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Registros recuperados : 367 | |
121. | | MORALES, A.; PEREIRA, A. A.; CATELLI, L.; BORÉM, A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; OLIVEIRA, M. C. N. de; MICHELLE A. GRAHAM; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; ABDELNOOR, R. V. Phenolic compounds accumulation in soybean plants in response to Phakopsora pachyrhizi. In: MOLECULAR & CELLULAR BIOLOGY OF TE SOYBEAN, 14., Des Moines, 2012. [Proceedings...]. Des Moines: Iowa State University, 2012. p. 136. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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122. | | ROMERO, C. C. T.; STOLF-MOREIRA, R.; BRITO JUNIOR, S. L.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Phenotypic and molecular analysis of an incompatible interaction between soybean and the fungus Uromyces appendiculatus. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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123. | | YAMANAKA, N.; FUENTES, F. H.; GILLI, J. R.; FRANCIONI, M.; WATANABE, S.; HARADA, K.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; HOMMA, Y. Identificação de locos controladores de características quantitativas para resistência contra a síndrome da morte súbita da soja causada por Fusarium tucumaniae. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 110-111. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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124. | | SCHUSTER, I.; ABDELNOOR, R. V.; CARVALHO, V. P.; MARIM, S. S. R.; SILVA, J. F. V.; BARROS, E. G. de; MOREIRA, E. M. A. Identificacao de marcadores moleculares ligados a um QTL de efeito maior para a resistencia ao nematoide de cisto da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 1999. Londrina. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 1999. p.315. (Embrapa Soja. Documentos, 124). Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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125. | | ABDELNOOR, R. V.; SCHUSTER, I.; CARVALHO, V. P.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; KIIHL, R. A. S.; SEDIYAMA, T.; BARROS, E. G.; MOREIRA, M. A. Identificação de marcadores RAPD ligados a genes de resistência ao nematóide de cisto da soja. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 19., 1997, Jaboticabal. Ata e resumos. Londrina: Embrapa-CNPSo, 1997. p. 241-242. (Embrapa-CNPSo. Documentos, 107). Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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126. | | ABDELNOOR, R. V.; SCHUSTER, I.; CARVALHO, V. P.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; KIIHL, R. A. S.; SEDIYAMA, T.; BARROS, E. G.; MOREIRA, M. A. Identificacao de marcadores RAPD ligados a genes de resistencia ao nematoides de cisto da soja. In: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 19., 1997, Jaboticabal, SP. Ata e resumos. Jaboticabal: UNESP / [Londrina]: EMBRAPA-CNPSo, 1997. p.241-242. Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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127. | | SCHUSTER, I.; ABDELNOOR, R. V.; CARVALHO, V. P.; MARIM, S. S. R.; SILVA, J. F. V.; BARROS, E. G. de; MOREIRA, M. A. Identificacao de marcador microssatelite ligado a resistencia ao nematoide de cisto da soja. Genetics and Molecular Biology, Ribeirao Preto, v. 21, n. 3, p. 233, set. 1998. Supplement. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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128. | | YAMANAKA, N.; FUENTES, F. H.; GILLI, J. R.; WATANABE, S.; HARADA, K.; BAN, T.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; HOMMA, Y. Identification of quantitative trait loci for resistance against soybean sudden death syndrome caused by Fusarium tucumaniae. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 9, p. 1385-1391, set. 2006. Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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129. | | PINHEIRO, M.; BARROS, B. de A.; PEREIRA, R. M.; PIOVEZANI, A. R.; CAMARGO, P. O.; BRITO JÚNIOR, S. L.; ABDELNOOR, R. V. Identification of SNPs associated with loci for disease resistance response in the soybean genome. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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130. | | YAMANAKA, N.; SATO, H.; YANG, Z.; XU, D. H.; CATELLI, L. L.; BINNECK, E.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Genetic relationships between chinese, japanese, and brazilian soybean gene pools revealed by simple sequence repeat (SSR) markers. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 1, p. 85-88, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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131. | | YAMANAKA, N.; SATO, H.; YANG, Z.; XU, D. H.; CATELLI, L. L.; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Genetic relationship of three soybean germplasms revealed by SSR markers. