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| Registros recuperados : 90 | |
| 61. |  | ESCOBAR, J. A. D.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F.; BARBOSA, M. H. P.; NUNES, A. C. P.; ALVES, R. S.; NASCIMENTO, M. Teoria de valores extremos e tamanho amostral para o melhoramento genético do quantil máximo em plantas. Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 36, n. 1, p. 108-127, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 62. | | RESENDE, M. D. V. de; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; SOUSA, T. V.; PEREIRA, A. A.; ALVES, R. S.; AZEVEDO, C. F. Tamanho amostral e detecção de genes via GWAS em características quantitativas do cafeeiro. Brasília, DF: Embrapa Café, 2022. 23 p. (Embrapa Café. Circular técnica, 7).| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 63. | | LIMA, L. P.; AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; OLIVEIRA, E. J. de. Triple categorical regression for genomic selection: application to cassava breeding. Scientia Agricola, v. 76, n. 5, p. 368-375, Sept./Oct. 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 64. | | AZEVEDO, C. F.; FERRÃO, L. F. V.; BENEVENUTO, J.; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; MUNOZ, P. R. Using visual scores for genomic prediction of complex traits in breeding programs. Theoretical and Applied Genetics, v. 137, n. 1, 2024. 16 p.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 65. | | SANTOS, P. M. dos; NASCIMENTO, A. C. C.; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S. Use of regularized quantile regression to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 9, p. 1011-1017, Sept. 2018. Título em português: Uso da regressão quantílica regularizada para predição de mérito genético em suínos quanto a características assimétricas de carcaça.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 66. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F.; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. Ridge, Lasso and Bayesian additive dominance genomic models. BMC Genetics, v. 16, art. 105, Aug. 2015. 13 p.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 67. | | TORRES, L. G.; OLIVEIRA, E. J. de; OGBONNA, A. C.; BAUCHET, G. J.; MUELLER, L. A.; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F.; SIMIQUELI, G. F.; RESENDE, M. D. V. de. Can cross-country genomic predictions be a reasonable strategy to support germplasm exchange? A case study with hydrogen cyanide in cassava. Frontiers in Plant Science, v. 12, 742638, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 68. | | OLIVEIRA, M. I. P. de; ROCHA, M. do S.; LUCENA, A. M. A. de; AZEVEDO, C. F. de; ARRIEL, N. H. C.; BARTOLOMEU, C. R. C.; BELTRÃO, N. E. de M. Caracterização morfo-anatômica de folhas e caule de Jatrophas curcas L. (Euphorbiacea). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 5.; CLÍNICA TECNOLÓGICA EM BIODIESEL, 2., 2008, Lavras. Biodiesel: tecnologia limpa. Anais...Lavras: UFLA, 2008. 9 p. Seção Trabalhos. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 69. | | ROCHA, M. do S.; OLIVEIRA, M. I. P. de; AZEVEDO, C. F. de; LUCENA, A. M. A. de; BELTRÃO, N. E. de M.; CARVALHO, J. M. F. C.; ALMEIDA, F. de A. C.; BRUNO, R. de L. A. Caracterização morfoanatômico da cultivar BRS energia (Ricinus communis L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: resumos. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. p. 124| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 70. | | ROCHA, M. do S.; OLIVEIRA, M. I. P. de; AZEVEDO, C. F. de; LUCENA, A. M. A. de; BELTRÃO, N. E. de M.; CARVALHO, J. M. F. C.; ALMEIDA, F. de A. C.; BRUNO, R. de L. A. Caracterização morfoanatômico da cultivar BRS energia (Ricinus communis L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: anais. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 71. | | SOUSA, I. C. de; NASCIMENTO, M.; SANT’ANNA, I. de C.; CAIXETA, E. T.; AZEVEDO, C. F.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. L. da; ALKIMIM, E. R.; NASCIMENTO, A. C. C.; SERÃO, N. V. L. Marker effects and heritability estimates using additive-dominance genomic architectures via artificial neural networks in Coffea canephora. Plos One, v. 17, n.1, e0262055, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 72. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; AZEVEDO, C. F.; MARINHO, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; FERREIRA, K. C. Z.; ROSSE, L. N.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; GRATTAPAGLIA, D. Parametrizações em marcadores dominantes para seleção genômica ampla em eucalipto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 13-16.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 73. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; AZEVEDO, C. F.; MARINHO, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; FERREIRA, K. C. Z.; ROSSE, L. N.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; GRATTAPAGLIA, D. Parametrizações em marcadores dominantes para seleção genômica ampla em eucalipto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 13-16.