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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
12/12/2016 |
Data da última atualização: |
16/11/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RAMOS-GONZÁLEZ, P. L.; CHABI-JESUS, C.; GUERRA-PERAZA, O.; BRETON, M. C.; ARENA, G. D.; NUNES, M. A.; KITAJIMA, E. W.; MACHADO, M. A.; ASTUA, J. de F. |
Afiliação: |
PEDRO LUIS RAMOS-GONZÁLEZ, IAC; CAMILA CHABI-JESUS; ORLENE GUERRA-PERAZA, Instituto Biológico; MICHÈLE CLAIRE BRETON, IAC; GABRIELLA DIAS ARENA, IAC; MARIA ANDREIA NUNES, IAC; ELLIOT WATANABE KITAJIMA, ESALQ; MARCOS ANTONIO MACHADO, IAC; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF. |
Título: |
Phylogenetic and Molecular Variability Studies Reveal a New Genetic Clade of Citrus leprosis virus C. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Viruses, v.8, n.153, 2016. |
ISSN: |
1999-4915 |
DOI: |
10.3390/v8060153 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Citrus leprosis virus C (CiLV-C) causes a severe disease affecting citrus orchards in the Western hemisphere. This study reveals the molecular variability of the virus by analyzing four genomic regions (p29, p15, MP and RNA2-intergenic region) distributed over its two RNAs. Nucleotide diversity () values were relatively low but statistically different over the analyzed genes and subpopulations, indicating their distinct evolutionary history. Values of p29 and MP were higher than those of p15 and RNA2?IR, whereas MP was increased due to novel discovered isolates phylogenetically clustered in a divergent clade that we called SJP. Isolate BR_SP_SJP_01 RNA1 and RNA2 sequences, clade SJP, showed an identity of 85.6% and 88.4%, respectively, with those corresponding to CiLV-C, the type member of the genus Cilevirus, and its RNA2 51-proximal region was revealed as a minor donor in a putative inter-clade recombination event. In addition to citrus, BR_SP_SJP_01 naturally infects the weed Commelina benghalensis and is efficiently transmitted by Brevipalpus yothersi mites. Our data demonstrated that negative selection was the major force operating in the evaluated viral coding regions and defined amino acids putatively relevant for the biological function of cilevirus proteins. This work provides molecular tools and sets up a framework for further epidemiological studies |
Palavras-Chave: |
Plant diseases. |
Thesagro: |
Doença de planta; Fruta cítrica. |
Thesaurus Nal: |
Citrus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02197naa a2200289 a 4500 001 2058412 005 2017-11-16 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1999-4915 024 7 $a10.3390/v8060153$2DOI 100 1 $aRAMOS-GONZÁLEZ, P. L. 245 $aPhylogenetic and Molecular Variability Studies Reveal a New Genetic Clade of Citrus leprosis virus C.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aCitrus leprosis virus C (CiLV-C) causes a severe disease affecting citrus orchards in the Western hemisphere. This study reveals the molecular variability of the virus by analyzing four genomic regions (p29, p15, MP and RNA2-intergenic region) distributed over its two RNAs. Nucleotide diversity () values were relatively low but statistically different over the analyzed genes and subpopulations, indicating their distinct evolutionary history. Values of p29 and MP were higher than those of p15 and RNA2?IR, whereas MP was increased due to novel discovered isolates phylogenetically clustered in a divergent clade that we called SJP. Isolate BR_SP_SJP_01 RNA1 and RNA2 sequences, clade SJP, showed an identity of 85.6% and 88.4%, respectively, with those corresponding to CiLV-C, the type member of the genus Cilevirus, and its RNA2 51-proximal region was revealed as a minor donor in a putative inter-clade recombination event. In addition to citrus, BR_SP_SJP_01 naturally infects the weed Commelina benghalensis and is efficiently transmitted by Brevipalpus yothersi mites. Our data demonstrated that negative selection was the major force operating in the evaluated viral coding regions and defined amino acids putatively relevant for the biological function of cilevirus proteins. This work provides molecular tools and sets up a framework for further epidemiological studies 650 $aCitrus 650 $aDoença de planta 650 $aFruta cítrica 653 $aPlant diseases 700 1 $aCHABI-JESUS, C. 700 1 $aGUERRA-PERAZA, O. 700 1 $aBRETON, M. C. 700 1 $aARENA, G. D. 700 1 $aNUNES, M. A. 700 1 $aKITAJIMA, E. W. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aASTUA, J. de F. 773 $tViruses$gv.8, n.153, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 10 | |
