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| Registros recuperados : 990 | |
| 741. |  | LAVIOLA, B. G.; OLIVEIRA, A. M. C. e.; BHERING, L. L.; ALVES, A. A.; ROCHA, R. B.; GOMES, B. E. L.; CRUZ, C. D. Estimates of repeatability coefficients and selection gains in Jatropha indicate that higher cumulative genetic gains can be obtained by relaxing the degree of certainty in predicting the best families. Industrial Crops and Products, v. 51, p. 70-76, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 742. | | BRITO, T. M.; OLIVEIRA, D. de S.; ROGERIO, M. C. P.; ALVES, A. A.; MARTINS, E. C.; MIRANDA, R. C. de; MOURÃO, E. B.; CARVALHO, W. F. de. Avaliação econômica de dietas formuladas conforme o NRC (2007) com e sem restrição de energia e proteína na terminação de cordeiros em confinamento. Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 402-403, 2016. Resumo 69-1. Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 744. | | SANTOS, A. S.; OLIVEIRA, M. M de; TAVARES FILHO, L. F. de Q.; SILVEIRA, T. C da; LEDO, C. A. da S.; ALVES, A. A. C. Desenvolvimento de híbridos interespecífico de espécies silvestre de Manihot e variedades elites de mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190). 1 CD-ROM. PDF. 054.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 745. | | SILVA, S. M. S.; ALVES, A. N.; GHEYI, H. R.; BELTRAO, N. E. de M.; SEVERINO, L. S.; SOARES, F. A. L. Desenvolvimento e produção de duas cultivares de mamoneira sob estresse salino . Revista Brasileira de Engenharia Agrícola e Ambiental, v.12, n.4, p.335-342, 2008. Título em inglês: Growth and production of two cultivars of castor bean under saline stress.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 746. | | PASSOS, R. R.; VIEIRA, L. de J.; OLIVEIRA, T. da S.; SANTANA, J. R. F.; LEDO, C. A. da S.; ALVES, A. A. C.; SOUZA, F. V. D. Desidratação de grãos de pólen de diferentes subespécies de M. esculenta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 747. | | CORRÊA, V. V.; GAMA, J. R. V.; RIBEIRO, R. B. da S.; ALVES, A. F.; VIEIRA, D. dos S.; XIMENES, L. C. Estrutura e uso potencial de espécies arbóreas em floresta manejada, Pa Moju, Santarém-Pará. Cerne, Lavras, v. 21, n. 2, p. 293-300, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 748. | | ROSA, A. P. S. A. da; MARTINS, J. F. da S.; TRECHA, C. O.; GARCIA, L. P.; ALVES, A.; MANSKE, E.; GONÇALVES, V. Controle de Spodoptera frugiperda em milho com base no monitoramento de plantas atacadas e armadilhas iscadas com feromônio sexual. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. resumos... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 749. | | OSIPE, J. B.; ADEGAS, F. S.; OSIPE, R.; ALVES, A. J.; BENTO, D. C.; ROSSI, E.; PANZIERA, A. C.; SALLES JUNIOR, A. J. Controle de capim-amargoso com diferentes misturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 29., 2014, Gramado. A ciência das plantas daninhas em clima de mudança: anais. [Londrina]: SBCPD, 2014. 5 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 750. | | VELOSO JÚNIOR, R. R.; AZEVEDO, A. R. de; ARRUDA, F. de A. V.; ALVES, A. A.; CASTRO, A. R. de; ANDRADE, F. A. O. de. Consumo voluntário de dietas à base de cana-de-açúcar desidratada com diferentes níveis do feno de leucena. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 1998, Fortaleza. Anais... Fortaleza: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 1998. v. 2, p. 56.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 751. | | PEREIRA, V. L. A.; AZEVEDO, A. R. de; LIRA, M. de A.; ARRUDA, F. de A. V.; ALVES, A. A.; SILVA, V. M. da. Consumo voluntário do mulch e dos fenos de sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) inerme e com acúleos. Revista Cientifica de Producao Animal, v. 2, n. 1, p. 24-30, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 752. | | PEREIRA, V. L. A.; AZEVEDO, A. R. de; LIRA, M. de A.; ARRUDA, F. de A. V.; ALVES, A. A.; SILVA, V. M. da. Consumo voluntário do mulch e dos fenos de sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) inerme e com acúleos. Pasturas Tropicales, Cali, v. 23, n. 2, p. 16-19, ago. 2001.