| |
|
|
| Registros recuperados : 70 | |
| 21. |  | BORBA, R. S. de; ZAWADZKI, C. H.; OLIVEIRA, C.; PERDICES, A.; PARISE-MALTEMPI, P. P.; ALVES, A. L. Phylogeography of Hypostomus strigaticeps (Siluriformes: Loricariidae) inferred by mitochondrial DNA reveals its distribution in the upper Paraná River basin. Neotropical Ichthyology, Porto Alegre, v. 11, n. 1, p. 111-116, jan./mar. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
|    |
| 22. | | MORO, G. V.; REZENDE, F. P.; ALVES, A. L.; HASHIMOTO, D. T.; VARELA, E. S.; TORATI, L. S. Espécies de peixe para piscicultura. In: RODRIGUES, A. P. O.; LIMA, A. F.; ALVES, A. L.; ROSA, D. K.; TORATI, L. S.; SANTOS, V. R. V. dos (Ed.). Piscicultura de água doce: multiplicando conhecimentos. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 29-70. il.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 23. | | GANECO, L. N.; LIMA, A. F.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; TORATI, L. S.; LUNDSTEDT, L. M. Desenvolvimento embrionário do híbrido "Pintado-da-amazônia" (fêmea Pseudoplatystoma punctifer x macho Leiarius marmoratus). In: CONFERÊNCIA LATINOAMERICANA SOBRE CULTIVO DE PEIXES NATIVOS, 3.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PRODUÇÃO DE PEIXES NATIVOS, 3., 2011, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2011. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 24. | | SILVA, E. L. da; PISCOR, D.; PONZETO, J. M.; CENTOFANTE, L.; ALVES, A. L.; PARISE-MALTEMPI, P. P. Cytogenetic characterisation of the ornamental freshwater fish, Piabucus melanostomus (Iguanodectinae) from Brazilian wetlands and its relation with species of Characidae basal group. Reviews in Fish Biology and Fisheries, London, v. 22, n. 2, p. 477-484, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
|  |
| 25. | | BORGES, A. S.; BARROS, B. P. de; ALVES, A. L. G.; CIARLINE, P. C.; BICUDO, P. L.; HOHAYAGAWA, A. Excreção fracionada do cálcio e fósforo em novilhas nelore antes e durante a gestação. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 5, p. 1017-1022, maio, 2000. Título em inglês: Calcium and phosphorus fractional excretion in nellore before and during pregnancy.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 26. | | KOPP, M. M.; SOUSA, S. S.; ALVES, A. L.; MARCHESE, J. A. Q.; HINDERSMANN, R. I.; FERREIRA, J. L. Evaluation of genotypes of white clover (Trifolium repens L.) in the Campanha region of Rio Grande do Sul. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas: anais. Aracaju: UFS: DZO: IF-SE, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 27. | | BORBA, R. S. de; SILVA, E. L. da; PACHECO, A. C. S.; PARISE-MALTEMPI, P. P.; ALVES, A. L. Trends in the karyotypic evolution of the Neotropical catfish family Heptapteridae Bockmann 1998 (Teleostei: Siluriformes). Reviews in Fish Biology and Fisheries, London, v. 22, n. 2, p. 509-518, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 28. | | YAMADA, A. L. M.; ALVARENGA, M. L.; BRANDÃO, J. S.; WATANABE, M. J.; RODRIGUES, C. A.; HUSSNI, C. A.; ALVES, A. L. G. Arcabouço de PRP-gel associado a células tronco mesenquimais: uso em lesões condrais em modelo experimental equino. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 36, n. 6, p. 461-467, junho. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 29. | | HINDERSMANN, R.; SOUSA, S. S.; MARCHESE, J. A.; ALVES, A. L.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P.; FERREIRA, J. L. Avaliação de linhagens de ervilhaca na Região da Campanha Gaúcha no ano de 2013. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 4., 2014, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2014. p. 32.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 30. | | GREGORI, B. de; BARBACHAN, G.; SOUSA, S. S.; MARCHESE, J. A.; HINDERSMANN, R.; ALVES, A. L.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P.; FERREIRA, J. L.; DALL'AGNOL, M. Avaliação indireta para tolerância ao pastejo em genótipos de alfafa. In: SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 3., 2013, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2013. p. 18.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 31. | | BARROSO, A. da S.; OLIVEIRA, A. da S.; ALVES, M. S. S.; VARELA, E. S.; HASHIMOTO, D. T.; ALVES, A. L. Composição da ictiofauna em canal de irrigação no Rio Caiapó, tributário do Rio Araguaia (Tocantins). Revista Integralização Universitária, Palmas, TO, v. 7, n. 9, p. 181-186, mar./set. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 32. | | LIMA, M. de L.; MADARI, B. E.; MEDEIROS, J. C.; ALVES, A. L. R.; SILVA, W. de S.; XAVIER, L. O. Condutividade hidráulica do solo num sistema de integração lavoura-pecuária. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 85. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Pôster - pós-graduação.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 33. | | BARROSO, A. da S.; SILVA, L. R.; BARROS, V. M.; OLIVEIRA, A. da S.; ALVES, M. S. S.; VARELA, E. S.; HASHIMOTO, D. T.; ALVES, A. L. Implantação do banco de DNA de peixes da Bacia Araguaia-Tocantins: aplicações na taxonomia, produção e conservação de recursos genéticos. Revista Integralização Universitária, Palmas, TO, v. 7, n. 9, p. 173-180, mar./set. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 34. | | VILLELA, L. C. V.; SCHUCH, A. C.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; KIRSCHNIK, L. N. G.; BELCHIOR, L. S.; FREITAS, L. E. L. de; MATAVELI, M. Implantação do programa de conservação de recursos genéticos de peixes nativos comerciais da Amazônia na Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 85.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 35. | | ABREU, A. de Q.; ANDRADE, C. M. S. de; FARINATTI, L. H. E.; NASCIMENTO, H. L. B. do; ALVES, A. L.; JANK, L. Características morfogênicas e estruturais de novos genótipos de Panicum maximum sob pastejo no bioma Amazônia. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM. SBZ 2012. Trabalho 4PXH.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 36. | | BARBACHAN, G.; GREGORI, B. de; SOUSA, S. S.; MARCHESE, J. A.; HINDERSMANN, R.; ALVES, A. L.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P.; FERREIRA, J. L.; DALL'AGNOL, M. Avaliação da produtividade de linhagens de alfafa em Bagé-RS. In: SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 3., 2013, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2013. p. 19.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 37. | | MARCHESE, J. A. de Q.; SOUSA, S. S.; HINDERMANN, R. I.; ALVES, A. L.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P.; FERREIRA, J. L. Avaliação da produção de forragem de trigo duplo propósito no sul do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 4., 2014, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2014. p. 21.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| 38. | | MARCHESE, J. A. de Q.; SOUSA, S. S.; HINDERMANN, R. I.; ALVES, A. L.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P.; FERREIRA, J. L. Avaliação da produção de forragem de trigo duplo propósito no sul do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 4., 2014, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2014. p. 21.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 39. | | SOUSA, S. S.; HINDERSMANN, R. I.; MARCHESE, J. A. de Q.; ALVES, A. L.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P. Avaliação da produtividade forrageira de diferentes linhagens de cornichão (Lotus corniculatus L) na região da Campanha do Rio Grande do Sul. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 23.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 16., 2014, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 40. | | CONCEIÇÃO, M. L.; ALVARENGA, M. L.; SOUZA, J. B.; MATTOS, L. H. L.; RODRIGURES, C. A.; WATANABE, J. J.; HUSSNI, C. A.; ALVES, A. L. G. Plasma rico em plaquetas: estudo comparativo entre a dupla centrifugação e o filtro E-PET (Equine Platelet Enhancement Therapy). Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 37, n. 3, p. 215-220, março 2017. Título em inglês: Comparative study of double spin and use of E-PET filter (Equine Platelet Enhancement Therapy) to obtain platelet rich plasma in horses.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| Registros recuperados : 70 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
|
Data corrente: |
18/04/2016 |
|
Data da última atualização: |
18/04/2016 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
|
Afiliação: |
FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; ANDERSON LUIS ALVES, CNPASA; NAIARA MILAGRES AUGUSTO DA SILVA, CENARGEN; PATRICIA IANELLA, CENARGEN; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN. |
|
Título: |
Genome sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. |
|
Páginas: |
Não paginado. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
