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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
07/08/2020 |
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Data da última atualização: |
27/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. |
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Afiliação: |
Daniele Heloisa Pinheiro; Raquel Oliveira Moreira, UNESP; Natalia Alves Leite, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Ana Carolina Redoan; Andre da Silva Xavier, Universidade Federal do Espírito Santo; BEATRIZ DE ALMEIDA BARROS, CNPMS; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS. |
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Título: |
Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020. |
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DOI: |
10.1007/s11033-020-05550-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. MenosThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the develop... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Gene; Inseto; Percevejo; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
LEADER 02446naa a2200253 a 4500 001 2124236 005 2020-10-27 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11033-020-05550-z$2DOI 100 1 $aPINHEIRO, D. H. 245 $aSuitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera$bPentatomidae).$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. 650 $aGene 650 $aInseto 650 $aPercevejo 650 $aSeleção Genética 700 1 $aMOREIRA, R. O. 700 1 $aLEITE, N. A. 700 1 $aREDOAN, A. C. 700 1 $aXAVIER, A. da S. 700 1 $aBARROS, B. de A. 700 1 $aCARNEIRO, N. P. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 47, p. 4989-5000, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 1. |  | SENA, E. O. L. P.; SOUZA, R. F.; MORAES, J. L. C.; VENTURIERI, G.; MÜLLER, R.; SANTOS, A. S. Avaliação da qualidade de méis de Melípona fasciculata produzidos no Nordeste paraense. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 59., 2007, Belém, PA. Resumos... Belém, PA: SBPC, [2007].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. |  | SOUZA, R. F. de; GUILHON, G. M. S. P.; AGUIAR, O. J. R. de; SANTOS, A. S. Concentrados de metabólitos obtidos das folhas da teca (Tectona grandis (L.f)) para uso como corante. In: ENCONTRO DE PROFISSIONAIS DA QUÍMICA DA AMAZÔNIA, 10., 2007, Belém, PA. Recursos naturais: uma reflexão para os profissionais da química. Belém, PA: Conselho Regional de Química da 6ª Região, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. |  | SOUZA, R. F.; RIBEIRO, K. M.; DEUS, R. J. A. de; TRINDADE, N. S.; SOUZA FILHO, A. P. S.; SANTOS, A. S. Atividade alelopática do extrato hidroalcoólico bruto e frações das folhas de Mansoa alliaceae (Bignoniaceae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUÍMICA, 48., 2008, Rio de Janeiro. Química na proteção ao meio ambiente e à saúde: resumos. Rio de Janeiro: Associação Brasileira de Química, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. |  | SOUZA, R. F.; VALOIS, A. C. C.; PAIVA, J. R. de; CARBAJAL, A. P.; ROCHA NETO, O. G. da; SOUZA, R. A. de. Desenvolvimento da pesquisa heveícola no Brasil. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Anais. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1986. v. 4, p. 81-91. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 36). v.4 Culturas perenes.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. |  | SOUZA, R. F.; TIBEIRO, K. M.; DEUS, R. J. A.; BANNA, D. A. D. S.; SOUZA FILHO, A. P. S.; ARRUDA, M. S. P.; SILVA, M. N.; ARRUDA, A.; SANTOS, A. S. Potencial bioerbicida de substâncias isoladas de Mansoa standleyi (Bignoniaceae). In: CONFERÊNCIA DO SUBPROGRAMA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA - SPC&T FASE II/PPG7, 2008, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: CNPq, 2009. p. 379-382. Disponível também em CD-ROM (CD 00173).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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