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 753. | | ROGÉRIO, M. C. P.; BORGES, I.; NEIVA, J. N. M.; PIMENTEL, J. C. M.; ALVES, A. A.; BARROS, N. N.; LEITE, E. R.; MARTINS, G. A. Consumo e digestibilidade aparente da matéria seca e matéria orgânica de dietas contendo diferentes níveis de subprodutos do processamento do abacaxi (Ananas comosus L.) em ovinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2003. 3 f. 1 CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 754. | | SILVA, D. C. da; ALVES, A. A.; OLIVEIRA, M. E. de; MOREIRA FILHO, M. A.; RODRIGUES, M. M.; VALE, G. E. S. do; NASCIMENTO, H. T. S. do. Consumo e digestibilidade de dietas contendo farelo de mamona destoxificado para ovinos em terminação. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, v. 12, n. 1, p. 96-106 jan./mar. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 755. | | SILVA, V. L.; ROGERIO, M. C. P.; BOMFIM, M. A. D.; LEITE, E. R.; LANDIM, A. V.; ALVES, A. A.; COSTA, H. H. A.; FREIRE, A. P. A. Consumo e digestibilidade dos nutrientes dietéticos em cordeiros de diferentes grupos genéticos alimentados com farelo de castanha de caju. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 14, n. 4, p. 695-709, out./dez., 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 756. | | LAVIOLA, B. G.; COSTA, R. D.; COSTA, J. Z.; TRENHAGO, E. D.; OLIVEIRA, F. S.; ROSADO, T. B.; ALVES, A. A.; MARANA, J. C. Crescimento, florescimento e produção de pinhão-manso no cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA EM PINHÃO-MANSO, 2., 2011, Brasília, DF. Pinhão-manso: focando em soluções sustentáveis para produção de biocombustíveis: anais. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia: ABPPM, 2011. 1 CD-ROM. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 005). Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 757. | | ALVES, A. N.; SILVA, S. M. S. e; GHEYI, H. R.; BELTRÃO, N. E. de M.; SEVERINO, L. S.; SOARES, F. A. L. Crescimento inicial e desenvolvimento de três cultivares de mamoneira sob diferentes níveis salinos da água de irrigação. In: CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 18., 2008, São Mateus. O equilíbrio do fluxo hídrico para um agricultura irrigada sustentável: anais. São Mateus: ABID, 2008. 5 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 758. | | VIEIRA, L. de J.; SANTANA, J. R. F. de; SILVEIRA, T. C. da; ALVES, A. A. C.; SOUZA, F. V. D. Conservação e longevidade de pólen de acessos de Manihot esculenta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA, 14.; FEIRA BRASILEIRA DA MANDIOCA, 1., 2011, Maceió. Mandioca: fonte de alimento e energia: anais. Maceió: ABAM: SBM, 2011. 1 CD ROM. Melhoramento genético. Resumo n. 266.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 759. | | ALVES, A. U.; PRADO, R. de M.; CORREIA, M. A. R.; GONDIM, A. R. de O.; CECÍLIO FILHO, A. B.; POLITI, L. S. Couve-flor cultivada em substrato: marcha de absorção de macronutrientes e micronutrientes. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 35, n. 1, p. 45-55, jan./fev. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 760. | | ALEKCEVETCH, J. C.; DOMICIANO, G. P; SANTOS, R. F. dos; VIEIRA, L. M.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. da; LAVIOLA, B. G.; ALVES, A. A. Correlação entre características morfológicas e fisiológicas em progênies de macaúba. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MACAÚBA, 1., 2013, Patos de Minas, MG. Consolidação da cadeia produtiva: anais. Brasília, DF: MAPA, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| Registros recuperados : 990 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
22/04/2024 |
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Data da última atualização: |
22/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
AGUIRRE, N. C.; VILLALBA, P. V.; GARCÍA, M. N.; FILIPPI, C. V.; RIVAS, J. G.; MARTÍNEZ, M. C.; ACUÑA, C. V.; LÓPEZ, A. J.; LÓPEZ, J. A.; PATHAUER, P.; PALAZZINI, D.; HARRAND, L.; OBERSCHELP, J.; MARCÓ, M. A.; CISNEROS, E. F.; CARRERAS, R.; ALVES, A. M. M.; RODRIGUES, J. C.; HOPP, H. E.; GRATTAPAGLIA, D.; CAPPA, E. P.; PANIEGO, N. B.; POLTRI, S. N. M. |
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Afiliação: |