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: SBG, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Genética e Melhoramento - Resumos: Pdf.595. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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132. | | PODANOSQUI, A. M. P.; CATELLI, L. L.; CAMPO, C. B. H.; MARCELINO-GUIMARAES, F. C.; PINTO, R. J. B.; ABDELNOOR, R. V. Gene expression analysis and phenolic accumulation in the soybean - Phakopsora pachyrhizi interaction. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 46.; REUNIÃO BRASILEIRA DE CONTROLE BIOLÓGICO, 11., 2013, Ouro Preto. [Anais...]. [Brasília]: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2013. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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133. | | DARBEN, L. M.; QI, M.; YOKOYAMA, A.; CARVALHO, M. C. C. G. de; ABDELNOOR, R. V.; WHITHAM, S. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Functional characterization of P. pachyrhizi effector candidates. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstract... Abstract: 840.pdf. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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134. | | FERREIRA, E. G. C.; PEREIRA, A. A.; CATELLI, L. L.; AOYAGI, L. N.; CARVALHO, V. P.; BELZILE, F.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Mapeamento Genético de um locus de resistência a oídio mediado por Erysiphe diffusa em soja.Genetic mapping of powdery mildew resistance locus mediated by Erysiphe diffusa in soybean. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: SBF, 2019. p. 722. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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135. | | POLIZEL, A. M. L.; BROGIN, R. L.; SILVA, D. C. G. da; YAMANAKA, N.; CATELLI, L. L.; MARIN, S. S. R.; ABDELNOOR, R. V. Mapeamento molecular de um gene de resistência à ferrugem da soja oriundo da cultivar FT-2. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: SBG, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Genética de Plantas - Resumos: Pdf. 465. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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136. | | SCHUSTER, I.; ABDELNOOR, R. V.; CARVALHO, V. P.; MARIM, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; BARROS, E. G. de; MOREIRA, E. M. A. Mapeamento de um QTL maior para a resistencia ao nematoide de cisto da soja, em uma populacao F3 de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 1999. Londrina. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 1999. p.315. (Embrapa Soja. Documentos, 124). Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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137. | | ABDELNOOR, R. V.; DIAS, W. P.; SILVA, J. F. V.; KIIHL, R. A. de S.; CARVALHO, V. P.; MARIM, S. S. R. Marcadores moleculares RAPD na caracterizacao de isolados de nematoide de cisto da soja que quebram a resistencia do cultivar Hartwig. Genetics and Molecular Biology, Ribeirao Preto, v. 21, n. 3, p. 232, set. 1998. Supplement. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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138. | | CAMOLESE, A. C.; SILVA, D. C. G. D.; NOVAES, R. M. L.; GUIMARÃES, F. C. M.; ABDELNOOR, R. V.; ARIAS, C. A. A. Marcadores SNP associados à resistência à ferrugem asiática da soja com potencial para uso na seleção assistida. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 46.; REUNIÃO BRASILEIRA DE CONTROLE BIOLÓGICO, 11., 2013, Ouro Preto. [Anais...]. [Brasília]: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2013. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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139. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Method validation for quantification of transgene copy number in soybean genome using qPCR relative quantification by 2 -^^ Ct or 2 ^ Ct formule. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 233, ref. P581. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng. Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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140. | | MAIA, M. S.; BRUMER, B. B.; NOVAES, R. M. L.; SILVA, D. C. G.; KUWAHARA, M. K.; DALCIN, M. B.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Método de extração de DNA de folhas de soja adaptado para larga escala. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 8., 2013, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2013. p. 146-151. (Embrapa Soja. Documentos, 339). Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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Registros recuperados : 367 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
21/01/2011 |
Data da última atualização: |
03/06/2011 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
