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| Registros recuperados : 13 | |
| 4. |  | ARAKAKI, J. E.; MATTA, F. de P.; FAVERO, A. P.; GUSMAO, M. R.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de híbridos de Paspalum spp. e certificação da hibridação com marcadores SSR e ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu, PR. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 624.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 5. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of Paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 14., 2018, São Pedro. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2018. p. 210. X-meeting 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 6. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 10., 2015, São Pedro, SP. Proceedings...São Pedro, SP: Meeting, 2018. p. 210. p. 210| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 7. | | ARAKAKI, J. E.; VIGNA, B. B. Z.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; MUDADU, M. de A.; RIOS, E.; FAVERO, A. P. A chromosome scale genome assembly of pensacola bahiagrass (paspalum notatum cv. pensacola) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 8. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de dados de transcriptoma de Paspalum submetido à seca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 39. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 9. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de dados de transcriptoma de Paspalum submetido à seca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p.39. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 65., 2019, Águas de Lindóia. Edição de genes e genomas. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. p. 198. E-book. Genética 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 11. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 65., 2019, Águas de Lindóia. Edição de genes e genomas. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. p. 198. E-book. Genética 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 12. | | VIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE, 2019, Lake Buena Vista. A global vision for innovation: abstract book. Gainesville: University of Florida, 2019. p. 129. Na publicação: M.A. Mudadu. IFTBC 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 13. | | VIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE - a global vision for innovation, 2019, Lake Buena Vista, USA. Proceedings... Lake Buena Vista, USA: IFTBC, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 13 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
03/12/2020 |
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Data da última atualização: |
03/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
ARAKAKI, J. E. |
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Afiliação: |
JOYCE ETSUKO ARAKAKI, UFSCAR. |
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Título: |
Análise dos transcriptomas de Paspalum notatum Flüggé e Paspalum vaginatum Swartz em condições de déficit hídrico. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
2020, 69 f. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular), Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2020. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Co-orientadora: Dra. Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Conteúdo: |
A seca é um dos estresses abióticos que mais afetam o crescimento e produtividade de plantas. Espécies do gênero Paspalum L. são utilizadas com sucesso em pastagens e gramados, sendo que alguns ecótipos de Paspalum notatum (grama-batatais) possuem boa qualidade de forragem, e de Paspalum vaginatum (capim-arame-da-praia; grama-rasteira-da-praia), alta tolerância à salinidade. Além disso, já foi descrito o potencial de resistência à seca de ambas as espécies, tornando-as interessantes para estudos de transcriptoma sob déficit hídrico. O objetivo do projeto é avaliar o perfil de expressão gênica de dois genótipos de Paspalum em resposta ao déficit hídrico. Dois genótipos (P. vaginatum Swartz BGP 114 e P. notatum Flüggé BGP 216) com diferentes estratégias de resistência à seca foram selecionados a partir de avaliação fisiológica prévia de cinco acessos de Paspalum (P. indecorum Mez BGP 24, P. notatum Flüggé BGP 216, P. vaginatum Swartz BGP 114, P. modestum Mez BGP 23 e BGP 32) em resposta ao déficir hídrico. Amostras de folhas em duas condições hídricas foram coletadas: sem estresse hídrico (umidade relativa do solo 28%) e com umidade do solo a 6% alcançada após cinco dias de estresse hídrico para P. notatum e oito dias para P. vaginatum. Foram extraídos os RNAs das amostras e preparadas as bibliotecas de cDNA, as quais foram sequenciadas em plataforma Illumina HiSeq 2500. Análises de bioinformática foram realizadas para: caracterizar a qualidade da montagem de novo dos transcriptomas; analisar a expressão gênica diferencial entre plantas com e sem estresse hídrico e realizar a anotação funcional dos genes e vias metabólicas. As expressões gênicas encontradas in sílico foram validadas via PCR em tempo real. A partir das análises fisiológicas e moleculares foi possível identificar que