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| Registros recuperados : 390 | |
| 281. |  | VALERIANO, J. C.; LIMA, E. A. de; AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. de A.; CARNEIRO, W. W. de J.; MATTOS, N. G.; CARNEIRO, R. M. D. G.; ANDRADE, A. C. Expressão alelo específica em Coffea canephora associados à resistência a nematoides. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 282. | | VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; ELBELT, S.; RAMOS, H. J. de O.; MONTAGNON, C.; VIEIRA, L. G. E.; LEROY, T.; POT, D.; SILVA, V. A.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Expressão do gene RBCS1 em café: Coffea ortólogos, Coffea arabica homeólogos e variabilidade de expressão entre genótipos e sob estresse hídrico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 283. | | ALEKCEVETCH, J. C.; CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, E. C. da S.; GUERRA, A. F.; BARTHOLO, G. F.; FERRAO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Estudo da diversidade genética de uma população de Coffea canephora VAR. Conilon por meio de marcadores moleculares do tipo SSR. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 284. | | BARROS, L. M. G.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; SANTOS, D. B. M.; ABREU, M. S.; MARRACCINI, P.; SILVA, F. R. da; RODRIGUES, G. C.; EIRA, M. T. S.; ALMEIDA, J. D. de; ANDRADE, A. C.; CARNEIRO, M. Studies of a new lipid transfer protein (LTP) expressed during coffee fruit development. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 27.; CONGRESS OF THE PAN-AMERICAN ASSOCIATION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2008, Águas de Lindóia. Program and index... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 37º Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 285. | | CARDOSO, J. M. dos S.; ANDRADE, A. C.; MAGALHAES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; VIEIRA, J. S.; FOGACA, F. H. dos S.; MEHL, H. U.; COSTA, N. de L. Avaliação de fontes e doses de nitrogênio na produtividade do capim-marandu. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes. Areia: SNPA; Cruz das Almas UFRB, 2014. p. 287-289.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba. |
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| 286. | | CARDOSO, J. M. dos S.; ANDRADE, A. C.; MAGALHÃES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; VIEIRA, J. S.; FOGAÇA, F. H. dos S.; MEHL, H. U.; COSTA, N. de L. Avaliação de fontes e doses de nitrogênio na produtividade do capim-marandu. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes; trabalhos apresentados. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 f.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 287. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRAO, M. A. G.; SILVA, V. A.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Análises da expressão gênica por PCR quantitativo em tempo real (QPCR) de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 288. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRAO, M. A. G.; SILVA, V. A.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Análises da expressão gênica por PCR quantitativo em tempo real (QPCR) de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 289. | | LIMA, E. A. de; CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, E. C. S.; COSTA, T. S.; COTTA, M. G.; JORGE JÚNIOR, A.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, R. M. D. G.; ANDRADE, A. C. Caracterização molecular e seleção de genes candidatos à resistência do clone 14 de Coffea canephora CONILON A Meloidogyne paranaensis. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 290. | | MARTINS, M. T. B.; SOUZA, A. P. de; ARENQUE, B.; GOULART, M. de O.; MURAD, A. M.; ANDRADE, A. C.; QUIRINO, B. F.; BUCKERIDGE, M. S.; MOLINARI, H. B. C. Characterization of Saccharum spp. L. cell-wall at different stages of leaf senescence. In: SUGARCANE BREEDING AND GERMPLASM WORKSHOP, 9., 2009, Cairns. [Abstracts...] [S.l.]: International Society of Sugar Cane Technologists, 2009. p. 12.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 291. | | COSTA, C. A. A.; ANDRADE, A. C.; MAGALHÃES, J. A.; MEHL, H. U.; RODRIGUES, B. H. N.; SILVA, E. M. da; BITENCOURT, A. B.; SANTOS, F. J. de S. Características agronômicas dos capins Digitária sp. e Cynodon dactylon cv. Tifton 85 sob diferentes alturas de resíduo. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012. p. 1-3.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba. |
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| 292. | | COSTA, C. A. A.; ANDRADE, A. C.; MAGALHAES, J. A.; MEHL, H. U.; RODRIGUES, B. H. N.; SILVA, E. M. da; BITENCOURT, A. B.; SANTOS, F. J. de S. Características agronômicas dos capins Digitária sp. e Cynodon dactylon cv. Tifton 85 sob diferentes alturas de resíduo. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012. p. 1-3.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 293. | | COSTA, C. A. A.; ANDRADE, A. C.; MAGALHAES, J. A.; MEHL, H. U.; RODRIGUES, B. H. N.; SILVA, E. M. da; BITENCOURT, A. B.; SANTOS, F. J. de S.; COSTA, N. de L. Características agronômicas dos capins Digitaria sp. e Cynodon dactylon cv. Tifton-85 sob diferentes alturas de resíduo. PUBVET, Londrina, v. 7, n. 5, Ed. 228, Art. 1509, mar. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 294. | | COSTA, C. A. A.; ANDRADE, A. C.; MAGALHÃES, J. A.; MEHL, H. U.; RODRIGUES, B. H. N.; SILVA, E. M. da; BITENCOURT, A. B.; SANTOS, F. J. de S.; COSTA, N. de L. Características agronômicas dos capins Digitaria sp. e Cynodon dactylon cv. Tifton-85 sob diferentes alturas de resíduo. PUBVET, Londrina, v. 7, n. 5, Ed. 228, Art. 1509, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba. |
