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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
09/02/2009 |
Data da última atualização: |
06/07/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, E. J.; VIEIRA, M. L. C.; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. P.; MORAES, M. C.; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P. |
Afiliação: |
Eder Jorge de Oliveira, CNPMF; Maria Lucia C. Vieira, ESALQ/USP; Antônio Augusto F. Garcia, ESALQ/USP; Carla F. Munhoz, ESALQ/USP; Gabriel R. A. Margarido, ESALQ/USP; Luciano Consoli, ESALQ/USP; Frederico P. Matta, ESALQ/USP; Michel C. Moraes, ESALQ/USP; Maria I. Zucchi, IAC; Maria Helena P. Fungaro, UEL. |
Título: |
An integrated molecular map yellow passion fruit based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of the American Society Horticultural Science, Mount Vernon, v. 133, n. 1, p. 35-41, jan. 2008. |
Descrição Física: |
il. |
ISSN: |
0003-1062 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The development of genetic maps for auto-incompatible species, such as the yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) is restricted due to the unfeasibility of obtaining traditional mapping populations based on inbred lines. For this reason, yellow passion fruit linkage maps were generally constructed using a strategy known as two-way pseudo-testcross, based on monoparental dominant markers segregating in a 1:1 fashion. Due to the lack of information from these markers in one of the parents, two individual (parental) maps were obtained. However, integration of these maps is essential, and biparental markers can be used for such an operation. The objective of our study was to construct an integrated molecular map for a full-sib population of yellow passion fruit combining different loci configuration generated from amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and microsatellite markers and using a novel approach based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases, specially designed for outcrossing species. Of the total number of loci, 76%, 21%, 0.7%, and 2.3% did segregate in 1:1, 3:1, 1:2:1, and 1:1:1:1 ratios, respectively. Ten linkage groups (LGs) were established with a logarithm of the odds (LOD) score 5.0 assuming a recombination fraction 0.35. On average, 24 markers were assigned per LG, representing a total map length of 1687 cM, with a marker density of 6.9 cM. No markers were placed as accessories on the map as was done with previously constructed individual maps. MenosThe development of genetic maps for auto-incompatible species, such as the yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) is restricted due to the unfeasibility of obtaining traditional mapping populations based on inbred lines. For this reason, yellow passion fruit linkage maps were generally constructed using a strategy known as two-way pseudo-testcross, based on monoparental dominant markers segregating in a 1:1 fashion. Due to the lack of information from these markers in one of the parents, two individual (parental) maps were obtained. However, integration of these maps is essential, and biparental markers can be used for such an operation. The objective of our study was to construct an integrated molecular map for a full-sib population of yellow passion fruit combining different loci configuration generated from amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and microsatellite markers and using a novel approach based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases, specially designed for outcrossing species. Of the total number of loci, 76%, 21%, 0.7%, and 2.3% did segregate in 1:1, 3:1, 1:2:1, and 1:1:1:1 ratios, respectively. Ten linkage groups (LGs) were established with a logarithm of the odds (LOD) score 5.0 assuming a recombination fraction 0.35. On average, 24 markers were assigned per LG, representing a total map length of 1687 cM, with a marker density of 6.9 cM. No markers were placed as accessories on the map as... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
AFLP; flavicarpa; Linkage map integration; Microsatellite; Multipoint distance; Outcrossing specie; Passiflora edulis f. |
Thesagro: |
Maracujá; Marcador Molecular. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 30 | |
1. |  | CARVALHO, J. M. P.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; GUIMARÃES, Y. B. P. C. Analysis of soil quality bioindicators in grain cultivation systems (soybean and corn) in the region of Santarém, Mojuí dos Campos and Belterra, PA. International Seven Journal of Multidisciplinary, v. 4, n. 3, p. 543-554, 2025.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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2. |  | RODRIGUES, N. E.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; SANTOS, D. B. dos; SILVA, A. D. da. Concentração de nutrientes em resíduos de colheita de plantios de soja no Oeste paraense. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 82-86.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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3. |  | CAVALCANTE, E. A.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; GUEDES, M. C.; OLIVEIRA, D. R. de; BRENDON, Y. Caracterização física e química do solo sob dois castanhais nativos, na Floresta Nacional do Tapajós, Pará e na Resex rio Cajari, Amapá. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 65-70.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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4. |  | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; CARVALHO, E. J. M.; OLIVEIRA, D. R. de; BELDINI, T. P.; SANTOS, D. B. dos. Efeito de sistemas de manejo sobre emissões de gases de efeito estufa em Latossolo amarelo muito argiloso de Paragominas-PA. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 130-134.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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5. |  | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; CARVALHO, E. J. M.; MACHADO, W. F.; SANTOS, D. B. dos; OLIVEIRA, D. R. de. Estoques de nitrogênio e carbono sob diferentes sistemas de uso e manejo de um Latossolo amarelo no município de Paragominas. