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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E. Análise dos transcriptomas de Paspalum notatum Flüggé e Paspalum vaginatum Swartz em condições de déficit hídrico. 2020, 69 f. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular), Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2020. Co-orientadora: Dra. Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste.

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2.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MATTA, F. de P.; VIGNA, B. B. Z. Certificação da obtenção de híbridos de Paspalum spp. da safra 2014/2015 com o uso de marcadores microssatélites. In: SILVA, W. T. L. da et al. (Ed.). Anais da 8ª Jornada Científica Embrapa São Carlos. Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p. 34. (Embrapa Instrumentação; Documentos, 61)

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3.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MATTA, F. de P.; FAVERO, A. P.; GUSMAO, M. R.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de híbridos de Paspalum spp. e certificação da hibridação com marcadores microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Anais... Curitiba: Expo Unimed, 2016. p. 500.

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4.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MATTA, F. de P.; FAVERO, A. P.; GUSMAO, M. R.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de híbridos de Paspalum spp. e certificação da hibridação com marcadores SSR e ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu, PR. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 624.

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5.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of Paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 14., 2018, São Pedro. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2018. p. 210. X-meeting 2018.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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6.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 10., 2015, São Pedro, SP. Proceedings...São Pedro, SP: Meeting, 2018. p. 210. p. 210

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7.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; VIGNA, B. B. Z.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; MUDADU, M. de A.; RIOS, E.; FAVERO, A. P. A chromosome scale genome assembly of pensacola bahiagrass (paspalum notatum cv. pensacola) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste.

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8.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de dados de transcriptoma de Paspalum submetido à seca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 39. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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9.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de dados de transcriptoma de Paspalum submetido à seca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p.39. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.

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10.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 65., 2019, Águas de Lindóia. Edição de genes e genomas. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. p. 198. E-book. Genética 2019.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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11.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 65., 2019, Águas de Lindóia. Edição de genes e genomas. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. p. 198. E-book. Genética 2019.

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12.Imagem marcado/desmarcadoVIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE, 2019, Lake Buena Vista. A global vision for innovation: abstract book. Gainesville: University of Florida, 2019. p. 129. Na publicação: M.A. Mudadu. IFTBC 2019.

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13.Imagem marcado/desmarcadoVIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE - a global vision for innovation, 2019, Lake Buena Vista, USA. Proceedings... Lake Buena Vista, USA: IFTBC, 2019.

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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  20/12/2023
Data da última atualização:  21/12/2023
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  ARAKAKI, J. E.; VIGNA, B. B. Z.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; MUDADU, M. de A.; RIOS, E.; FAVERO, A. P.
Afiliação:  JOYCE ETSUKO ARAKAKI; BIANCA BACCILI ZANOTTO VIGNA, CPPSE; MARCO AURÉLIO CALDAS DE PINHO PESSO, CPAC; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; ESTEBAN RIOS; ALESSANDRA PEREIRA FAVERO, CPPSE.
Título:  A chromosome scale genome assembly of pensacola bahiagrass (paspalum notatum cv. pensacola)
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The development of new, cost-effective sequencing technologies, along with user-friendly computational tools, facilitates genomic studies of non-model species. Paspalum notatum is an important forage and turfgrass worldwide. Pensacola is a diploid (2n=20) cultivar with haploid genome size of 600Mb, estimated by flow cytometry. Pensacola is native to Argentina and has long narrow leaves, early flowering and cold tolerance. It is related to five ('Tiphi1', 'Tiphi 2', 'UF-Riata', 'Tifton 9' and 'Tifquick') of the 17 released cultivars and the most adopted cultivar in Southeastern Florida and South of Brazil, indicating its agro-economic importance. Here, we present a chromosome-scale genome assembly of Paspalum notatum cv. Pensacola. To obtain the PacBio HiFi sequences, Pensacola seeds were germinated and grown in a greenhouse at the University of Florida, and high molecular weight DNA extraction was performed from leaf tissue. PacBio HiFi sequencing was performed in a Sequel II system at Maryland Genomics, using one SMRT cell 8M in Circular Consensus Sequencing mode (CCS) with 30h of sequencing time.
Palavras-Chave:  Genomic selection; Montagem de genoma; Pensacola.
Thesagro:  Capim Pensacola; Gramínea Forrageira; Paspalum Notatum.
Thesaurus NAL:  Genome; Genome assembly.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1160082/1/Resumo-Biotecnologia-e-genomica-2023.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA21928 - 1UPCRA - DD
CPAC37683 - 1UPCRA - DD
CPPSE26264 - 1UPCRA - DDPROCI-2023.00122ARA2023.00295
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