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| 295. | | SILVA, E. M. da; ANDRADE, A. C.; MAGALHAES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; OLIVEIRA, A. B. B.; SANTOS, F. J. de S.; COSTA, N. de L.; BEZERRA, E. E. A. Características morfogênicas da Brachiaria brizantha cv. Marandu submetida a doses de nitrogênio. PubVet, Maringá, v. 9, n. 6, p. 262-270, jun. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 296. | | SILVA, E. M. da; ANDRADE, A. C.; MAGALHÃES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; OLIVEIRA, A. B. B.; SANTOS, F. J. de S.; COSTA, N. de L.; BEZERRA, E. E. A. Características morfogênicas da Brachiaria brizantha cv. Marandu submetida a doses de nitrogênio. Maringá, v. 9, n. 6, p. 262-270, jun. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba. |
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| 297. | | SILVA, E. M. da; ANDRADE, A. C.; MAGALHAES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; OLIVEIRA, A. B. B.; SANTOS, F. J. de S.; COSTA, N. de L.; BEZERRA, E. E. A. Características morfogênicas e estruturais da Brachiaria brizantha submetida a cinco doses de nitrogênio. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes. Areia: SNPA; Cruz das Almas UFRB, 2014. p. 293-295.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba. |
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| 298. | | SILVA, E. M. da; ANDRADE, A. C.; MAGALHÃES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; OLIVEIRA, A. B. B.; SANTOS, F. J. S.; COSTA, N. de L.; BEZERRA, E. E. A. Características morfogênicas e estruturais da Brachiaria brizantha submetida a cinco doses de nitrogênio. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes; trabalhos apresentados. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 f.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 299. | | MAGALHAES, J. A.; CARNEIRO, M. S. de S.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, E. S.; ANDRADE, A. P. de; BAKKE, O. A.; RODRIGUES, B. H. N.; MOCHEL FILHO, W. de J. E.; COSTA, N. de L. Características morfogênicas e estruturais do capim-andropogon sob irrigação e adubação. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 34, n. 5, p. 2427-2436, set./out. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 300. | | MAGALHÃES, J. A.; CARNEIRO, M. S. de S.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, E. S.; ANDRADE, A. P. de; BAKKE, O. A.; RODRIGUES, B. H. N.; MOCHEL FILHO, W. de J. E.; COSTA, N. de L. Características morfogênicas e estruturais do capim-andropogon sob irrigação e adubação. Semina: ciências agrárias, v. 34, n. 5, p. 2427-2436, set./out. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba. |
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| Registros recuperados : 390 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
18/02/2011 |
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Data da última atualização: |
28/02/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
VIDAL, R. O.; MONDEGO, J. M. C.; POT, D.; AMBRÓSIO, A. B.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G. |
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Afiliação: |
RAMON OLIVEIRA VIDAL, UNICAMP/Instituto de Biologia; JORGE MAURÍCIO COSTA MONDEGO, Instituto Agronômico de Campinas; DAVID POT, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement; ALINNE BATISTA AMBRÓSIO, UNICAMP/Instituto de Biologia; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; CARLOS AUGUSTO COLOMBO, Instituto Agronômico de Campinas; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, Instituo Agronômico do Pará; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP/Instituto de Biologia; GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNICAMP/Instituto de Biologia. |
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Título: |
A high-throughput data mining of single nucleotide polymorphisms in Coffea species expresed sequence tags suggests differential homeologous gene expression in the allotetrapoloid Coffea arabica. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
PLANT PHYSIOLOGY, v. 154, p. 1053-1066. 2010. |
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Páginas: |