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 135-138.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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6. |  | RODRIGUES, N. E.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; TANABE, C. S.; OLIVEIRA, D. R. de; SANTOS, D. B. dos. Resíduos de colheita e quantificação de raízes em plantios de soja no Oeste paraense. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 190-194.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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7. |  | COSTA, F. F.; GUEDES, M. C.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; GUERREIRO, Q. L. de M.; OLIVEIRA, D. R. de. Densidade de castanheiras e estrutura vertical de florestas com castanhais na Amazônia Oriental. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 91-96.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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8. |  | RODRIGUES, N. E.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SANTOS, D. B. dos; TANABE, C. S.; OLIVEIRA, D. R. de. Quantificação da mineralização e da nitrificação em plantios de soja no Oeste paraense. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 184-189.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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9. |  | SANTOS, F. C. dos; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SANTOS, D. B. dos; OLIVEIRA, D. R. de; SOARES, G. S. Trocas gasosas de CH4 e N2O entre solo e atmosfera em diferentes tipos de cobertura nos municípios de Belterra e Santarém, Pará. In: CONGRESSO TÉCNICO CIENTÍFICO DA ENGENHARIA E DA AGRONOMIA; SEMANA OFICIAL DA ENGENHARIA E DA AGRONOMIA, 74., 2017, Belém, PA. A responsabilidade da Engenharia e da Agronomia para o desenvolvimento do País. [Brasília, DF]: Confea, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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10. |  | CAVALCANTE, E. A.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; SOUSA, K. T. S. de; CORREA, K. F. Variabilidade espacial de atributos físicos e químicos de um solo sob floresta ombrófila densa na Flona Tapajós-PA. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 200-204.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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11. |  | MELEM JUNIOR, N. J.; FABER, J.; GALLO, J.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SILVA, A. D. da; OLIVEIRA, D. R. de. Avaliação da produtividade da soja em diferentes doses de potássio na região de Belterra/PA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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12. |  | SCHWADE, S.; GALLO, J.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; MELEM JUNIOR, N. J.; SANTOS, D. B. dos. Avaliação da produtividade da soja sob diferentes doses de Fósforo na região de Santarém - PA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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13. |  | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; VALENTE, M. A.; SILVA, A. D. da; MARTINS, I. C. T.; GALLO, J.; OLIVEIRA, D. R. de; TANABE, C. S.; RODRIGUES, T. E. Avaliação da aptidão agrícola das terras do Município de Ariquemes, Estado de Rondônia. Espaço Científico, Santarém, v. 14, n. 2, p. 5-20, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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14. |  | GASPAR, A. B. dos S.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; RODRIGUES NETO, P. F.; MARTINS, I. C. T.; OLIVEIRA, D. R. de. Avaliação dos atributos químicos de Latossolos em áreas de ocorrência da soja louca II na região oeste do Pará. In: CONGRESSO TÉCNICO CIENTÍFICO DA ENGENHARIA E DA AGRONOMIA; SEMANA OFICIAL DA ENGENHARIA E DA AGRONOMIA, 74., 2017, Belém, PA. A responsabilidade da Engenharia e da Agronomia para o desenvolvimento do País. [Brasília, DF]: Confea, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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15. |  | SILVA, A. D. da; PRUDENTE, H.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SILVA, A. R.; CAMARGO, P. B. de; OLIVEIRA, D. R. de. Concentração de nutrientes via deposição de liteira na Floresta Nacional do Tapajós, Belterra - PA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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16. |  | HERMES, F.; GIACOMIN, L.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; GALLO, J.; TANABE, C. S.; MARTINS, I. C. T.; SILVA, A. D. da. Comparação de densidades de plantio em cultivo de soja no oeste do Pará. Espaço Científico, Santarém, v. 14, n. 1, p. 15-24, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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17. |  | HERMES, F.; GIACOMIN, L.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; OLIVEIRA, E. L. de; SOUSA, D. B. de. Comparação de densidades de plantio em cultivo de soja no oeste do Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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18. |  | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; GUERREIRO, Q. L. M.; OLIVEIRA, D. R. de; MELEM JUNIOR, N. J.; ALVES, R. M. M. Efeito de sistemas de manejo sobre emissões de gases de efeito estufa em cultura do milho no município de Macapá-AP. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 125-129.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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19. |  | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; GUERREIRO, Q. L. M.; OLIVEIRA, D. R. de; MELEM JUNIOR, N. J.; ALVES, R. M. M. Efeito de sistemas de manejo sobre emissões de gases de efeito estufa em cultura da soja no município de Macapá-AP. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 120-124.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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20. |  | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SILVA, A. D. da; GALLO, J.; OLIVEIRA, D. R. de; MARTINS, I. C. T.; TANABE, C. S. Estabilidade de agregados e superfície específica de solos do nordeste paraense. Espaço Científico, Santarém, v. 14, n. 2, p. 21-29, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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