BORTOLETI, K. C. A.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BELARMINO, L. C. S.; OLIVEIRA, A. R. S.; NASCIMENTO, I. R.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. |
Afiliação: |
K. C. A. BORTOLETI, Universidade Federal de Pernambuco; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; A. M. BENKO-ISEPPON, Universidade Federal de Pernambuco; L. C. S. BELARMINO, Universidade Federal de Pernambuco; A. R. S. OLIVEIRA, Universidade Federal de Pernambuco; I. R. NASCIMENTO, Universidade Federal Rural de Pernambuco; A. C. BRASILEIRO-VIDAL, Universidade Federal de Pernambuco. |
Título: |
Distribuição de microssatélites no genoma de leguminosas mediante hibridização in situ fluorescente. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... [Curitiba]: UFPR, 2010. p. 115. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Os microssatélites consistem em unidades de repetição (1 a 5pb) distribuídas em tandem, que podem estar dispersas ao longo dos genomas ou associadas a regiões heterocromáticas. Tais características têm permitido sua utilização na construção de mapas cromossômicos mediante hibridização in situ fluorescente (FISH), auxiliando no entendimento da organização genômica entre espécies proximamente relacionadas. O presente trabalho caracterizou a distribuição de oligonucleotídeos sintéticos (AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6 em Phaseolus vulgaris, P. lunatus, Vigna unguiculata, V. radiata e Glycine max, identificando marcas cromossômicas para a comparação destas leguminosas. Lâminas foram hibridizadas com sondas de oligonucleotídeos e rehibridizadas com DNAr 5S e 45S, provenientes de Lotus japonicus e Arabidopsis thaliana, respectivamente. Em soja, esta análise estendeu-se a uma investigação genômica, a partir de sequências disponibilizadas no banco de dados SoyBase (http://www.soybase.org/), usando o programa BLASTN com os seguintes parâmetros: formato de saída de alinhamentos sem lacunas, matriz de comparação blossum62, valor W padrão, e-value 0.1 ou menor e filtro de baixa complexidade desligado. Os oligonucleotídeos [(AAG)5]10, [(AAC)5]10, [(AG)8]15, [(CTC)5]10 e [(TGA)6]10 foram utilizados como sondas, adotando como ponto de corte valores de identidade de pareamento inferiores a 77%, objetivando caracterizar número, tamanho e localização destas unidades de repetições no genoma. A FISH com oligonucleotídeos evidenciaram marcações pericentroméricas e proximais, embora um padrão de distribuição disperso tenha prevalecido ao longo dos cromossomos das espécies analisadas, com exceção de (AG)8 em soja que não revelou marcações visíveis. O oligonucleotídeo (AAG)5 revelou uma marcação pericentromérica evidente em P. lunatus, tratando-se de um marcador cromossômico para tal espécie. Na hibridização com (ACC)5 notou-se a presença de seis marcações fortes em V. unguiculata, estando uma delas localizada no par cromossômico 10, portador do sítio de DNAr 45S. O microssatélite (TGA)6 revelou uma marcação bem evidente no cromossomo 10 de P. lunatus, identificado pela presença de DNAr 5S. Algumas divergências observadas no padrão de distribuição e na intensidade dos sinais entre os genomas das espécies confirmam a hipótese de que as sequências de DNA repetitivo apresentam uma composição heterogênea. Na análise genômica de soja, foram observados 92, 84, 83, 142 e 103 sítios de repetições para os oligonucleotídeos (AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6, respectivamente, de tamanhos variáveis entre 30 a 454 pb, localizados, principalmente, em regiões de alta a moderada densidade gênica, por vezes associados a genes e elementos transponíveis. Considerando o pequeno tamanho, fica evidente que estas sequências não correspondem aos sítios observados pela FISH, uma vez que esta técnica evidencia apenas sequências com comprimentos acima de 1-3kb. Sugere-se que as marcações localizadas por FISH estejam associadas a regiões de heterocromatina e que sejam constituintes dos mais de 1.000 scaffolds existentes no sequenciamento da soja, não sendo, por essa razão, detectadas pela análise in silico. MenosOs microssatélites consistem em unidades de repetição (1 a 5pb) distribuídas em tandem, que podem estar dispersas ao longo dos genomas ou associadas a regiões heterocromáticas. Tais características têm permitido sua utilização na construção de mapas cromossômicos mediante hibridização in situ fluorescente (FISH), auxiliando no entendimento da organização genômica entre espécies proximamente relacionadas. O presente trabalho caracterizou a distribuição de oligonucleotídeos sintéticos (AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6 em Phaseolus vulgaris, P. lunatus, Vigna unguiculata, V. radiata e Glycine max, identificando marcas cromossômicas para a comparação destas leguminosas. Lâminas foram