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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
16/11/2011 |
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Data da última atualização: |
16/11/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
RABELLO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; REIS, A. M. dos. |
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Afiliação: |
Fernanda R. Rabello, UnB; Marcelo F. Carazzolle, UNICAMP; NATALIA FLORENCIO MARTINS, CENARGEN; Magnólia A. Campos, UFLA; MARILIA SANTOS SILVA, CPAC; Alba Chiesse da Silva, SAPC; ANGELA MEHTA DOS REIS, CENARGEN. |
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Título: |
Análise in silico de genes de defesa do café expressos em ramos infectados por Xylella fastidiosa. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Um dos problemas que afetam a cultura do café é o depauperamento da folha do cafeeiro (?Coffee Leaf Scorch? - CLS), causado pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria forma agregados no xilema da planta, impossibilitando a passagem de água e nutrientes. Em virtude da importância econômica da cultura do café para o Brasil e das perdas causadas por X. fastidiosa, uma biblioteca de cDNA (RX1) foi construída utilizando ramos de cafeeiro infectados com esta bactéria e os ESTs (?Expressed sequence tags?) foram incluídos no banco de dados do CafEST (Genoma Funcional de Café). Com o objetivo de identificar genes potencialmente envolvidos nos processos de defesa de cafeeiro infectado com X. fastidiosa, foi realizada uma análise in silico dos ESTs de RX1. Foi analisado um total de 7502 seqüências, que foram agrupadas em 5483 clusters. A análise global baseada em ontologia de função molecular desses clusters revelou que a maior parte dos genes (cerca de 70%) está envolvida com metabolismo e processos fisiológicos celulares. Aproximadamente 1% dos ESTs está envolvido com estresse biótico e 2% com estresse abiótico. Foram encontrados ainda genes relacionados com a resposta a estímulos externos e ao estresse, diferenciação celular, entre outras funções. Dos 5483 clusters da biblioteca RX1, 2254 representam possivelmente genes únicos, pois não foram encontrados nas outras 37 bibliotecas do CafEST, construídas a partir de diferentes tecidos e condições biológicas. Muitos destes genes estão classicamente envolvidos com os processos de defesa da planta, incluindo aqueles que codificam para oxidases, peroxidases, lipoxigenases, proteínas de resistência, entre outros. MenosUm dos problemas que afetam a cultura do café é o depauperamento da folha do cafeeiro (?Coffee Leaf Scorch? - CLS), causado pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria forma agregados no xilema da planta, impossibilitando a passagem de água e nutrientes. Em virtude da importância econômica da cultura do café para o Brasil e das perdas causadas por X. fastidiosa, uma biblioteca de cDNA (RX1) foi construída utilizando ramos de cafeeiro infectados com esta bactéria e os ESTs (?Expressed sequence tags?) foram incluídos no banco de dados do CafEST (Genoma Funcional de Café). Com o objetivo de identificar genes potencialmente envolvidos nos processos de defesa de cafeeiro infectado com X. fastidiosa, foi realizada uma análise in silico dos ESTs de RX1. Foi analisado um total de 7502 seqüências, que foram agrupadas em 5483 clusters. A análise global baseada em ontologia de função molecular desses clusters revelou que a maior parte dos genes (cerca de 70%) está envolvida com metabolismo e processos fisiológicos celulares. Aproximadamente 1% dos ESTs está envolvido com estresse biótico e 2% com estresse abiótico. Foram encontrados ainda genes relacionados com a resposta a estímulos externos e ao estresse, diferenciação celular, entre outras funções. Dos 5483 clusters da biblioteca RX1, 2254 representam possivelmente genes únicos, pois não foram encontrados nas outras 37 bibliotecas do CafEST, construídas a partir de diferentes tecidos e condições biológicas. Muitos destes genes e... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Análise; Bactéria; Café. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46678/1/Analise-in-silico-de-genes.pdf
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental. |
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Data corrente: |
30/10/1999 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Autoria: |
NEVES, E. J. M. |
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Afiliação: |
EDINELSON JOSE MACIEL NEVES, CPAA. |
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Título: |
Biomassa e acúmulo de nutrientes nos diferentes compartimentos de Ceiba pentandra (L.) Gaertn e Virola surinamensis (Rol.) Warb plantadas na Amazônia Ocidental brasileira. |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
1999. |
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Páginas: |
189 p., il. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Ciências Florestais, área de concentração em Silvicultura) - Universidade Federal do Paraná, Curitiba. |
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Conteúdo: |
