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| Registros recuperados : 168 | |
| 101. |  | MATOS, G. F. de; ROUWS, J. R. C.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium isolates from sugarcane roots form a new fhylogenetic group with potential for the development of inoculants In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. 308 p. Editado por Mariangle Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho. RELAR 2016. p. 133| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 102. | | MATOS, G. F. de; ZILLI, J. E.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium isolates from sugarcane roots represent a nex phylogenetic group with potential for the development fo inoculants. In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION WITH NON-LEGUMES, 15.; SYMPOSIUM OF THE EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 12., 2016, Hungary. Book of abstracts. Hungary: Biological Research Center, 2016. P. 38| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 103. | | ROUWS, L. F. M.; FISCHER, D.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHMID, M.; SCHLOTER, M.; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; HARTMANN, A. Bradyrhizobium spp. are part of the nitrogen-fixing bacterial community associated with the field grown sugar cane Seropédica/ Rio de Janeiro, Brasil. EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 10., 2012, Munich. Abstract.... Munich: German Research Center for Environmental Health, 2012. 72 p. PP3-30| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 104. | | DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; ROUWS, L. F. M.; ZILLI, J. E.; PARMA, M. M.; MELO, I. S. de; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium stylosanthis sp. nov., comprising nitrogen-fixing symbionts isolated from nodules of the tropical forage legume Stylosanthes spp. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 66, n. 8, p. 3078-3087, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 105. | | PASSOS, S. R.; CORREIA, M. E. F.; SOARES, L. H. de B.; ARAUJO, J. L. S. de; RUMJANEK, N. G.; XAVIER, G. R. Bioprospecção de microorganismo com capacidade celulolítica no trato intestinal do diplópode trrigoniuulus corallinus In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25.,2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009. 01 p. 01 de 01| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 106. | | CARVALHO, P. A.; MENESES, C. H. S. G.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. An eglA-like gene mutant of Gluconaceto bacter diazotrophicus PAL5 is defective in rice roots surfae attachment. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. SlV. 14| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 107. | | SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I. Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 2010-2011, Apr./Jun. 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 108. | | BALDANI, J. I.; CRUZ, L. M.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. O.; FARINELLI. Draft genome sequente of six endophytic nittrogen-fixing bacteria with potential biofertilizer application in non-leguminous plants. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. Slll. 05| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 109. | | CORREIA, M. E. F.; PASSOS, S. R.; SOARES, L. H. de B.; ARAÚJO, J. L. S. de; MARTINS, C. M.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G. Ecologia da interação entre fauna do solo e microrganismos no processo de decomposição de resíduos vegetais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32.; 2 a 7 da agosto de 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bionergia: perspectivas e desafios: trabalhos científicos.... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2009. 21p| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 110. | | VIDEIRA, S. S.; OLIVEIRA, D. M. de; BARROS, D. R.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, V. L. D. Diversidade morfológica de bactérias diazotróficas oriundas de plantas de capim-elefante no Estado do rio de Janeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 111. | | BOA SORTE, P. M. F.; ARAUJO, J. L. S. de; MELO, L. V. de; GALISA, P. de S.; LEAL, L.; BALDANI, J. I.; BALDANI, V. L. D. Develpment of a real-time PCR assay for the detection and quantification on Gluconacetobacter diazotrophicus in sugarcane grown under field conditions. African Journal of Microbiology Research, v. 8, n. 31, p. 2937-2946, july, 2014| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 112. | | SILVA, P. R. A.; VIDAL, M. S.; POLESE, V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; ARAUJO, J. L. S. de; SOUZA, E. M.; BALDANI, J. I. Differential gene expression of diazotrophic burkholderia tropica PPE5 strain cultivated in sugarcane apoplast fluid In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 113. | | ALVES, G. C.; GALISA, P. S.; MACEDO, A. V. de M.; SANTOS, C. L. R. dos; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Differentially expressed genes in two maize genotypes inoculanted with herbaspirillum seropedicae In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. SlV. 07| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 115. | | GALVÃO, P. Q.; RODRIGUES, E. P.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Analysis of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 nitB mutant. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. SI 13| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 116. | | GALISA, P. S.; ALVES, G. C.; FERREIRA, V. L.; GONÇALO, T. P.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de. Avaliação do efeito do caldo de cana-de-açúcar no perfil de expressão Gênica da bactéria gluconacetobacter diazotrophicus In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25.,2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009. 