ho) were 0.38, 0.43, and 0.11, respectively. According to genetic diversity parameters, such as NA, He, and PIC, no significant correlations were found among the size of motifs, the number of repeats, and the GC content of these minisatellites. ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Carica Papaya; Mamão; Variação genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic variation. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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001 2028333
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650 $aGenetic variation
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 42 | |
| 1. |  | AZEVEDO, R. de. Manejo integrado de insetos-praga em arroz, milho e soja. In: SIMPÓSIO SOBRE MANEJO DE PRAGAS, 1., 2009, Belém, PA. Manejo integrado de pragas, doenças e plantas daninhas em grãos e fruteiras: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM. Editores técnicos: Alessandra Keiko Nakasone, Aloyséia Cristina da Silva Noronha, Luiz Sebastião Poltronieri.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | LUNZ, A. M.; AZEVEDO, R. de. Eucalipto. In: SILVA, N. M. da; ADAIME, R.; ZUCCHI, R. A. (Ed.). Pragas agrícolas e florestais na Amazônia. Brasília, DF: Embrapa, 2016. Pt. 3, cap. 23, p. 461-471.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | LUNZ, A. M.; AZEVEDO, R. de; BATISTA, T. F. V. Paricá. In: SILVA, N. M. da; ADAIME, R.; ZUCCHI, R. A. (Ed.). Pragas agrícolas e florestais na Amazônia. Brasília, DF: Embrapa, 2016. Pt. 3, cap. 24, p. 473-491.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 7. | | MONTEIRO, O. M.; LUNZ, A. M.; AZEVEDO, R. de; MOURÃO JUNIOR, M.; BATISTA, T. F. V. Avaliação de inseticida para controle da cigarra Quesada gigas em plantios de paricá. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 34, n. 78, p. 169-172, abr./jun. 2014. Nota científica.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas. |
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| 9. | | SILVA, P. R. dos S.; CARVALHO, C. J. R. de; AZEVEDO, R. de; ROUSSEAU, G. X. Ocorrência de formigas em diferentes sistemas de uso do solo, na Região Bragantina do Estado do Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: resumos. Viçosa: UFV, 2008. Resumo 1487-1.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 10. | | ALVES, R. M.; AZEVEDO, R de; CUNHA, R. L.; SANTOS, V. S. dos. Estimação de parâmetros genéticos em genótipos de girassol no nordeste do estado do Pará. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18., SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 166-172. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | ALVES, R. M.; AZEVEDO, R. de; CUNHA, R. L.; SANTOS, V. S. dos. Estimação de parâmetros genéticos em genótipos de girassol no nordeste do estado do Pará. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 166-172. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | MAUES, M. M.; LUNZ, A. M.; LEMOS, W.; AZEVEDO, R. de. Coleção entomológica da Embrapa Amazônia Oriental. In: WORKSHOP DE CURADORES DE GERMOPLASMA DO BRASIL, 2011, Campinas. Anais [e] resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2011. p. 379. Editores técnicos: Marília Lobo Burle; Renato Ferraz de Arruda Veiga; Maria do Socorro Maués Albuquerque; Vânia Cristina Rennó Azevedo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 14. | | MONTEIRO, O. M.; LUNZ, A. M.; AZEVEDO, R. de; OLIVEIRA JUNIOR, M. C. M. de. Spatial distribution and gallery depths of Quesada gigas nymphs in parica plantations. Revista de Ciências Agrárias, Belém, PA, v. 56, n. 4, p. 353-358, out./dez. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 16. | | AZEVEDO, R. de; LUNZ, A. M.; MONTEIRO, O. M.; SOUZA, H. S.; PINTO, E. S.; LECHINOSKI, A. Effects of insecticides to control cicadas Quesada Gigas Olivier (Hemiptera: cicadidae) in reforestation areas with "paricá" (Schizolobium parahyba var. amazonicum) in Pará state. In: INTERNATIONAL WORKSHOP ON CROP PROTECTION CHEMISTRY IN LATIN AMERICA, 3., 2009, Rio de Janeiro. Environment, safety and regulation: abstracts, posters and lectures. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2009. (Embrapa Solos. Documentos, 112).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 17. | | LINS, P. M. P.; AZEVEDO, R. de; RIBEIRO, R. C.; LEMOS, W. de P.; MÜLLER, A. A. Avaliação de inseticidas para o controle de Homalinotus Depressus L. (Coleoptera: Curculionidae) em lavoura comercial de coco, no Estado do Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: resumos. Viçosa: UFV, 2008. Resumo 1487-3.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 18. | | LUNZ, A. M.; AZEVEDO, R. de; MOURÃO JUNIOR, M.; MONTEIRO, O. M.; LECHINOSKI, A.; ZANETI, L. Z. Método para monitoramento de ninfas de cigarras e controle com inseticidas em reflorestamentos com paricá. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 7, p. 631-637, jul. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 20. | | AZEVEDO, R. de; GLÓRIA, G. C. P.; PINTO, E. S.; MONTEIRO, O. M.; SILVA, W. L. R. da. Ocorrência de insetos-praga em girassol, no estado do Pará. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 173-177. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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