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| Registros recuperados : 191 | |
| 101. |  | ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. DOS; ALMEIDA, F. N.; GUEDES, E.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. Mais um pouco de matemática e computação como recursos de pesquisa e desenvolvimento da pecuária. O Girolando, v. 15, n. 89, p. 24-27, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 103. | | UTSUNOMIYA, A. H.; SILVA, M. V. G. B.; ABREU, D. J. DE; ALMEIDA, D. C. DE; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A. A realidade da genômica no agronegócio do leite brasileiro. Revista Leite Integral, n. 51, p. 76-82, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 104. | | GOMES, J.; ESTEVES, I.; GRACIANO NETO, V. V.; DAVID, J. M. N.; BRAGA, R.; ARBEX, W. A.; KASSAB, M.; OLIVEIRA, R. F. de. A scientific software ecosystem architecture for the livestock domain. Information and Software Technology, v. 160, 107240, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 105. | | ARBEX, W. A.; TAGLIATTI, R. F.; ANDRADE, L. G. D.; MUNIZ, M. N. M.; GUEDES, E.; SILVA, M. V. G. B. Storage as a service and cloud computing for bioinformatics computing environment. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 106. | | UTSYNOMIYA, A. T. H.; SANTOS, D. J. DE A. DOS; ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; VERNEQUE, R. da S.; SILVA, M. V. G. B. Tamanho efetivo de população em diferentes raças zebuínas e uma população F2. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 107. | | ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; PEREIRA, L. G. R.; GUEDES, E.; ANDRADE, L. G. DE; SILVA, M. V. G. B. Tá quente? Muito! Essa fornada de aquecimento global está quase pronta. O Girolando, v. 15, n. 86, p. 24-28, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 108. | | CARVALHO, V. P.; SANT'ANNA, I. C.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; CRUZ, C. D.; ARBEX, W. A.; OLIVEIRA, F. C.; SILVA, F. F. Support vector machines applied to the genetic classification problem of hybrid populations with high degrees of similarity. Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 4, gmr18122, 2018. 10 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 109. | | GUEDES, E.; ANDRADE, L. G. D.; MUNIZ, M. N. M.; TAGLIATTI, R. F.; ARBEX, W. A.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B. Selection of single mucleotide polymorphisms for using in paternity analysis in zebu breeds. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 110. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; RODRIGUES, W. B. R. Usando a ciência como ferramenta para a escolha de reprodutores. Girolando, v. 15, n. 87, p. 18-21, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 111. | | ARBEX, W. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; FONSECA, I.; PAIVA, D. de S.; ANDRADE, L. G. de; TAGLIATTI, R. F. A utilização da informática na agropecuária e o impacto da bioinformática no melhoramento genético animal. O Girolando, Uberaba, v. 11, n. 71, p. 32-34, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 112. | | SANTOS, K. C. L. dos; NASCIMENTO, E. O.; SANTOS, G. B.; OLIVEIRA, D. R.; SILVA, R. L. S.; CARVALHO, B. C. de; ARBEX, W. A. Visão Computacional Aplicada à Pecuária de Precisão para Determinação da Escore Corporal em Bovinos. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 13., 2015, Porto Alegre. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. 4 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 114. | | MEIRA, L. H. da R.; PAIVA, D. de S.; SIQUEIRA, T. R. de; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; ALVINO, R. M.; ARBEX, W. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação do polimorfismo do gene da betalactoglobulina em bovinos da raça Girolando. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 5., 2010, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 141.). p. 57-59.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 115. | | ARAUJO, I. I. M. DE; MOTTA, I. G. B. DA; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; ARBEX, W. A.; BARBOSA, S. B. P.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. Caracterização do polimorfismo dos genes CSN3 e LGB em animais da raça girolando. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 116. | | MARTINS, M. F.; MENDONÇA, J. F. M. de; FONSECA, I.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; ARBEX, W. A.; PANETTO, J. C. do C.; VERNEQUE, R. da S. Gir Leiteiro e Girolando: a busca por animais mais resistentes que produzam leite de melhor qualidade. Informe Agropecuário, v. 36, n. 286, p. 108-113, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 117. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; PANETTO, J. C. do C.; COSTA, C. N.; CARVALHO, B. C. de. Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - July/2013. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2013. 48 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 164)| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 118. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; PANETTO, J. C. do C.; CARVALHO, B. C. de; ALVES, B. R. C. Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - July/2014. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2014 48 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 171)| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 119. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; ARBEX, W. A.; ALVES, B. R. C.; PANETTO, J. C. do C.; CARVALHO, B. C. de. Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - July/2015. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015 56 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 180)| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 120. | | PEREIRA, W. P.; PEREIRA, G. R. S.; RETTORE, J. V. P.; MOTTA, I. G. B.; ALMEIDA, F. A.; FONSECA, I.; PINTO, I. S. B.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F. Genotypic and allelic frequencies of DGAT1 gene on girolando. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 191 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
17/05/2017 |
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Data da última atualização: |
