Data/hora: 09/06/2024 13:35:45

Biblioteca(s): 	Embrapa Pecuária Sudeste.	
Data corrente: 	03/12/2020	
Data da última atualização: 	03/12/2020	
Autoria: 	ARAKAKI, J. E.	
Afiliação: 	JOYCE ETSUKO ARAKAKI, UFSCAR.	
Título: 	Análise dos transcriptomas de Paspalum notatum Flüggé e Paspalum vaginatum Swartz em condições de déficit hídrico.	
Ano de publicação: 	2020	
Fonte/Imprenta: 	2020, 69 f. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular), Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2020.	
Idioma: 	Português	
Notas: 	Co-orientadora: Dra. Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste.	
Conteúdo: 	A seca é um dos estresses abióticos que mais afetam o crescimento e produtividade de plantas. Espécies do gênero Paspalum L. são utilizadas com sucesso em pastagens e gramados, sendo que alguns ecótipos de Paspalum notatum (grama-batatais) possuem boa qualidade de forragem, e de Paspalum vaginatum (capim-arame-da-praia; grama-rasteira-da-praia), alta tolerância à salinidade. Além disso, já foi descrito o potencial de resistência à seca de ambas as espécies, tornando-as interessantes para estudos de transcriptoma sob déficit hídrico. O objetivo do projeto é avaliar o perfil de expressão gênica de dois genótipos de Paspalum em resposta ao déficit hídrico. Dois genótipos (P. vaginatum Swartz BGP 114 e P. notatum Flüggé BGP 216) com diferentes estratégias de resistência à seca foram selecionados a partir de avaliação fisiológica prévia de cinco acessos de Paspalum (P. indecorum Mez BGP 24, P. notatum Flüggé BGP 216, P. vaginatum Swartz BGP 114, P. modestum Mez BGP 23 e BGP 32) em resposta ao déficir hídrico. Amostras de folhas em duas condições hídricas foram coletadas: sem estresse hídrico (umidade relativa do solo 28%) e com umidade do solo a 6% alcançada após cinco dias de estresse hídrico para P. notatum e oito dias para P. vaginatum. Foram extraídos os RNAs das amostras e preparadas as bibliotecas de cDNA, as quais foram sequenciadas em plataforma Illumina HiSeq 2500. Análises de bioinformática foram realizadas para: caracterizar a qualidade da montagem de novo dos transcriptomas; analisar a expressão gênica diferencial entre plantas com e sem estresse hídrico e realizar a anotação funcional dos genes e vias metabólicas. As expressões gênicas encontradas in sílico foram validadas via PCR em tempo real. A partir das análises fisiológicas e moleculares foi possível identificar que os genótipos combinam diferentes estratégias para resistir a seca, sendo que as estratégias de desidratação de retardo e de tolerância foram encontradas em ambos os acessos. O enriquecimento de termos de ontologia gênica possibilitou a identificação de estratégias específicas de cada genótipo, como a desidratação de escape para P. vaginatum e dormência para P. notatum. A caracterização e classificação desses acessos quanto às suas estratégias de tolerância ao estresse hídrico e o melhor entendimento dos mecanismos moleculares e fisiológicos envolvidos poderão contribuir para a identificação de genes de interesse visando a edição gênica com o objetivo de desenvolver gramíneas estresse-tolerantes mais bem adaptadas aos diferentes cenários e mudanças climáticas.	
Palavras-Chave: 	Expressão gênica diferencial; RNA seq.	
Thesagro: 	Desidratação; Seca.	
Categoria do assunto: 	G Melhoramento Genético	
Registro original: 	Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)	
Exemplares: 	CPPSE - (25193-1) - UMT - TS - DD - PROCI-2020.00106 - ARA - 2020.00157 - DIS