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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
11/05/2021 |
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Data da última atualização: |
11/05/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SERIBELLI, A. A.; SILVA, P. da; CRUZ, M. F. da; ALMEIDA, F. de; FRAZÃO, M. R.; MEDEIROS, M. I. C.; RODRIGUES, D. dos P.; KICH, J. D.; BENEVIDES, L. de J.; SOARES, S. de C.; ALLARD, M. W.; FALCÃO, J. P. |
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Afiliação: |
AMANDA APARECIDA SERIBELLI, USP; PATRICK DA SILVA, UNESP; MARCELO FERREIRA DA CRUZ, USP; FERNANDA DE ALMEIDA, USP; MILIANE RODRIGUES FRAZÃO, USP; MARTA I. C. MEDEIROS, Instituto Adolfo Lutz; DÁLIA DOS PRAZERES RODRIGUES, FIOCRUZ; JALUSA DEON KICH, CNPSA; LEANDRO DE JESUS BENEVIDES, UFTM; SIOMAR DE C. SOARES, UFTM; MARC WILLIAN ALLARD, Food and Drug Administration; JULIANA PFRIMER FALCÃO, USP. |
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Título: |
Insights about the epidemiology of Salmonella typhimurium isolates from different sources in Brazil using comparative genomics. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Gut Pathogens, v. 13, n. 27, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s13099-021-00423-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) is an important zoonotic agent worldwide. The aim of this work was to compare genetically 117 S. Typhimurium isolated from different sources over 30 years in Brazil using different genomics strategies. Results: The majority of the 117 S. Typhimurium strains studied were grouped into a single cluster (≅ 90%) by the core genome multilocus sequence typing and (≅ 77%) by single copy marker genes. The phylogenetic analysis based on single nucleotide polymorphism (SNP) grouped most strains from humans into a single cluster (≅ 93%), while the strains isolated from food and swine were alocated into three clusters. The different orthologous protein clusters found for some S. Typhimurium isolated from humans and food are involved in metabolic and regulatory processes. For 26 isolates from swine the sequence types (ST) 19 and ST1921 were the most prevalent ones, and the ST14, ST64, ST516 and ST639 were also detected. Previous results typed the 91 S. Typhimurium isolates from humans and foods as ST19, ST313, ST1921, ST3343 and ST1649. The main prophages detected were: Gifsy-2 in 79 (67.5%) and Gifsy-1 in 63 (54%) strains. All of the S. Typhimurium isolates contained the acrA, acrB, macA, macB, mdtK, emrA, emrB, emrR and tolC efflux pump genes. Conclusions: The phylogenetic trees grouped the majority of the S. Typhimurium isolates from humans into a single cluster suggesting that there is one prevalent subtype in Brazil. Regarding strains isolated from food and swine, the SNPs’ results suggested the circulation of more than one subtype over 30 years in this country. The orthologous protein clusters analysis revealed unique genes in the strains studied mainly related to bacterial metabolism. S. Typhimurium strains from swine showed greater diversity of STs and prophages in comparison to strains isolated from humans and foods. The pathogenic potential of S. Typhimurium strains was corroborated by the presence of exclusive prophages of this serovar involved in its virulence. The high number of resistance genes related to efflux pumps is worrying and may lead to therapeutic failures when clinical treatment is needed. MenosAbstract Background: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) is an important zoonotic agent worldwide. The aim of this work was to compare genetically 117 S. Typhimurium isolated from different sources over 30 years in Brazil using different genomics strategies. Results: The majority of the 117 S. Typhimurium strains studied were grouped into a single cluster (≅ 90%) by the core genome multilocus sequence typing and (≅ 77%) by single copy marker genes. The phylogenetic analysis based on single nucleotide polymorphism (SNP) grouped most strains from humans into a single cluster (≅ 93%), while the strains isolated from food and swine were alocated into three clusters. The different orthologous protein clusters found for some S. Typhimurium isolated from humans and food are involved in metabolic and regulatory processes. For 26 isolates from swine the sequence types (ST) 19 and ST1921 were the most prevalent ones, and the ST14, ST64, ST516 and ST639 were also detected. Previous results typed the 91 S. Typhimurium isolates from humans and foods as ST19, ST313, ST1921, ST3343 and ST1649. The main prophages detected were: Gifsy-2 in 79 (67.5%) and Gifsy-1 in 63 (54%) strains. All of the S. Typhimurium isolates contained the acrA, acrB, macA, macB, mdtK, emrA, emrB, emrR and tolC efflux pump genes. Conclusions: The phylogenetic trees grouped the majority of the S. Typhimurium isolates from humans into a single cluster suggesting that there is one pr... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Aglomerados ortólogos de proteínas; Árvores filogenéticas; Bombas de efluxo; Efflux pumps; Phylogenetic trees; Profagos; Prophages; Protein orthologous clusters. |
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Thesagro: |
Salmonella Typhimurium. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 23 | |
| 1. |  | CRUZ, J. L.; GALVÃO, T. D. L.; LOPES, F. F.; SILVA, T. M. da; PEIXOTO JÚNIOR, E. E.; ANDRADE, P. R. O. de. Alguns benefícios decorrentes da implantação do sistema de produção integrada de mamão na Bahia. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 685-687.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|   |