27/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
SILVA, F. F. e; ZAMBRANO, M. F. B.; VARONA, L.; GLÓRIA, L. S.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; LÁZARO, S. F.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
Fabyano Fonseca e Silva, UFV/VIÇOSA; Maria Fernanda Betancur Zambrano, UFV/VIÇOSA; Luis Varona, University of Zaragoza; Leonardo Siqueira Glória, UFV/VIÇOSA; Paulo Sávio Lopes, UFV; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; Sirlene Fernandes Lázaro, UFV/VIÇOSA; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Simone Eliza Facioni Guimarães, UFV/VIÇOSA. |
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Título: |
Genome association study through nonlinear mixed models revealed new candidate genes for pig growth curves. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, v. 74, n. 1, 2017. |
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Páginas: |
7 P. |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
Genome association analyses have been successful in identifying quantitative trait
loci (QTLs) for pig body weights measured at a single age. However, when considering the whole
weight trajectories over time in the context of genome association analyses, it is important to
look at the markers that affect growth curve parameters. The easiest way to consider them is
via the two-step method, in which the growth curve parameters and marker effects are estimated
separately, thereby resulting in a reduction of the statistical power and the precision of
estimates. One efficient solution is to adopt nonlinear mixed models (NMM), which enables a joint
modeling of the individual growth curves and marker effects. Our aim was to propose a genome
association analysis for growth curves in pigs based on NMM as well as to compare it with the
traditional two-step method. In addition, we also aimed to identify the nearest candidate genes
related to significant SNP (single nucleotide polymorphism) markers. The NMM presented a
higher number of significant SNPs for adult weight (A) and maturity rate (K), and provided a direct
way to test SNP significance simultaneously for both the A and K parameters. Furthermore, all
significant SNPs from the two-step method were also reported in the NMM analysis. The ontology
of the three candidate genes (SH3BGRL2, MAPK14, and MYL9) derived from significant SNPs
(simultaneously affecting A and K) allows us to make inferences with regards to their contribution
to the pig growth process in the population studied. MenosGenome association analyses have been successful in identifying quantitative trait
loci (QTLs) for pig body weights measured at a single age. However, when considering the whole
weight trajectories over time in the context of genome association analyses, it is important to
look at the markers that affect growth curve parameters. The easiest way to consider them is
via the two-step method, in which the growth curve parameters and marker effects are estimated
separately, thereby resulting in a reduction of the statistical power and the precision of
estimates. One efficient solution is to adopt nonlinear mixed models (NMM), which enables a joint
modeling of the individual growth curves and marker effects. Our aim was to propose a genome
association analysis for growth curves in pigs based on NMM as well as to compare it with the
traditional two-step method. In addition, we also aimed to identify the nearest candidate genes
related to significant SNP (single nucleotide polymorphism) markers. The NMM presented a
higher number of significant SNPs for adult weight (A) and maturity rate (K), and provided a direct
way to test SNP significance simultaneously for both the A and K parameters. Furthermore, all
significant SNPs from the two-step method were also reported in the NMM analysis. The ontology
of the three candidate genes (SH3BGRL2, MAPK14, and MYL9) derived from significant SNPs
(simultaneously affecting A and K) allows us to make inferences with regards to their contribution
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Palavras-Chave: |
Longitudinal data; SNP markers. |
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Thesaurus NAL: |
body weight. |
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Categoria do assunto: |
--
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161512/1/Cnpgl-2017-SciAgric-Silva-Genome.pdf
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Marc: |
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520 $aGenome association analyses have been successful in identifying quantitative trait loci (QTLs) for pig body weights measured at a single age. However, when considering the whole weight trajectories over time in the context of genome association analyses, it is important to look at the markers that affect growth curve parameters. The easiest way to consider them is via the two-step method, in which the growth curve parameters and marker effects are estimated separately, thereby resulting in a reduction of the statistical power and the precision of estimates. One efficient solution is to adopt nonlinear mixed models (NMM), which enables a joint modeling of the individual growth curves and marker effects. Our aim was to propose a genome association analysis for growth curves in pigs based on NMM as well as to compare it with the traditional two-step method. In addition, we also aimed to identify the nearest candidate genes related to significant SNP (single nucleotide polymorphism) markers. The NMM presented a higher number of significant SNPs for adult weight (A) and maturity rate (K), and provided a direct way to test SNP significance simultaneously for both the A and K parameters. Furthermore, all significant SNPs from the two-step method were also reported in the NMM analysis. The ontology of the three candidate genes (SH3BGRL2, MAPK14, and MYL9) derived from significant SNPs (simultaneously affecting A and K) allows us to make inferences with regards to their contribution to the pig growth process in the population studied.
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Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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