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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
26/03/2009 |
Data da última atualização: |
15/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
MANCINI, A. L.; ROMERO, R. A. F. |
Afiliação: |
ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; ROSELI APARECIDA FRANCELIN ROMERO, ICMC/USP. |
Título: |
Predicting the position of hydrogen atoms in proteins through the pattern recognition of hydrogen bonds. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
X-Meeting 2008. |
Conteúdo: |
The recognition of patterns of hydrogens bond can generate knowledge and be applied to estimate the position of hydrogen atoms in a protein. Tradicional methods of prediction are based on physicalchemical knowledge. This research uses an innovative approach, based on computational methods. Data on hydrogen bond is obtained from the 3D coordinates of atoms from the resolved protein structure. Information about hydrogen bond patterns, once extracted from PDB database, are grouped by similarity, spatially aligned and used as input for the training of a neural network. The present stage of this reseach uses these intelligent techniques to predict the position of atom of hydrogen contained in groups hydroxyl (OH) belonging to the side chains of aminoacids serine, threonine and tyrosine. |
Palavras-Chave: |
Base de dados PDB; Bioinformática; Ligação de hidrogênio; Métodos computacionais; Proteínas. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Proteins. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 01605nam a2200229 a 4500 001 1031814 005 2020-01-15 008 2008 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMANCINI, A. L. 245 $aPredicting the position of hydrogen atoms in proteins through the pattern recognition of hydrogen bonds.$h[electronic resource] 260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C$c2008 300 $aNão paginado. 500 $aX-Meeting 2008. 520 $aThe recognition of patterns of hydrogens bond can generate knowledge and be applied to estimate the position of hydrogen atoms in a protein. Tradicional methods of prediction are based on physicalchemical knowledge. This research uses an innovative approach, based on computational methods. Data on hydrogen bond is obtained from the 3D coordinates of atoms from the resolved protein structure. Information about hydrogen bond patterns, once extracted from PDB database, are grouped by similarity, spatially aligned and used as input for the training of a neural network. The present stage of this reseach uses these intelligent techniques to predict the position of atom of hydrogen contained in groups hydroxyl (OH) belonging to the side chains of aminoacids serine, threonine and tyrosine. 650 $aBioinformatics 650 $aProteins 653 $aBase de dados PDB 653 $aBioinformática 653 $aLigação de hidrogênio 653 $aMétodos computacionais 653 $aProteínas 700 1 $aROMERO, R. A. F.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
07/01/2019 |
Data da última atualização: |
10/01/2019 |
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Autoria: |
PAREYN, F. G. C.; ARAÚJO, E. de L.; DRUMOND, M. A.; MIRANDA, J. de A. C.; SOUZA, C. A.; SILVA, A. P. de S.; BRAZOLIN, S.; MARQUES, K. K. M. |
Afiliação: |
Frans Germain Corneel Pareyn, Associação de Plantas do Nordeste; Elcida de Lima Araújo, UFPE; MARCOS ANTONIO DRUMOND, CPATSA; Maria José de Andrade Casimiro Miranda, Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo; Caroline Almeida Souza, Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo; Ana Paula de Souza Silva, Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo; Sérgio Brazolin, Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo; Keila Karoline Magalhães Marques, Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo. |
Título: |
Amburana cearensis: Amburana-de-cheiro. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