| 3. | | CRUZ, J. L.; PEIXOTO JÚNIOR, E. E. P.; SILVA, T. M. da; GALVÃO, T. D. L.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O. de. Certificação de áreas de mamão em produção integrada de frutas. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 688-690.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 4. | | NORONHA, A. C. da S.; SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; OLIVEIRA, A. M. G. Procedimentos para o monitoramento e níveis de controle de ácaros em mamoeiro sob sistema de produção integrada. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE ACAROLOGIA, 2., 2008, Poços de Caldas. Anais... Poços de Caldas: SIBAC, 2008. p. 120.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 5. | | SANCHES, N. F.; SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; OLIVEIRA, A. A. R.; SANTOS, M. J.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O. Ocorrência de ataque do mandarová Erinnyis ello em mamoeiro na Fazenda Palmeiras, Município de Porto Seguro-BA: estudo de caso. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 502-503.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 6. | | OLIVEIRA, A. A. R.; SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; NORONHA, A. C. da S.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; OLIVEIRA, A. M. G. Monitoramento de doenças como fator de redução do uso de fungicidas no controle da pinta-preta (Asperisporium caricae) do mamoeiro. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Disponível em:<https://intranet.embrapa.br/acl_users/credentials_cookie_auth/require_login?came_from=https%3A//intranet.embrapa.br> Acesso em: 21 fev. 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 7. | | OLIVEIRA, A. A. R.; SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; CRUZ, J. L.; OLIVEIRA, A. M. G.; ANDRADE, P. R. O. de; LOPES, F. F. Monitoramento da pinta preta do mamoeiro no município de Itamaraju, BA, com ênfase na produção integrada. In:SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 4., 2009, VITÓRIA-ES. Pesquisa científica e a crise no mercado do mamão: anais... Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; OLIVEIRA, A. M. G.; ANDRADE, P. R. O. de; LOPES, F. F. Manejo integrado de pragas e doenças do mamoeiro com base em resultados de monitoramento. In: SIMPÓSIO SOBRE MANEJO DE PRAGAS, 1., 2009, Belém, PA. Manejo integrado de pragas, doenças e plantas daninhas em grãos e fruteiras: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | SANTOS FILHO, H. P.; SOUZA, J. da S.; OLIVEIRA, A. A. R.; SANCHES, N. F.; CARDOSO, C. E. L.; OLIVEIRA, A. M. G.; ANDRADE, P. R. O.; LOPES, F. F. Avaliação econômica do controle de pragas do mamoeiro cultivado em sistemas de produção integrada e convencional. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 5., 2011, Porto Seguro. Inovação e sustentabilidade: anais. Porto Seguro: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2011. 1 CD-ROM. PDF. T46.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 10. | | NORONHA, A. C. da S.; SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; OLIVEIRA, A. M. G. de; BOAVENTURA, V. de J.; OLIVEIRA, V. de S.; SANTOS, M. de J. Ácaros associados à cultura do mamoeiro em áreas monitoradas no sul da Bahia. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 538-540.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 11. | | SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; CRUZ, J. L.; ANDRADE, P. R. O. de; LOPES, F. F.; OLIVEIRA, A. M. G.; SILVA, J. S. da. Efeito da cobertura vegetal sobre a incidência de pragas na cultura do mamoeiro (Carica papaya L.). In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 2464| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 12. | | SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; OLIVEIRA, A. A. R.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. M. G.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; SOUZA, J. A.; SIRTOLI, M. C.; SANTOS, M. de J. Pragas e seus inimigos naturais na cultura do mamoeiro: procedimentos de monitoramento e níveis de controle. Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2007. 1 CD-ROM (Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Circular técnica, 86).| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 13. | | SANTOS FILHO, H. P.; OLIVEIRA, A. A. R.; NORONHA, A. C. da S.; SANCHES, N. F.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; OSÓRIO, A. C. B.; SOUZA, J. A. de; OLIVEIRA, A. M. G.; SANTOS, M. de J. Monitoramento e controle da pinta preta do mamoeiro Asperisporium caricae (Sepeg.) Maubl. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 472-475.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 15. | | SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; OLIVEIRA, A. A. R.; SANCHES, N. F.; CARDOSO, C. E. L.; CRUZ, J. L.; OLIVEIRA, A. M. G.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O. Monitoramento de pragas e doenças do mamoeiro e seu impacto na redução do uso de agrotóxicos. In:SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 4., 2009, VITÓRIA-ES. Pesquisa científica e a crise no mercado do mamão: anais... Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. Palestra| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 17. | | OLIVEIRA, A. A. R.; OLIVEIRA, A. M. G.; OLIVEIRA, E. J. de; LOPES, F. F.; SANTOS FILHO, H. P.; CRUZ, J. L.; NASCIMENTO, J. M. O. do; SILVA, J. S. da; SANCHES, N. F.; ANDRADE, P. R. O. de. Monitoramentos de pragas do mamoeiro realizados em 2009 no Estado da Bahia. Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. 37 p. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 196).| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; SOUZA, J. A. de; SANTOS, M. de J.; OSÓRIO, A. C. B.; OLIVEIRA, A. M. G. Níveis de ação para o controle de pragas em mamoeiro. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 445-447.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 20. | | SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; OLIVEIRA, A. M. G. de; ANDRADE, P. R. O. de; LOPES, F. F. Manejo integrado de pragas e doenças do mamoeiro com base em resultados de monitoramento. In: SIMPÓSIO SOBRE MANEJO DE PRAGAS, 1., 2009, Belém, PA. Manejo integrado de pragas, doenças e plantas daninhas em grãos e fruteiras: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM. Editores técnicos: Alessandra Keiko Nakasone, Aloyséia Cristina da Silva Noronha, Luiz Sebastião Poltronieri.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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