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| Registros recuperados : 191 | |
| 141. |  | ALMEIDA, F. A. DE; PEREIRA, G. R. DA S.; MOTTA, I. G. B. DA; PINTO, I. S. B.; FONSECA, I.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F. Determinação das frequências alélicas e genotípicas do gene osteopontina em bovinos da raça girolando. In: Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 48., 2011, Belém. Anais...| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 142. | | MEIRA, L. H. DA R.; PAIVA, D. DE S.; SIQUEIRA, T. R. DE; FONSECA, I.; ALVINO, R. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; ARBEX, W. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B. Determinação das frequências genotípicas e alélicas do gene da Beta-Lactoglobulina em bovinos da raça Girolando. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2010. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 143. | | MEIRA, L. H. da R.; PAIVA, D. de S.; SIQUEIRA, T. R. de; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; ALVINO, R. M.; ARBEX, W. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação do polimorfismo do gene da betalactoglobulina em bovinos da raça Girolando. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 5., 2010, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 141.). p. 57-59.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 144. | | ARAUJO, I. I. M. DE; MOTTA, I. G. B. DA; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; ARBEX, W. A.; BARBOSA, S. B. P.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. Caracterização do polimorfismo dos genes CSN3 e LGB em animais da raça girolando. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 145. | | GUEDES, E.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, C.; REIS, D. R. de L.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; VERNEQUE, R. da S.; ANDRADE, L. G. DE; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. A partial genome scan study to identify loci for tick resistance in cattle. Ticks and tick-borne pathogens International Conference, 2011, Zaragoza. Proceedings... p. 148| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 146. | | BRUNELI, F. A. T.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SANTANA JUNIOR, M. L.; PEREIRA, R. J.; ARBEX, W. A.; PENNA, V. M.; ZADRA, L. E. F.; VERNEQUE, R. da S.; LÔBO, R. B.; CARVALHO, M. R. S. (ed.). National Breeding Program of Guzerá Cattle for Milk: Progeny Testing, National Zootechnical Archive and MOET Nucleus Results. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2020 102 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 251).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 147. | | BRUNELI, F. A. T.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SANTANA JÚNIOR, M. L.; PEREIRA, R. J.; ARBEX, W. A.; PENNA, V. M.; ZADRA, L. E. F.; VERNEQUE, R. da S.; LÔBO, R. B.; CARVALHO, M. R. S. (ed.). National Breeding Program of Guzerá Cattle for Milk: progeny testing, National Zootechnical Archive and MOET nucleus results. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. 92 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 258).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 148. | | PEREIRA, W. P.; PEREIRA, G. R. S.; RETTORE, J. V. P.; MOTTA, I. G. B.; ALMEIDA, F. A.; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F. Genotypic and allelic frequencies of DGAT1 gene on girolando. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 149. | | ANDRADE, L. G. DE; GUEDES, E.; ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; PANETTO, J. C. do C.; SANTOS, G. G. dos; SILVA, M. V. G. B. Genome-wide association analysis to identify loci for linear traits in gyr breed. In: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 7., 2011, Florianópolis. Resumos... Florianópolis: AB3C, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 150. | | SILVA, M. V. G. B.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; GUIMARAES, M. F. M.; ARBEX, W. A.; GUEDES, E.; VAN TASSELL, C. P.; SONSTEGARD, T. S. Genome-wide association analysis to identify loci for milk yield in Gyr breed. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 32., 2010, Edinburgh. Proceedings... Edinburgh: International Society for Animal Genetics, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 151. | | GUEDES, E.; ANDRADE, L. G. DE; ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; PANETTO, J. C. do C.; BRUNELI, F. A. T.; SILVA, M. V. G. B. Genome-wide association analysis to identify loci for production traits in gyr breed. In: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 7., 2011, Florianópolis. Resumos... Florianópolis: AB3C, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 152. | | SILVA, F. F. e; ZAMBRANO, M. F. B.; VARONA, L.; GLÓRIA, L. S.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; LÁZARO, S. F.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F. Genome association study through nonlinear mixed models revealed new candidate genes for pig growth curves. Scientia Agricola, v. 74, n. 1, 2017. 7 P.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Leite. |