NATALIA CRISTINA AGUIRRE, UEDD INTA-CONICET; PAMELA VICTORIA VILLALBA, UEDD INTA-CONICET; MARTÍN NAHUEL GARCÍA, UEDD INTA-CONICET; CARLA VALERIA FILIPPI, UEDD INTA-CONICET; JUAN GABRIEL RIVAS, UEDD INTA-CONICET; MARÍA CAROLINA MARTÍNEZ, UEDD INTA-CONICET; CINTIA VANESA ACUÑA, UEDD INTA-CONICET; AUGUSTO J. LÓPEZ, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; JUAN ADOLFO LÓPEZ, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; PABLO PATHAUER, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; DINO PALAZZINI, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; LEONEL HARRAND, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; JAVIER OBERSCHELP, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; MARTÍN ALBERTO MARCÓ, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; ESTEBAN FELIPE CISNEROS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE SANTIAGO DEL ESTERO (UNSE); ROCÍO CARRERAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE SANTIAGO DEL ESTERO (UNSE); ANA MARIA MARTINS ALVES, UNIVERSIDADE DE LISBOA; JOSÉ CARLOS RODRIGUES, UNIVERSIDADE DE LISBOA; H. ESTEBAN HOPP, UEDD INTA-CONICET; DARIO GRATTAPAGLIA, CENARGEN; EDUARDO PABLO CAPPA, INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA; NORMA BEATRIZ PANIEGO, UEDD INTA-CONICET; SUSANA NOEMÍ MARCUCCI POLTRI, UEDD INTA-CONICET. |
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Título: |
Comparison of ddRADseq and EUChip60K SNP genotyping systems for population genetics and genomic selection in Eucalyptus dunnii (Maiden). |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, 2024. |
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DOI: |
10.3389/fgene.2024.1361418 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Eucalyptus dunnii is one of the most important Eucalyptus species for short-fiber pulp production in regions where other species of the genus are affected by poor soil and climatic conditions. In this context, E. dunnii holds promise as a resource to address and adapt to the challenges of climate change. Despite its rapid growth and favorable wood properties for solid wood products, the advancement of its improvement remains in its early stages. In this work, we evaluated the performance of two single nucleotide polymorphism, (SNP), genotyping methods for population genetics analysis and Genomic Selection in E. dunnii. Double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq) was compared with the EUChip60K array in 308 individuals from a provenance-progeny trial. The compared SNP set included 8,011 and 19,008 informative SNPs distributed along the 11 chromosomes, respectively. Although the two datasets differed in the percentage of missing data, genome coverage, minor allele frequency and estimated genetic diversity parameters, they revealed a similar genetic structure, showing two subpopulations with little differentiation between them, and low linkage disequilibrium. GS analyses were performed for eleven traits using Genomic Best Linear Unbiased Prediction (GBLUP) and a conventional pedigree-based model (ABLUP). Regardless of the SNP dataset, the predictive ability (PA) of GBLUP was better than that of ABLUP for six traits (Cellulose content, Total and Ethanolic extractives, Total and Klason lignin content and Syringyl and Guaiacyl lignin monomer ratio). When contrasting the SNP datasets used to estimate PAs, the GBLUP-EUChip60K model gave higher and significant PA values for six traits, meanwhile, the values estimated using ddRADseq gave higher values for three other traits. The PAs correlated positively with narrow sense heritabilities, with the highest correlations shown by the ABLUP and GBLUP-EUChip60K. The two genotyping methods, ddRADseq and EUChip60K, are generally comparable for population genetics and genomic prediction, demonstrating the utility of the former when subjected to rigorous SNP filtering. The results of this study provide a basis for future whole-genome studies using ddRADseq in non-model forest species for which SNP arrays have not yet been developed. MenosEucalyptus dunnii is one of the most important Eucalyptus species for short-fiber pulp production in regions where other species of the genus are affected by poor soil and climatic conditions. In this context, E. dunnii holds promise as a resource to address and adapt to the challenges of climate