hibridizadas com sondas de oligonucleotídeos e rehibridizadas com DNAr 5S e 45S, provenientes de Lotus japonicus e Arabidopsis thaliana, respectivamente. Em soja, esta análise estendeu-se a uma investigação genômica, a partir de sequências disponibilizadas no banco de dados SoyBase (http://www.soybase.org/), usando o programa BLASTN com os seguintes parâmetros: formato de saída de alinhamentos sem lacunas, matriz de comparação blossum62, valor W padrão, e-value 0.1 ou menor e filtro de baixa complexidade desligado. Os oligonucleotídeos [(AAG)5]10, [(AAC)5]10, [(AG)8]15, [(CTC)5]10 e [(TGA)6]10 foram utilizados como sondas, adotando como ponto de corte valores de identidade de pareamento inferiores a 77%, objetivando caracterizar número, tamanho e localização destas unidades de repetições no gen... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Microssatélites. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/25952/1/GP-115.pdf
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Marc: |
LEADER 04001nam a2200193 a 4500 001 1873953 005 2011-06-03 008 2010 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aBORTOLETI, K. C. A. 245 $aDistribuição de microssatélites no genoma de leguminosas mediante hibridização in situ fluorescente. 260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... [Curitiba]: UFPR, 2010. p. 115.$c2010 520 $aOs microssatélites consistem em unidades de repetição (1 a 5pb) distribuídas em tandem, que podem estar dispersas ao longo dos genomas ou associadas a regiões heterocromáticas. Tais características têm permitido sua utilização na construção de mapas cromossômicos mediante hibridização in situ fluorescente (FISH), auxiliando no entendimento da organização genômica entre espécies proximamente relacionadas. O presente trabalho caracterizou a distribuição de oligonucleotídeos sintéticos (AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6 em Phaseolus vulgaris, P. lunatus, Vigna unguiculata, V. radiata e Glycine max, identificando marcas cromossômicas para a comparação destas leguminosas. Lâminas foram hibridizadas com sondas de oligonucleotídeos e rehibridizadas com DNAr 5S e 45S, provenientes de Lotus japonicus e Arabidopsis thaliana, respectivamente. Em soja, esta análise estendeu-se a uma investigação genômica, a partir de sequências disponibilizadas no banco de dados SoyBase (http://www.soybase.org/), usando o programa BLASTN com os seguintes parâmetros: formato de saída de alinhamentos sem lacunas, matriz de comparação blossum62, valor W padrão, e-value 0.1 ou menor e filtro de baixa complexidade desligado. Os oligonucleotídeos [(AAG)5]10, [(AAC)5]10, [(AG)8]15, [(CTC)5]10 e [(TGA)6]10 foram utilizados como sondas, adotando como ponto de corte valores de identidade de pareamento inferiores a 77%, objetivando caracterizar número, tamanho e localização destas unidades de repetições no genoma. A FISH com oligonucleotídeos evidenciaram marcações pericentroméricas e proximais, embora um padrão de distribuição disperso tenha prevalecido ao longo dos cromossomos das espécies analisadas, com exceção de (AG)8 em soja que não revelou marcações visíveis. O oligonucleotídeo (AAG)5 revelou uma marcação pericentromérica evidente em P. lunatus, tratando-se de um marcador cromossômico para tal espécie. Na hibridização com (ACC)5 notou-se a presença de seis marcações fortes em V. unguiculata, estando uma delas localizada no par cromossômico 10, portador do sítio de DNAr 45S. O microssatélite (TGA)6 revelou uma marcação bem evidente no cromossomo 10 de P. lunatus, identificado pela presença de DNAr 5S. Algumas divergências observadas no padrão de distribuição e na intensidade dos sinais entre os genomas das espécies confirmam a hipótese de que as sequências de DNA repetitivo apresentam uma composição heterogênea. Na análise genômica de soja, foram observados 92, 84, 83, 142 e 103 sítios de repetições para os oligonucleotídeos (AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6, respectivamente, de tamanhos variáveis entre 30 a 454 pb, localizados, principalmente, em regiões de alta a moderada densidade gênica, por vezes associados a genes e elementos transponíveis. Considerando o pequeno tamanho, fica evidente que estas sequências não correspondem aos sítios observados pela FISH, uma vez que esta técnica evidencia apenas sequências com comprimentos acima de 1-3kb. Sugere-se que as marcações localizadas por FISH estejam associadas a regiões de heterocromatina e que sejam constituintes dos mais de 1.000 scaffolds existentes no sequenciamento da soja, não sendo, por essa razão, detectadas pela análise in silico. 653 $aMicrossatélites 700 1 $aABDELNOOR, R. V. 700 1 $aBENKO-ISEPPON, A. M. 700 1 $aBELARMINO, L. C. S. 700 1 $aOLIVEIRA, A. R. S. 700 1 $aNASCIMENTO, I. R. 700 1 $aBRASILEIRO-VIDAL, A. C.
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