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| 153. | | PINTO, I. S. B.; MOTTA, I. G. B.; PEREIRA, G. R. S.; ALMEIDA, F. A.; PEREIRA, W. P.; RETTORE, J. V. P.; FONSECA, I.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F. Evaluation of DUMPS allele incidence in girolando bulls participating on girolando prgeny test. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 154. | | ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; TAGLIATTI, R. F.; ANDRADE, L. G. DE; GUEDES, E.; MUNIZ, M. N. M.; CARVALHO, L. A. V DE. Storage as a service and utility computing for bioinformatics computing environment: aspects of cloud computing applied to scientific computing. In: ENCONTRO ACADEMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL DO LNCC, 4., 2011, Petrópolis. Resumos... [S.l.:s.n.], 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 155. | | NASCIMENTO, E. de O.; SANTOS, K. C. L. dos; SANTOS, G. B. dos; OLIVEIRA, D. R. de; SILVA, R. L. de S. da; ALMEIDA, F. N.; CARVALHO, B. C. de; ARBEX, W. A. Visão computacional aplicada à pecuária de precisão para determinação da condição corporal em bovinos. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 16., 2015, Juiz de Fora, MG Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 185.). 2 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 156. | | VERNEQUE, R. da S.; PANETTO, J. C. do C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; BRUNELI, F. A. T.; SANTOS, G. G. dos; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; REIS, D. R. de L.; GERALDO, C. C.; MACHADO, C. H. C.; VERCESI FILHO, A. E.; MACIEL, R. DA S.; FERNANDES, A. R. Programa nacional de mejoramiento de gyr lechero - Sumario brasileño de toros - Resultado de prueba de progenie - 3ª prueba de preselección de toros - Mayo 2012. Juiz de Fora: Embrapa Ganado de Leche, 2012. 70 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 156).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 157. | | PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; FERNANDES, A. R.; MARTINS, M. F.; REIS, D. R. de L.; ARBEX, W. A.; OLIVEIRA, J. C. de; VENTURA, H. T.; PEREIRA, M. A. Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro: Sumário Brasileiro de Touros - 2ª avaliação genômica de touros - resultado do teste de progênie - abril 2019. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2019. 98 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 235).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 158. | | PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; FERNANDES, A. R.; MARTINS, M. F.; REIS, D. R. de L.; ARBEX, W. A.; OLIVEIRA, J. C. de; VENTURA, H. T.; PEREIRA, M. A. Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro: Sumário Brasileiro de Touros - 3ª avaliação genômica de touros - resultado do teste de progênie - maio 2020. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2020 98 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 244).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 159. | | VERNEQUE, R. da S.; PANETTO, J. C. do C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; BRUNELI, F. A. T.; SANTOS, G. G. dos; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; REIS, D. R. de L.; GERALDO, C. C.; Machado, C. H. C.; VERCESI FILHO, A. E.; MACIEL, R. DA S.; FERNANDES, A. R. Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro - Sumário Brasileiro de Touros - Resultado do Teste de Progênie - 3ª Prova de Pré-Seleção de Touros. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012. 70 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 152).| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 160. | | VERNEQUE, R. da S.; PANETTO, J. C. do C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; BRUNELI, F. A. T.; SANTOS, G. G. dos; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; REIS, D. R. de L.; GERALDO, C. C.; Machado, C. H. C.; VERCESI FILHO, A. E.; MACIEL, R. DA S.; FERNANDES, A. R. (ed.). Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro - Sumário Brasileiro de Touros - Resultado do Teste de Progênie - 3ª Prova de Pré-Seleção de Touros. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012. 70 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 152).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Unidades Centrais. |
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| Registros recuperados : 191 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
05/11/2021 |
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Data da última atualização: |
29/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; OLIVEIRA, F. S. de; SANTOS, F. G. dos; ARAÚJO, F. M. G.; SALIM, A. C. de M.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; PIRES, D. E. V.; CARVALHO, M. R. S. |