change. Despite its rapid growth and favorable wood properties for solid wood products, the advancement of its improvement remains in its early stages. In this work, we evaluated the performance of two single nucleotide polymorphism, (SNP), genotyping methods for population genetics analysis and Genomic Selection in E. dunnii. Double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq) was compared with the EUChip60K array in 308 individuals from a provenance-progeny trial. The compared SNP set included 8,011 and 19,008 informative SNPs distributed along the 11 chromosomes, respectively. Although the two datasets differed in the percentage of missing data, genome coverage, minor allele frequency and estimated genetic diversity parameters, they revealed a similar genetic structure, showing two subpopulations with little differentiation between them, and low linkage disequilibrium. GS analyses were performed for eleven traits using Genomic Best Linear Unbiased Prediction (GBLUP) and a conventional pedigree-based model (ABLUP). Regardless of the SNP dataset, the predictive ability (PA) of GBLUP was better than that of ABLUP for six traits (Cellulose content, Total and Ethanolic... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
ABLUP; Double digest restriction-site associated DNA sequencing; GBLUP; Genomic prediction; Genotyping by sequencing; SNP array. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 03680naa a2200469 a 4500
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005 2024-04-22
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245 $aComparison of ddRADseq and EUChip60K SNP genotyping systems for population genetics and genomic selection in Eucalyptus dunnii (Maiden).$h[electronic resource]
260 $c2024
520 $aEucalyptus dunnii is one of the most important Eucalyptus species for short-fiber pulp production in regions where other species of the genus are affected by poor soil and climatic conditions. In this context, E. dunnii holds promise as a resource to address and adapt to the challenges of climate change. Despite its rapid growth and favorable wood properties for solid wood products, the advancement of its improvement remains in its early stages. In this work, we evaluated the performance of two single nucleotide polymorphism, (SNP), genotyping methods for population genetics analysis and Genomic Selection in E. dunnii. Double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq) was compared with the EUChip60K array in 308 individuals from a provenance-progeny trial. The compared SNP set included 8,011 and 19,008 informative SNPs distributed along the 11 chromosomes, respectively. Although the two datasets differed in the percentage of missing data, genome coverage, minor allele frequency and estimated genetic diversity parameters, they revealed a similar genetic structure, showing two subpopulations with little differentiation between them, and low linkage disequilibrium. GS analyses were performed for eleven traits using Genomic Best Linear Unbiased Prediction (GBLUP) and a conventional pedigree-based model (ABLUP). Regardless of the SNP dataset, the predictive ability (PA) of GBLUP was better than that of ABLUP for six traits (Cellulose content, Total and Ethanolic extractives, Total and Klason lignin content and Syringyl and Guaiacyl lignin monomer ratio). When contrasting the SNP datasets used to estimate PAs, the GBLUP-EUChip60K model gave higher and significant PA values for six traits, meanwhile, the values estimated using ddRADseq gave higher values for three other traits. The PAs correlated positively with narrow sense heritabilities, with the highest correlations shown by the ABLUP and GBLUP-EUChip60K. The two genotyping methods, ddRADseq and EUChip60K, are generally comparable for population genetics and genomic prediction, demonstrating the utility of the former when subjected to rigorous SNP filtering. The results of this study provide a basis for future whole-genome studies using ddRADseq in non-model forest species for which SNP arrays have not yet been developed.
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Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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