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 74. | | ALVES, R. S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e; ROCHA, J. R. A. S. C.; NUNES, A. C. P.; CARNEIRO, A. P. S.; SANTOS, G. A. dos. Optimization of Eucalyptus breeding through random regression models allowing for reaction norms in response to environmental gradients. Tree Genetics & Genomes, v. 16, n. 2, p. 1-8, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 75. | | MIRANDA, T. L. R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; NUNES, A. C. P.; TAKAHASHI, E. K.; SIMIQUELI, G. F.; SILVA, F. F. e; ALVES, R. S. Evaluation of a new additive-dominance genomic model and implications for quantitative genetics and genomic selection. Scientia Agricola, v. 79, n. 6, p. 1-7, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 76. | | ROCHA, M. do S.; OLIVEIRA, M. I. P. de; MEDEIROS, C.; AZEVEDO, C. F. de; BELTRÃO, N. E. de M.; CARVALHO, J. M. F. C.; ALMEIDA, F. de A. C.; NASCIMENTO, L. C.; BRUNO, R. de L. A. Fungos associados a sementes de mamoneira cultivadas na região de Barbalha, CE, safra 2007. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: resumos. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. p. 50| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 77. | | ROCHA, M. do S.; OLIVEIRA, M. I. P. de; MEDEIROS, C.; AZEVEDO, C. F. de; BELTRÃO, N. E. de M.; CARVALHO, J. M. F. C.; ALMEIDA, F. de A. C.; NASCIMENTO, L. C.; BRUNO, R. de L. A. Fungos associados a sementes de mamoneira cultivadas na região de Barbalha, CE, safra 2007. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: anais. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 78. | | TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; CECON, P. R.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. F. e; NASCIMENTO, A. C. C.; AZEVEDO, C. F.; MARQUES, D. B. D.; SILVA, M. V. G. B.; CARNEIRO, A. P. S.; PAIXAO, D. M. Genomic prediction of lactation curves of Girolando cattle based on nonlinear mixed models. Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 1, gmr18691, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 79. | | SOUSA, I. C. de; NASCIMENTO, M.; SILVA, G. N.; NASCIMENTO, A. C. C.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. F. e; ALMEIDA, D. P. de; PESTANA, K. N.; AZEVEDO, C. F.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T. Genomic prediction of leaf rust resistance to Arabica coffee using machine learning algorithms. Scientia Agricola, v. 78, n. 4, e20200021, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 80. | | BARRETO, C. A. V.; DIAS, K. O. das G.; SOUSA, I. C. de; AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T.; PASTINA, M. M.; NASCIMENTO, M. Genomic prediction in multi-environment trials in maize using statistical and machine learning methods. Scientific Reports, v. 14, 1062, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| Registros recuperados : 90 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
17/09/2018 |
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Data da última atualização: |
17/09/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
RESENDE, R. T.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e; MELO, L. C.; PEREIRA, H. S.; SOUZA, T. L. P. O. de; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
Rafael T. Resende, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Camila F. Azevedo, UFV; Fabyano Fonseca e Silva, UFV; LEONARDO CUNHA MELO, CNPAF; HELTON SANTOS PEREIRA, CNPAF; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Genome-wide association and regional heritability mapping of plant architecture, lodging and productivity in Phaseolus vulgaris. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 8, p. 2841-2854, Aug. 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The availability of high-density molecular markers in common bean has allowed to explore the genetic basis of important complex agronomic traits with increased resolution. Genome-Wide Association Studies (GWAS) and Regional Heritability Mapping (RHM) are two analytical approaches for the detection of genetic variants. We carried out GWAS and RHM for plant architecture, lodging and productivity across two important growing environments in Brazil in a germplasm of 188 common bean varieties using DArTseq genotyping strategies. The coefficient of determination of G · E interaction (c2 int) was equal to 17, 21 and 41%, respectively for the traits architecture, lodging, and productivity. Trait heritabilities were estimated at 0.81 (architecture), 0.79 (lodging) and 0.43 (productivity), and total genomic heritability accounted for large proportions (72% to 100%) of trait heritability. At the same probability threshold, three marker?trait associations were detected using GWAS, while RHM detected eight QTL encompassing 145 markers along five chromosomes. The proportion of genomic heritability explained by RHM was considerably higher (35.48 to 58.02) than that explained by GWAS (28.39 to 30.37). In general, RHM accounted for larger fractions of the additive genetic variance being captured by markers effects inside