In: CORADIN, L.; CAMILLO, J.; PAREYN, F. G. C. (Ed.). Espécies nativas da flora brasileira de valor econômico atual ou potencial: plantas para o futuro: região Nordeste. Brasília, DF: MMA, 2018. |
Páginas: |
Cap. 5, p. 732-739 |
Descrição Física: |
il. color. |
Série: |
(Série Biodiversidade, 51). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Árvore decídua na estação seca, com altura entre 6-12m (Figura 1). Caule com diâmetro superior a 30cm, geralmente ereto, com casca castanho-escura e ritidoma desprendendo-se em lâminas (Figura 2); ramos pouco estriados, glabros. Folhas compostas, 10-15cm de comprimento, alternas, imparipinadas, com pecíolos cilíndricos; folíolos subopostos ovais à elípticos, com base e ápice arredondados ou acuminados. Inflorescências axilares ou terminais, composta por numerosas flores de cor branco-amarelada, pequenas e aromáticas (Figura 3). Frutos do tipo vagem de cor escura, deiscente em um dos lados, contendo uma semente, ou raramente, duas. As sementes são aladas e apresentam coloração preta, rugosa, com cerca de 1cm de largura e 2cm de comprimento. Espécie é nativa, mas não é endêmica do Brasil. Ocorre nas regiões Norte (Tocantins), Nordeste (Alagoas, Bahia, Ceará, Paraíba, Pernambuco, Piauí, Rio Grande do Norte), Centro-oeste (Goiás, Mato Grosso do Sul) e Sudeste (Espírito Santo, Minas Gerais, Rio de Janeiro e São Paulo) (Flora do Brasil,2017). |
Palavras-Chave: |
Amburana; Amburana cearensis; Cumaru-das-caatingas; Cumaru-de-cheiro; Louro-ingá; Umburana de cheiro; Umburana-lisa; Umburana-macho; Umburana-vermelha. |
Thesagro: |
Caatinga; Cumbaru; Planta Produtora de Madeira; Vegetação Nativa. |
Thesaurus NAL: |
Biodiversity; Fabaceae. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189885/1/Livro-Nordeste-732-739-2018.pdf
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Marc: |
LEADER 02359naa a2200409 a 4500 001 2103192 005 2019-01-10 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPAREYN, F. G. C. 245 $aAmburana cearensis$bAmburana-de-cheiro.$h[electronic resource] 260 $c2018 300 $aCap. 5, p. 732-739$cil. color. 490 $a(Série Biodiversidade, 51). 520 $aÁrvore decídua na estação seca, com altura entre 6-12m (Figura 1). Caule com diâmetro superior a 30cm, geralmente ereto, com casca castanho-escura e ritidoma desprendendo-se em lâminas (Figura 2); ramos pouco estriados, glabros. Folhas compostas, 10-15cm de comprimento, alternas, imparipinadas, com pecíolos cilíndricos; folíolos subopostos ovais à elípticos, com base e ápice arredondados ou acuminados. Inflorescências axilares ou terminais, composta por numerosas flores de cor branco-amarelada, pequenas e aromáticas (Figura 3). Frutos do tipo vagem de cor escura, deiscente em um dos lados, contendo uma semente, ou raramente, duas. As sementes são aladas e apresentam coloração preta, rugosa, com cerca de 1cm de largura e 2cm de comprimento. Espécie é nativa, mas não é endêmica do Brasil. Ocorre nas regiões Norte (Tocantins), Nordeste (Alagoas, Bahia, Ceará, Paraíba, Pernambuco, Piauí, Rio Grande do Norte), Centro-oeste (Goiás, Mato Grosso do Sul) e Sudeste (Espírito Santo, Minas Gerais, Rio de Janeiro e São Paulo) (Flora do Brasil,2017). 650 $aBiodiversity 650 $aFabaceae 650 $aCaatinga 650 $aCumbaru 650 $aPlanta Produtora de Madeira 650 $aVegetação Nativa 653 $aAmburana 653 $aAmburana cearensis 653 $aCumaru-das-caatingas 653 $aCumaru-de-cheiro 653 $aLouro-ingá 653 $aUmburana de cheiro 653 $aUmburana-lisa 653 $aUmburana-macho 653 $aUmburana-vermelha 700 1 $aARAÚJO, E. de L. 700 1 $aDRUMOND, M. A. 700 1 $aMIRANDA, J. de A. C. 700 1 $aSOUZA, C. A. 700 1 $aSILVA, A. P. de S. 700 1 $aBRAZOLIN, S. 700 1 $aMARQUES, K. K. M. 773 $tIn: CORADIN, L.; CAMILLO, J.; PAREYN, F. G. C. (Ed.). Espécies nativas da flora brasileira de valor econômico atual ou potencial: plantas para o futuro: região Nordeste. Brasília, DF: MMA, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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