PAG 2016. Pôster P0481. |
|
Conteúdo: |
The South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin with an important role in local community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate and raise the species in aquaculture systems has led to >10-fold production increases in the last decade. Current production levels are >15,000mt/year. Recently stablished initiatives to structure genetic improvement programs for increasing productivity-associated traits could greatly benefit from using genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Multiple shotgun libraries with two different insert sizes and multiple Nextera mate pair libraries with three different sizes were sequenced (2x160bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1.12pg = 1.095Gbp). Initial sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 686.171 scaffolds spanning 1.41 Gbp (N50 scaffold length: 908Kbp, L50 scaffold count: 420). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species, which will be a valuable resource for basic biology studies, and marker detection/selection for use in genetic improvement and resource conservation activities. MenosThe South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin with an important role in local community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate and raise the species in aquaculture systems has led to >10-fold production increases in the last decade. Current production levels are >15,000mt/year. Recently stablished initiatives to structure genetic improvement programs for increasing productivity-associated traits could greatly benefit from using genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Multiple shotgun libraries with two different insert sizes and multiple Nextera mate pair libraries with three different sizes were sequenced (2x160bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1.12pg = 1.095Gbp). Initial sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 686.171 scaffolds spanning 1.41 Gbp (N50 scaffold length: 908Kbp, L50 scaffold count: 420). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species, which will be a valuable resource for basic biology studies, and marker detection/selection for use in genetic improvement and resource ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Genômica; Sequenciamento de genoma. |
|
Thesagro: |
Peixe. |
|
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Genome assembly; Genomics; Sequence analysis. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/140246/1/PAG-p0481.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02509naa a2200325 a 4500
001 2043575
005 2016-04-18
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aLOBO, F. P.
245 $aGenome sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer).$h[electronic resource]
260 $c2016
300 $aNão paginado.
500 $aPAG 2016. Pôster P0481.
520 $aThe South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin with an important role in local community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate and raise the species in aquaculture systems has led to >10-fold production increases in the last decade. Current production levels are >15,000mt/year. Recently stablished initiatives to structure genetic improvement programs for increasing productivity-associated traits could greatly benefit from using genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Multiple shotgun libraries with two different insert sizes and multiple Nextera mate pair libraries with three different sizes were sequenced (2x160bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1.12pg = 1.095Gbp). Initial sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 686.171 scaffolds spanning 1.41 Gbp (N50 scaffold length: 908Kbp, L50 scaffold count: 420). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species, which will be a valuable resource for basic biology studies, and marker detection/selection for use in genetic improvement and resource conservation activities.
650 $aBioinformatics
650 $aGenome assembly
650 $aGenomics
650 $aSequence analysis
650 $aPeixe
653 $aBioinformática
653 $aGenômica
653 $aSequenciamento de genoma
700 1 $aCINTRA, L. C.
700 1 $aVARELA, E. S.
700 1 $aALVES, A. L.
700 1 $aSILVA, N. M. A. da
700 1 $aIANELLA, P.
700 1 $aPAIVA, S. R.
700 1 $aCAETANO, A. R.
773 $tIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.$gn.], 2016.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