the defined regions. Nevertheless, a considerable proportion of the heritability is still missing (42% to 64%), probably due to LD between markers and genes and/or rare allele variants not sampled. RHM in autogamous species had the potential to identify larger-effect QTL combining allelic variants that could be effectively incorporated into whole-genome prediction models and tracked through breeding generations using marker-assisted selection. MenosThe availability of high-density molecular markers in common bean has allowed to explore the genetic basis of important complex agronomic traits with increased resolution. Genome-Wide Association Studies (GWAS) and Regional Heritability Mapping (RHM) are two analytical approaches for the detection of genetic variants. We carried out GWAS and RHM for plant architecture, lodging and productivity across two important growing environments in Brazil in a germplasm of 188 common bean varieties using DArTseq genotyping strategies. The coefficient of determination of G · E interaction (c2 int) was equal to 17, 21 and 41%, respectively for the traits architecture, lodging, and productivity. Trait heritabilities were estimated at 0.81 (architecture), 0.79 (lodging) and 0.43 (productivity), and total genomic heritability accounted for large proportions (72% to 100%) of trait heritability. At the same probability threshold, three marker?trait associations were detected using GWAS, while RHM detected eight QTL encompassing 145 markers along five chromosomes. The proportion of genomic heritability explained by RHM was considerably higher (35.48 to 58.02) than that explained by GWAS (28.39 to 30.37). In general, RHM accounted for larger fractions of the additive genetic variance being captured by markers effects inside the defined regions. Nevertheless, a considerable proportion of the heritability is still missing (42% to 64%), probably due to LD between markers and genes and/or rare alle... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
DArTseq; GWAS QTL; Herdabilidade; RHM QTL. |
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Thesagro: |
Feijão; Melhoramento Genético Vegetal; Phaseolus Vulgaris. |
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Thesaurus NAL: |
Beans; Heritability; Lodging resistance; Plant architecture; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/183088/1/2018-M.Deon-G3-Genome-wide.pdf
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Marc: |
LEADER 02867naa a2200373 a 4500
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005 2018-09-17
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520 $aThe availability of high-density molecular markers in common bean has allowed to explore the genetic basis of important complex agronomic traits with increased resolution. Genome-Wide Association Studies (GWAS) and Regional Heritability Mapping (RHM) are two analytical approaches for the detection of genetic variants. We carried out GWAS and RHM for plant architecture, lodging and productivity across two important growing environments in Brazil in a germplasm of 188 common bean varieties using DArTseq genotyping strategies. The coefficient of determination of G · E interaction (c2 int) was equal to 17, 21 and 41%, respectively for the traits architecture, lodging, and productivity. Trait heritabilities were estimated at 0.81 (architecture), 0.79 (lodging) and 0.43 (productivity), and total genomic heritability accounted for large proportions (72% to 100%) of trait heritability. At the same probability threshold, three marker?trait associations were detected using GWAS, while RHM detected eight QTL encompassing 145 markers along five chromosomes. The proportion of genomic heritability explained by RHM was considerably higher (35.48 to 58.02) than that explained by GWAS (28.39 to 30.37). In general, RHM accounted for larger fractions of the additive genetic variance being captured by markers effects inside the defined regions. Nevertheless, a considerable proportion of the heritability is still missing (42% to 64%), probably due to LD between markers and genes and/or rare allele variants not sampled. RHM in autogamous species had the potential to identify larger-effect QTL combining allelic variants that could be effectively incorporated into whole-genome prediction models and tracked through breeding generations using marker-assisted selection.
650 $aBeans
650 $aHeritability
650 $aLodging resistance
650 $aPlant architecture
650 $aPlant breeding
650 $aFeijão
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653 $aGWAS QTL
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653 $aRHM QTL
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700 1 $aAZEVEDO, C. F.
700 1 $aSILVA, F. F. e
700 1 $aMELO, L. C.
700 1 $aPEREIRA, H. S.
700 1 $aSOUZA, T. L. P. O. de
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700 1 $aBRONDANI, C.
700 1 $aVIANELLO, R. P.
773 $tG3: Genes, Genomes, Genetics$gv. 8, p. 2841-2854, Aug. 2018.
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Embrapa Florestas (CNPF) |
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