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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
20/04/2006 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINALIA, T.; BEZERRA, G. B. P.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; THIAGO QUINALIA; GEORGE B. P. BEZERRA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
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Título: |
2D maps of protein interface surfaces. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 1. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-meeting 2005. Presented posters. |
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Conteúdo: |
More than 50% of the Protein Data Bank - PDB - files have two or more chains. It is desirable to get a better understanding of how the protein complexes are gathered together. Although, surface complementarity is a key factor in complexes formation, physical-chemical properties also play an important role. Recently, the protein interface surfaces were rendered in 3D, and, over them, all the STING_DB physical-chemical properties could be painted, what greatly facilitated their analyses. In this work we propose an alternative way to visualize the protein interfaces. The 3D protein interface surfaces were modeled as Graphs and using the Shape Preserving algorithm, they were mapped onto the plane. This mapping introduce some inevitable deformation, nevertheless the local shape is preserved which is essential in the process of matching the corresponding regions in both surfaces. This matching task is almost impossible in 3D due the surface complexity in the space. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Interface de superfícies; Mapa bidimensional. |
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Thesagro: |
Mapa; Proteína. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aMore than 50% of the Protein Data Bank - PDB - files have two or more chains. It is desirable to get a better understanding of how the protein complexes are gathered together. Although, surface complementarity is a key factor in complexes formation, physical-chemical properties also play an important role. Recently, the protein interface surfaces were rendered in 3D, and, over them, all the STING_DB physical-chemical properties could be painted, what greatly facilitated their analyses. In this work we propose an alternative way to visualize the protein interfaces. The 3D protein interface surfaces were modeled as Graphs and using the Shape Preserving algorithm, they were mapped onto the plane. This mapping introduce some inevitable deformation, nevertheless the local shape is preserved which is essential in the process of matching the corresponding regions in both surfaces. This matching task is almost impossible in 3D due the surface complexity in the space.
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700 1 $aNESHICH, G.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
10/08/2009 |
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Data da última atualização: |
23/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
NICKEL, O.; SILVA, S. W.; FAJARDO, T. V. M.; GIACOMINI, R.; ARAGAO, F. J. L. |
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Afiliação: |
OSMAR NICKEL, CNPUV; S. W. SILVA, UERGS; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; R. GIACOMINI, Unisinos; FRANCISCO JOSE LIMA ARAGAO, CENARGEN. |
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Título: |
Detecção e caracterização molecular do gene da proteína capsidial de apple mosaic virus em macieiras. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S267, 2009. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo 900. |
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Conteúdo: |
o Apple mosaic virus (ApMV, lIarvirus, Bromoviridae) causa severos danos à qualidade e à produção em macieiras de até 40% segundo a cultivar, especialmente em infecções mistas com vírus latentes. Seus sintomas podem ser fracos ou imperceptíveis. |
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Palavras-Chave: |
Apple mosaic; Caracterização molecular; Doença d eplanta; Identificação genética; Proteína capsidial. |
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Thesagro: |
Fruticultura; Maçã; Vírus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/203571/1/11533-2009-p.-S267.pdf
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Marc: |
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260 $aTropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S267$c2009
500 $aResumo 900.
520 $ao Apple mosaic virus (ApMV, lIarvirus, Bromoviridae) causa severos danos à qualidade e à produção em macieiras de até 40% segundo a cultivar, especialmente em infecções mistas com vírus latentes. Seus sintomas podem ser fracos ou imperceptíveis.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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