1053-1066 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Polyploidization constitutes a common mode of evolution in flowering plants. This event provides the raw material for the divergence of function in homeologous genes, leading to phenotypic novelty that can contribute to the success of polyploids in nature or their selection for use in agriculture. Mounting evidence underlined the existence of homeologous expression biases in polyploid genomes; however, strategies to analyze such transcriptome regulation remained scarce. Important factors regarding homeologous expression biases remain to be explored, such as whether this phenomenon influences specific genes, how paralogs are affected by genome doubling, and what is the importance of the variability of homeologous expression bias to genotype differences. This study reports the expressed sequence tag assembly of the allopolyploid Coffea arabica and one of its direct ancestors, Coffea canephora. The assembly was used for the discovery of single nucleotide polymorphisms through the identification of high-quality discrepancies in overlapped expressed sequence tags and for gene expression information indirectly estimated by the transcript redundancy. Sequence diversity profiles were evaluated within C. arabica (Ca) and C. canephora (Cc) and used to deduce the transcript contribution of the Coffea eugenioides (Ce) ancestor. The assignment of the C. arabica haplotypes to the C. canephora (CaCc) or C. eugenioides (CaCe) ancestral genomes allowed us to analyze gene expression contributions of each subgenome in C. arabica. In silico data were validated by the quantitative polymerase chain reaction and allele-specific combination TaqMAMA-based method. The presence of differential expression of C. arabica homeologous genes and its implications in coffee gene expression, ontology, and physiology are discussed. MenosPolyploidization constitutes a common mode of evolution in flowering plants. This event provides the raw material for the divergence of function in homeologous genes, leading to phenotypic novelty that can contribute to the success of polyploids in nature or their selection for use in agriculture. Mounting evidence underlined the existence of homeologous expression biases in polyploid genomes; however, strategies to analyze such transcriptome regulation remained scarce. Important factors regarding homeologous expression biases remain to be explored, such as whether this phenomenon influences specific genes, how paralogs are affected by genome doubling, and what is the importance of the variability of homeologous expression bias to genotype differences. This study reports the expressed sequence tag assembly of the allopolyploid Coffea arabica and one of its direct ancestors, Coffea canephora. The assembly was used for the discovery of single nucleotide polymorphisms through the identification of high-quality discrepancies in overlapped expressed sequence tags and for gene expression information indirectly estimated by the transcript redundancy. Sequence diversity profiles were evaluated within C. arabica (Ca) and C. canephora (Cc) and used to deduce the transcript contribution of the Coffea eugenioides (Ce) ancestor. The assignment of the C. arabica haplotypes to the C. canephora (CaCc) or C. eugenioides (CaCe) ancestral genomes allowed us to analyze gene expression contribut... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/29342/1/A-high-throughput.pdf
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Marc: |
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520 $aPolyploidization constitutes a common mode of evolution in flowering plants. This event provides the raw material for the divergence of function in homeologous genes, leading to phenotypic novelty that can contribute to the success of polyploids in nature or their selection for use in agriculture. Mounting evidence underlined the existence of homeologous expression biases in polyploid genomes; however, strategies to analyze such transcriptome regulation remained scarce. Important factors regarding homeologous expression biases remain to be explored, such as whether this phenomenon influences specific genes, how paralogs are affected by genome doubling, and what is the importance of the variability of homeologous expression bias to genotype differences. This study reports the expressed sequence tag assembly of the allopolyploid Coffea arabica and one of its direct ancestors, Coffea canephora. The assembly was used for the discovery of single nucleotide polymorphisms through the identification of high-quality discrepancies in overlapped expressed sequence tags and for gene expression information indirectly estimated by the transcript redundancy. Sequence diversity profiles were evaluated within C. arabica (Ca) and C. canephora (Cc) and used to deduce the transcript contribution of the Coffea eugenioides (Ce) ancestor. The assignment of the C. arabica haplotypes to the C. canephora (CaCc) or C. eugenioides (CaCe) ancestral genomes allowed us to analyze gene expression contributions of each subgenome in C. arabica. In silico data were validated by the quantitative polymerase chain reaction and allele-specific combination TaqMAMA-based method. The presence of differential expression of C. arabica homeologous genes and its implications in coffee gene expression, ontology, and physiology are discussed.
650 $aCoffea Arábica
700 1 $aMONDEGO, J. M. C.
700 1 $aPOT, D.
700 1 $aAMBRÓSIO, A. B.
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700 1 $aCOLOMBO, C. A.
700 1 $aVIEIRA, L. G. E.
700 1 $aCARAZZOLLE, M. F.
700 1 $aPEREIRA, G. A. G.
773 $tPLANT PHYSIOLOGY$gv. 154, p. 1053-1066. 2010.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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