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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
19/09/2018 |
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Data da última atualização: |
28/09/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, L. L.; PESTANA, K. N.; FERREIRA, C. F.; OLIVEIRA, S. A. S. de. |
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Afiliação: |
LEANDRO L. SILVA, UFRB; KÁTIA N. PESTANA; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Differentiation of phylogenetic lineages within the 'Colletotrichum gloeosporioides species complex' associated with cassava anthracnose disease by PCR-RFLP. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v.43, p.194-20, 2018. |
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ISSN: |
1983-2052 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Different species were found associated with cassava anthracnose, considered a major disease of this crop. The correct identification of the causal agent is a first step for defining appropriate control strategies, such as resistant varieties. In silico analyses used sequences of six genomic regions of ex-type specimens from the ?Colletotrichum gloeosporioides species complex? (C.g.SC) and 21 restriction enzymes to identify phylogenetic lineages. The three best combinations of region/enzymes were validated in 18 Colletotrichum spp. isolates from cassava. Dendrograms for in silico PCR-RFLP for CAL, ITS and TUB2 showed considerable agreement with the phylogenetic analysis of each genomic region; however, the CAL gene presented greater discriminatory power. Since the band patterns from in gel analysis were almost the same as expected for the in silico analysis for the CAL region, a new approach was proposed based on the combined data from these two methodologies, allowing the differentiation of five phylogenetic lineages within the C.g.SC (C. tropicale; C. fructicola; C. siamense; C. gloeosporioides sensu stricto and C. theobromicola), and one outside of this complex (C. cliviae). This evaluation showed to be a reliable technique for preliminary identification of species prior to sequencing. |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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260 $c2018
520 $aDifferent species were found associated with cassava anthracnose, considered a major disease of this crop. The correct identification of the causal agent is a first step for defining appropriate control strategies, such as resistant varieties. In silico analyses used sequences of six genomic regions of ex-type specimens from the ?Colletotrichum gloeosporioides species complex? (C.g.SC) and 21 restriction enzymes to identify phylogenetic lineages. The three best combinations of region/enzymes were validated in 18 Colletotrichum spp. isolates from cassava. Dendrograms for in silico PCR-RFLP for CAL, ITS and TUB2 showed considerable agreement with the phylogenetic analysis of each genomic region; however, the CAL gene presented greater discriminatory power. Since the band patterns from in gel analysis were almost the same as expected for the in silico analysis for the CAL region, a new approach was proposed based on the combined data from these two methodologies, allowing the differentiation of five phylogenetic lineages within the C.g.SC (C. tropicale; C. fructicola; C. siamense; C. gloeosporioides sensu stricto and C. theobromicola), and one outside of this complex (C. cliviae). This evaluation showed to be a reliable technique for preliminary identification of species prior to sequencing.
650 $aCassava
650 $aMandioca
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700 1 $aFERREIRA, C. F.
700 1 $aOLIVEIRA, S. A. S. de
773 $tTropical Plant Pathology$gv.43, p.194-20, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | ARAÚJO, L. F. de; BARROS, J. R. A.; BARROS, J. R.; BEZERRA, M. A.; ANGELOTTI, F. Desenvolvimento inicial e trocas gasosas do meloeiro sob temperatura elevada. In: SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 4., 2015, Petrolina. Experiências e oportunidades para o desenvolvimento. Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 262).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 4. | | SIQUEIRA, K. M. M. de; KIILL, L. H. P.; SILVA, E. M. S.; RIBEIRO, M. de F.; CALVET, A. S. F.; BEZERRA, M. A.; PEREIRA NETO, J. A importância dos polinizadores na cultura de Cucumis melo L. em cultivo com e sem cobertura plástica. Horticultura Argentina, v. 36, n. 90, p. 59-66, may/ago. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 5. | | MONTEIRO, J. E. B. de A.; COSTA, F. de S.; BEZERRA, M. A.; COMUNELLO, E.; ZOLIN, C. A.; PEREIRA, J. R.; MELEM JUNIOR, N. J.; ANTONIO, I. C.; SANTIAGO, A. V.; SILVA, S. C. da; SILVA, F. A. M. da; STEINMETZ, S.; KLEPKER, D.; COELHO FILHO, M. A.; CABRAL, O. M. R.; ANDRADE JUNIOR, A. S. de; GUIMARAES, D. P.; SORIANO, B. M. A.; PEZZOPANE, J. R. M.; EVANGELISTA, B. A.; ALVES, A. B.; MOURA, M. S. B. de; FARIAS, J. R. B.; BARROS, A. H. C.; TEIXEIRA, W. G.; SILVA, A. A. G. da; CUNHA, G. R. da; CONCEIÇÃO, M. A. F.; HIGA, R.; PELLEGRINO, G. Q. Agricultural climate risk zoning (ZARC). In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W . G. da (ed.). Adapting to climate change: strategies for Brazilian agricultural and livestock systems. Brasília, DF: MAPA, 2021. p. 102-103.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Maranhão; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Rondônia; Embrapa Roraima; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Solos; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. MenosEmbrapa Acre; Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados... Mostrar Todas |
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| 6. | | MONTEIRO, J. E. B. de A.; COSTA, F. de S.; BEZERRA, M. A.; COMUNELLO, E.; ZOLIN, C. A.; PEREIRA, J. R.; MELEM JUNIOR, N. J.; ANTONIO, I. C.; SANTIAGO, A. V.; SILVA, S. C. da; SILVA, F. A. M. da; STEINMETZ, S.; KLEPKER, D.; COELHO FILHO, M. A.; CABRAL, O. M. R.; ANDRADE JUNIOR, A. S. de; GUIMARAES, D. P.; SORIANO, B. M. A.; PEZZOPANE, J. R. M.; EVANGELISTA, B. A.; ALVES, A. B.; MOURA, M. S. B. de; FARIAS, J. R. B.; BARROS, A. H. C.; TEIXEIRA, W. G.; SILVA, A. A. G. da; CUNHA, G. R. da; CONCEIÇÃO, M. A. F.; HIGA, R. C. V.; PELLEGRINO, G. Q. Zoneamento Agrícola de Risco Climático (ZARC). In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W. G. da (org.). Estratégias de adaptação às mudanças do clima dos sistemas agropecuários brasileiros. Brasília, DF: MAPA, 2021. p. 102-103.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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