2. |  | SANTOS, J. C.; NOGUEIRA NETO, P. P.; SOARES, M. H. M.; RUSCHEL, A. R. Avaliação da regeneração natural de espécies arbusto-arbóreas em áreas degradadas pelo uso agropecuário. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 19.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 3., 2015, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2015. p. 115-119.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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3. |  | NOGUEIRA NETO, P. P.; COELHO, F. de A.; PINTO, M. V. P.; CARNEIRO, F. da S.; RUSCHEL, A. R.; KANASHIRO, M. Avaliação da estrutura diamétrica como critério para definição do estádio sucessional em lotes de assentamento rural no município de Anapu. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 20.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2016, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2016. p. 172-175.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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4. |  | PINTO, M. V. P.; MORAES, L. B.; SANTOS, J. C. dos; COELHO, F. de A.; NOGUEIRA NETO, P. P.; RUSCHEL, A. R. Passagem nas classes diamétricas de espécies arbóreas e palmeiras em florestas de várzeas em ilhas do delta do Amazonas. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 20.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2016, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2016. p. 282-286.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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5. |  | NOGUEIRA NETO, P. P.; RUSCHEL, A. R.; COELHO, F. de A.; PINTO, M. V. P.; SOARES, M. H.; BARBOSA, L. M. Comportamento da (Couratari stellata) na Floresta Nacional do Tapajós. In: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 13., 2015, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Universidade Federal Rural da Amazônia, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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6. |  | BARBOSA, L. M.; GOMES, J. M.; RUSCHEL, A. R.; FREITAS, L. J. M. de; PINTO, M. V. P.; NOGUEIRA NETO, P. P. Mortalidade e ingresso da espécie Rinorea guianensis Aubl. em áreas exploradas na Floresta Nacional do Tapajós. In: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 13., 2015, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Universidade Federal Rural da Amazônia, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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7. |  | CORTOPASSI-LAURINO, M.; IMPERATRIZ-FONSECA, V. L.; ROUBIK, D. W.; DOLLIN, A.; HEARD, T.; AGUILAR, I.; VENTURIERI, G. C.; EARDLEY, C.; NOGUEIRA-NETO, P. Global meliponiculture: challenges and opportunities. Apidologie, v. 37, n. 2, p. 275-292, Mar./Apr. 2006.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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8. |  | COELHO, F. de A.; PINTO, M. V. P.; NOGUEIRA NETO, P. P.; GOMES, J. M.; SOARES, M. H. M.; RUSCHEL, A. R. Estrutura populacional da castanheira (Bertholletia excelsa Bonpl) no parque zoobotânico de Marabá, PA. In: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 13., 2015, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Universidade Federal Rural da Amazônia, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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9. |  | VENTURIERI, G. C.; ALVES, D. de A.; VILLAS-BÔAS, J. K.; CARVALHO, C. A. L. de; MENEZES, C.; VOLLET-NETO, A.; CONTRERA, F. A. L.; CORTOPASSI-LAURINO, M.; NOGUEIRA-NETO, P.; IMPERATRIZ-FONSECA, V. L. Meliponicultura no Brasil: situação atual e perspectivas futuras para o uso na polinização agrícola. In: IMPERATRIZ-FONSECA, V. L.; CANHOS, D. A. L.; ALVES, D. de A.; SARAIVA, A. M. (Org.). Polinizadores no Brasil: contribuição e perspectivas para a biodiversidade, uso sustentável, conservação e serviços ambientais. São Paulo: EDUSP, 2012. p. 213-236.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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10. |  | CASTRO, M. S. de; KOEDAM, D.; CONTRERA, F. A. L.; VENTURIERI, G. C.; PARRA, G. N.; BRAGA, K. S. M.; CAMPOS, L. de O.; VIANA, M.; CORTOPASSI-LAURINO, M.; NOGUEIRA NETO, P.; PERUQUETTI, R. C.; IMPERATRIZ-FONSECA, V. L. Stingless bees. In: WORKSHOP ON SÃO PAULO DECLARATION ON POLLINATORS PLUS 5 FORUM, 2003, São Paulo. Bees as pollinators in Brazil: assessing the status and suggesting best practices: proceedings. Ribeirão Preto: Holos, 2006. p. 75-88. Editado por Vera Lúcia Imperatriz-Fonseca; Antonio Mauro Saraiva; David De Jong.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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