Na Amazonia Ocidental brasileira, foram estudados os aspectos silviculturais e nutricionais de Ceiba pentandra (L.) Gaerth e Virla surinamensis (Rol.) Warb com 43 e 55 meses de idade, plantadas em parcelas de 225 m2 sobre Latossolo Amarelo. Para isso, nas respectivas idades, foram selecionadas quatro arvores de cada especie. Os estudos relacionados aos aspectos silviculturais foram feitos atraves de medicoes de altura total, diametro a altura do peito (DAP) e calculo do volume total. Sas parcelas com as especies trabalhadas foram coletadas amostras de solo de 0-10; 10-30 e 30-60 cm de profundidade. Os estudos referentes aos aspectos nutricionais foram feitos apos o corte das arvores, as quais foram dividadas em diferentes compartimentos. Para o estudo dos sistema radicular, apenas uma arvores de cada especie foi amostrada aos 43 meses de idade. Entre as idades avaliadas, quantificou-se adicionalmente a deposicao de serapilheira. Foi avaliada a composicao quimica dos diferentes compartimentos, do solo e serapilheira. Constatou-se que o comportamento silvicultural das especies foi satisfatorio. Entretanto. Ceiba e Virola apresentaram caracteristicas nutricionais diferenciadas. A maior deposicao de folhas de Ceiba ocorreu no mes de julho, enquanto que em Virola ocorreu no mes de setembro. Os maiores conteudos dos nutrientes estudados foram depositados durante a estacao seca, com excecao dos de Ca e Zn. De maneira geral, as mairores concentracoes de nutrientes ocorreram no solo sob os plantios de Ceiba. Esta especie mostrou ser mais eficiente na utilizacao de nutrientes do que Virola surinamensis. MenosNa Amazonia Ocidental brasileira, foram estudados os aspectos silviculturais e nutricionais de Ceiba pentandra (L.) Gaerth e Virla surinamensis (Rol.) Warb com 43 e 55 meses de idade, plantadas em parcelas de 225 m2 sobre Latossolo Amarelo. Para isso, nas respectivas idades, foram selecionadas quatro arvores de cada especie. Os estudos relacionados aos aspectos silviculturais foram feitos atraves de medicoes de altura total, diametro a altura do peito (DAP) e calculo do volume total. Sas parcelas com as especies trabalhadas foram coletadas amostras de solo de 0-10; 10-30 e 30-60 cm de profundidade. Os estudos referentes aos aspectos nutricionais foram feitos apos o corte das arvores, as quais foram dividadas em diferentes compartimentos. Para o estudo dos sistema radicular, apenas uma arvores de cada especie foi amostrada aos 43 meses de idade. Entre as idades avaliadas, quantificou-se adicionalmente a deposicao de serapilheira. Foi avaliada a composicao quimica dos diferentes compartimentos, do solo e serapilheira. Constatou-se que o comportamento silvicultural das especies foi satisfatorio. Entretanto. Ceiba e Virola apresentaram caracteristicas nutricionais diferenciadas. A maior deposicao de folhas de Ceiba ocorreu no mes de julho, enquanto que em Virola ocorreu no mes de setembro. Os maiores conteudos dos nutrientes estudados foram depositados durante a estacao seca, com excecao dos de Ca e Zn. De maneira geral, as mairores concentracoes de nutrientes ocorreram no solo ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Ciclagem de nutriente; Cycling; Natural distribution; Nutrient cycling; Sumauma. |
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Thesagro: |
Absorção de Nutrientes; Biomassa; Ceiba Pentandra; Distribuição Geográfica; Essência Florestal; Nutrição; Nutrição Vegetal; Nutriente; Paineira; Produção; Serapilheira; Silvicultura; Taxonomia; Ucuuba; Virola Surinamensis. |
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Thesaurus NAL: |
Amazonia; biomass; forest litter; forest trees; nutrient transport; nutrient uptake; nutrients; nutrition; plant nutrition; silviculture; taxonomy. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/229574/1/T-NEVES-EDINELSON-JOSE-MACIEL.pdf
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Marc: |
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520 $aNa Amazonia Ocidental brasileira, foram estudados os aspectos silviculturais e nutricionais de Ceiba pentandra (L.) Gaerth e Virla surinamensis (Rol.) Warb com 43 e 55 meses de idade, plantadas em parcelas de 225 m2 sobre Latossolo Amarelo. Para isso, nas respectivas idades, foram selecionadas quatro arvores de cada especie. Os estudos relacionados aos aspectos silviculturais foram feitos atraves de medicoes de altura total, diametro a altura do peito (DAP) e calculo do volume total. Sas parcelas com as especies trabalhadas foram coletadas amostras de solo de 0-10; 10-30 e 30-60 cm de profundidade. Os estudos referentes aos aspectos nutricionais foram feitos apos o corte das arvores, as quais foram dividadas em diferentes compartimentos. Para o estudo dos sistema radicular, apenas uma arvores de cada especie foi amostrada aos 43 meses de idade. Entre as idades avaliadas, quantificou-se adicionalmente a deposicao de serapilheira. Foi avaliada a composicao quimica dos diferentes compartimentos, do solo e serapilheira. Constatou-se que o comportamento silvicultural das especies foi satisfatorio. Entretanto. Ceiba e Virola apresentaram caracteristicas nutricionais diferenciadas. A maior deposicao de folhas de Ceiba ocorreu no mes de julho, enquanto que em Virola ocorreu no mes de setembro. Os maiores conteudos dos nutrientes estudados foram depositados durante a estacao seca, com excecao dos de Ca e Zn. De maneira geral, as mairores concentracoes de nutrientes ocorreram no solo sob os plantios de Ceiba. Esta especie mostrou ser mais eficiente na utilizacao de nutrientes do que Virola surinamensis.
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Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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