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Afiliação: |
CAROLINA GUIMARÃES RAMOS MATOSINHO, Universidade Federal de Minas Gerais; IZINARA CRUZ ROSSE, Universidade Federal de Ouro Preto; PABLO AUGUSTO SOUZA FONSECA, University of Guelph; FRANCISLON SILVA DE OLIVEIRA, Fiocruz; FAUSTO GONÇALVES DOS SANTOS, Fiocruz; FLÁVIO MARCOS GOMES ARAÚJO, Fiocruz; ANNA CHRISTINA DE MATOS SALIM, Fiocruz; BEATRIZ CORDENONSI LOPES, Epamig; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; RUI DA SILVA VERNEQUE, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; GUILHERME OLIVEIRA, Instituto Tecnológico Vale; DOUGLAS EDUARDO VALENTE PIRES, University of Melbourne; MARIA RAQUEL SANTOS CARVALHO, Universidade Federal de Minas Gerais. |
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Título: |
Identifcation and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 6, 524, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11250-021-02970-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Whole genome sequencing of bovine breeds has allowed identifcation of genetic variants in milk protein genes. However, functional repercussion of such variants at a molecular level has seldom been investigated. Here, the results of a multistep Bioinformatic analysis for functional characterization of recently identifed genetic variants in Brazilian Gyr and Guzerat breeds is described, including predicted efects on the following: (i) evolutionary conserved nucleotide positions/regions; (ii) protein function, stability, and interactions; (iii) splicing, branching, and miRNA binding sites; (iv) promoters and transcription factor binding sites; and (v) collocation with QTL. Seventy-one genetic variants were identifed in the caseins (CSN1S1, CSN2, CSN1S2, and CSN3), LALBA, LGB, and LTF genes. Eleven potentially regulatory variants and two missense mutations were identifed. LALBA Ile60Val was predicted to afect protein stability and fexibility, by reducing the number the disulfde bonds established. LTF Thr546Asn is predicted to generate steric clashes, which could mildly afect iron coordination. In addition, LALBA Ile60Val and LTF Thr546Asn afect exonic splicing enhancers and silencers. Consequently, both mutations have the potential of afecting immune response at individual level, not only in the mammary gland. Although laborious, this multistep procedure for classifying variants allowed the identifcation of potentially functional variants for milk protein genes. |
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Palavras-Chave: |
In silico variant analysis. |
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Thesagro: |
Bovino; Caseína; Leite; Proteína. |
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Thesaurus NAL: |
Casein; Cattle; Lactoferrin; Milk proteins. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02787naa a2200433 a 4500
001 2135816
005 2021-12-29
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11250-021-02970-2$2DOI
100 1 $aMATOSINHO, C. G. R.
245 $aIdentifcation and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr.$h[electronic resource]
260 $c2021
520 $aWhole genome sequencing of bovine breeds has allowed identifcation of genetic variants in milk protein genes. However, functional repercussion of such variants at a molecular level has seldom been investigated. Here, the results of a multistep Bioinformatic analysis for functional characterization of recently identifed genetic variants in Brazilian Gyr and Guzerat breeds is described, including predicted efects on the following: (i) evolutionary conserved nucleotide positions/regions; (ii) protein function, stability, and interactions; (iii) splicing, branching, and miRNA binding sites; (iv) promoters and transcription factor binding sites; and (v) collocation with QTL. Seventy-one genetic variants were identifed in the caseins (CSN1S1, CSN2, CSN1S2, and CSN3), LALBA, LGB, and LTF genes. Eleven potentially regulatory variants and two missense mutations were identifed. LALBA Ile60Val was predicted to afect protein stability and fexibility, by reducing the number the disulfde bonds established. LTF Thr546Asn is predicted to generate steric clashes, which could mildly afect iron coordination. In addition, LALBA Ile60Val and LTF Thr546Asn afect exonic splicing enhancers and silencers. Consequently, both mutations have the potential of afecting immune response at individual level, not only in the mammary gland. Although laborious, this multistep procedure for classifying variants allowed the identifcation of potentially functional variants for milk protein genes.
650 $aCasein
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773 $tTropical Animal Health and Production$gv. 53, n. 6, 524, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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