os genótipos combinam diferentes estratégias para resistir a seca, sendo que as estratégias de desidratação de retardo e de tolerância foram encontradas em ambos os acessos. O enriquecimento de termos de ontologia gênica possibilitou a identificação de estratégias específicas de cada genótipo, como a desidratação de escape para P. vaginatum e dormência para P. notatum. A caracterização e classificação desses acessos quanto às suas estratégias de tolerância ao estresse hídrico e o melhor entendimento dos mecanismos moleculares e fisiológicos envolvidos poderão contribuir para a identificação de genes de interesse visando a edição gênica com o objetivo de desenvolver gramíneas estresse-tolerantes mais bem adaptadas aos diferentes cenários e mudanças climáticas. MenosA seca é um dos estresses abióticos que mais afetam o crescimento e produtividade de plantas. Espécies do gênero Paspalum L. são utilizadas com sucesso em pastagens e gramados, sendo que alguns ecótipos de Paspalum notatum (grama-batatais) possuem boa qualidade de forragem, e de Paspalum vaginatum (capim-arame-da-praia; grama-rasteira-da-praia), alta tolerância à salinidade. Além disso, já foi descrito o potencial de resistência à seca de ambas as espécies, tornando-as interessantes para estudos de transcriptoma sob déficit hídrico. O objetivo do projeto é avaliar o perfil de expressão gênica de dois genótipos de Paspalum em resposta ao déficit hídrico. Dois genótipos (P. vaginatum Swartz BGP 114 e P. notatum Flüggé BGP 216) com diferentes estratégias de resistência à seca foram selecionados a partir de avaliação fisiológica prévia de cinco acessos de Paspalum (P. indecorum Mez BGP 24, P. notatum Flüggé BGP 216, P. vaginatum Swartz BGP 114, P. modestum Mez BGP 23 e BGP 32) em resposta ao déficir hídrico. Amostras de folhas em duas condições hídricas foram coletadas: sem estresse hídrico (umidade relativa do solo 28%) e com umidade do solo a 6% alcançada após cinco dias de estresse hídrico para P. notatum e oito dias para P. vaginatum. Foram extraídos os RNAs das amostras e preparadas as bibliotecas de cDNA, as quais foram sequenciadas em plataforma Illumina HiSeq 2500. Análises de bioinformática foram realizadas para: caracterizar a qualidade da montagem de novo dos transcri... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica diferencial; RNA seq. |
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Thesagro: |
Desidratação; Seca. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aA seca é um dos estresses abióticos que mais afetam o crescimento e produtividade de plantas. Espécies do gênero Paspalum L. são utilizadas com sucesso em pastagens e gramados, sendo que alguns ecótipos de Paspalum notatum (grama-batatais) possuem boa qualidade de forragem, e de Paspalum vaginatum (capim-arame-da-praia; grama-rasteira-da-praia), alta tolerância à salinidade. Além disso, já foi descrito o potencial de resistência à seca de ambas as espécies, tornando-as interessantes para estudos de transcriptoma sob déficit hídrico. O objetivo do projeto é avaliar o perfil de expressão gênica de dois genótipos de Paspalum em resposta ao déficit hídrico. Dois genótipos (P. vaginatum Swartz BGP 114 e P. notatum Flüggé BGP 216) com diferentes estratégias de resistência à seca foram selecionados a partir de avaliação fisiológica prévia de cinco acessos de Paspalum (P. indecorum Mez BGP 24, P. notatum Flüggé BGP 216, P. vaginatum Swartz BGP 114, P. modestum Mez BGP 23 e BGP 32) em resposta ao déficir hídrico. Amostras de folhas em duas condições hídricas foram coletadas: sem estresse hídrico (umidade relativa do solo 28%) e com umidade do solo a 6% alcançada após cinco dias de estresse hídrico para P. notatum e oito dias para P. vaginatum. Foram extraídos os RNAs das amostras e preparadas as bibliotecas de cDNA, as quais foram sequenciadas em plataforma Illumina HiSeq 2500. Análises de bioinformática foram realizadas para: caracterizar a qualidade da montagem de novo dos transcriptomas; analisar a expressão gênica diferencial entre plantas com e sem estresse hídrico e realizar a anotação funcional dos genes e vias metabólicas. As expressões gênicas encontradas in sílico foram validadas via PCR em tempo real. A partir das análises fisiológicas e moleculares foi possível identificar que os genótipos combinam diferentes estratégias para resistir a seca, sendo que as estratégias de desidratação de retardo e de tolerância foram encontradas em ambos os acessos. O enriquecimento de termos de ontologia gênica possibilitou a identificação de estratégias específicas de cada genótipo, como a desidratação de escape para P. vaginatum e dormência para P. notatum. A caracterização e classificação desses acessos quanto às suas estratégias de tolerância ao estresse hídrico e o melhor entendimento dos mecanismos moleculares e fisiológicos envolvidos poderão contribuir para a identificação de genes de interesse visando a edição gênica com o objetivo de desenvolver gramíneas estresse-tolerantes mais bem adaptadas aos diferentes cenários e mudanças climáticas.
650 $aDesidratação
650 $aSeca
653 $aExpressão gênica diferencial
653 $aRNA seq
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