01 p. 01 de 01| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 117. | | CORDEIRO, T. F.; GALVÃO, P. G.; GUEDES, H.; MENESES, C. H. G.; VIDAL, M. S.; ARAÚJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. Avaliação da expressão gênica em Gluconacetobacter diazotrophicus durante a interação com cana-de-açúcar. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009. 6| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 118. | | NETA, L. C. P.; ALVES, C. A.; MOREIRA, L. L. Q.; GIORI, F. G.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M. Avaliação da interação da cultivar PF990283 de trigo com a estirpe Sp 245 de Azospirillum brasilense. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 119. | | VILLA, J. C.; ZOFFOLI, B. C.; PITARD, R. M.; ARAUJO, J. L. S. de; SOUZA FILHO, B. F.; ARAUJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Caracterização de isolados indígenas de rizóbio visando a seleção de estirpes eficientes e adaptados a área de cultivo tradicional de feijoeiro no Estado do Rio de Janeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 120. | | FERREIRA, V. de L.; GALISA, P. de S.; SCHWAB, S.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de. Caracterização da função de MatE em Gluconacetobacter diazotrophicus. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| Registros recuperados : 168 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
20/10/2023 |
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Data da última atualização: |
20/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. |
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Afiliação: |
CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO DA SILVA, UFRRJ; EDEVALDO DE CASTRO MONTEIRO, UFRRJ; PRISCILA PEREIRA DINIZ, UFRRJ; LEONARDO ARAUJO TERRA, UFRRJ; STEFAN SCHWAB, CNPAB; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; SEGUNDO SACRAMENTO U CABALLERO, CNPAB. |
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Título: |
Designing and validation of specific primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology,, Published: 16 October 2023 |
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ISSN: |
1678-4405 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Endophytic diazotrophic plant growth-promoting bacteria Herbaspirillum rubrisubalbicans (HCC103), Herbaspirillum seropedicae (HRC54), Paraburkholderia tropica (Ppe8 T ), Gluconacetobacter diazotrophicus (Pal5 T ), and Nitrospirillum amazonense (CBAmC) have been used as inoculants for sugarcane. The genome sequences of these strains were used to design a set of specific primers for the real-time PCR (qPCR) assay. Primer specificity was confirmed by conventional PCR using the genomic DNAs of 25 related bacterial species and the five target strains. The qPCR assays were conducted using root and shoot samples from two sugarcane varieties (RB867515 and RB92579). These samples were collected both with and without inoculation, using the target strains specified in this study. The sugarcane plants were grown in a greenhouse, utilizing a substrate composed of sterile sand and vermiculite in a 2:1 ratio, for a duration of 55 days. The primers designed for this study successfully amplified target DNA fragments from each of the bacterial species, enabling their differentiation at the species level. The total bacterial population present in the sugarcane quantified using qPCR was on average 105.2 cells g−1 of fresh tissue. Across both evaluated varieties, it was observed that the population of inoculated bacteria tended to decrease over time and became more concentrated in the sugarcane roots compared to the aerial parts. The qPCR results suggest that both the host and the microbes influence the endophytic population and the bacterial number decreases with plant age MenosEndophytic diazotrophic plant growth-promoting bacteria Herbaspirillum rubrisubalbicans (HCC103), Herbaspirillum seropedicae (HRC54), Paraburkholderia tropica (Ppe8 T ), Gluconacetobacter diazotrophicus (Pal5 T ), and Nitrospirillum amazonense (CBAmC) have been used as inoculants for sugarcane. The genome sequences of these strains were used to design a set of specific primers for the real-time PCR (qPCR) assay. Primer specificity was confirmed by conventional PCR using the genomic DNAs of 25 related bacterial species and the five target strains. The qPCR assays were conducted using root and shoot samples from two sugarcane varieties (RB867515 and RB92579). These samples were collected both with and without inoculation, using the target strains specified in this study. The sugarcane plants were grown in a greenhouse, utilizing a substrate composed of sterile sand and vermiculite in a 2:1 ratio, for a duration of 55 days. The primers designed for this study successfully amplified target DNA fragments from each of the bacterial species, enabling their differentiation at the species level. The total bacterial population present in the sugarcane quantified using qPCR was on average 105.2 cells g−1 of fresh tissue. Across both evaluated varieties, it was observed that the population of inoculated bacteria tended to decrease over time and became more concentrated in the sugarcane roots compared to the aerial parts. The qPCR results suggest that both the host and the microbes... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diazotrophic bacteria; DPGPB quantification; Primers; Real Time PCR. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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700 1 $aMONTEIRO, E. de C.
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700 1 $aARAUJO, J. L. S. de
700 1 $aURQUIAGA, S.
773 $tBrazilian Journal of Microbiology,, Published: 16 October 2023
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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