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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
05/01/2021 |
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Data da última atualização: |
17/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CURSINO, A. E.; LIMA, M. T.; NOGUEIRA, M. F.; AGUIAR, D. M. de; LUIZ, A. P. M. F.; ALVES, P. A.; ARAUJO JUNIOR, J. P.; KROON, E. G. |
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Afiliação: |
ANDREIA ELISA CURSINO, Universidade Federal de Minas Gerais; MAURÍCIO TEIXEIRA LIMA, Universidade Federal de Minas Gerais; MARCIA FURLAN NOGUEIRA T DE LIMA, CPAP; DANIEL MOURA DE AGUIAR, Universidade Federal de Mato Grosso; ANA PAULA MOREIRA FRANCO LUIZ, Viriontech do Brasil Indústria de Insumos e Serviços em Biotecnologia; PEDRO AUGUSTO ALVES, Instituto René Rachou, Fiocruz; JOÃO PESSOA ARAUJO JUNIOR, Universidade Estadual Paulista (Unesp); ERNA GEESSIEN KROON, Universidade Federal de Minas Gerais. |
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Título: |
Identification of large genetic variations in the equine infectious anemia virus tat-gag genomic region. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Transboundary and Emerging Diseases, v. 68, n. 6, p. 3424-3432, 2021. |
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DOI: |
10.1111/tbed.13946 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The aetiological agent of equine infectious anaemia (EIA) is the retrovirus equine infectious anemia virus (EIAV) that infects all members of the Equidae family. The EIA is widely disseminated in the Brazilian territory with a high seroprevalence in the Brazilian Pantanal and is mainly diagnosed using agar gel immunodiffusion (AGID). There are few complete EIAV genome sequences available in GenBank, which had an impact on molecular detection studies. In this study, we conducted molecular detection and sequencing of EIAV proviral DNA from Brazilian horses. We analysed the genomic region from exon 1 of tat to gag (tat-gag). Comparative serological tests, comprising AGID and two enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs), were also conducted. Of the 133 samples, 58 were positive in the tat-gag PCR, and 49 nucleotide sequences of 272 bp were obtained. Using this developed tat-gag PCR EIAV proviral DNA was detected in 7% of the AGID-negative samples and 26% of the AGID-negative samples were positive in at least one of the ELISA tests used. Using phylogenetic analysis, the Brazilian Pantanal EIAV sequences grouped in a different clade of EIAV sequences from other countries. Thus, the EIAV sequences can contribute to the knowledge of the tat-gag genomic region in the circulating viruses in the Brazilian Pantanal, in addition to providing new information about the genetic diversity. In addition, the serological results demonstrate the greater sensitivity of the ELISAs used in this study compared to AGID for EIA diagnosis. MenosAbstract: The aetiological agent of equine infectious anaemia (EIA) is the retrovirus equine infectious anemia virus (EIAV) that infects all members of the Equidae family. The EIA is widely disseminated in the Brazilian territory with a high seroprevalence in the Brazilian Pantanal and is mainly diagnosed using agar gel immunodiffusion (AGID). There are few complete EIAV genome sequences available in GenBank, which had an impact on molecular detection studies. In this study, we conducted molecular detection and sequencing of EIAV proviral DNA from Brazilian horses. We analysed the genomic region from exon 1 of tat to gag (tat-gag). Comparative serological tests, comprising AGID and two enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs), were also conducted. Of the 133 samples, 58 were positive in the tat-gag PCR, and 49 nucleotide sequences of 272 bp were obtained. Using this developed tat-gag PCR EIAV proviral DNA was detected in 7% of the AGID-negative samples and 26% of the AGID-negative samples were positive in at least one of the ELISA tests used. Using phylogenetic analysis, the Brazilian Pantanal EIAV sequences grouped in a different clade of EIAV sequences from other countries. Thus, the EIAV sequences can contribute to the knowledge of the tat-gag genomic region in the circulating viruses in the Brazilian Pantanal, in addition to providing new information about the genetic diversity. In addition, the serological results demonstrate the greater sensitivity of the ELISAs use... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Anemia Infecciosa; Cavalo. |
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Thesaurus Nal: |
Equine infectious anemia virus; Horses. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02360naa a2200265 a 4500
001 2128970
005 2022-02-17
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100 1 $aCURSINO, A. E.
245 $aIdentification of large genetic variations in the equine infectious anemia virus tat-gag genomic region.$h[electronic resource]
260 $c2020
520 $aAbstract: The aetiological agent of equine infectious anaemia (EIA) is the retrovirus equine infectious anemia virus (EIAV) that infects all members of the Equidae family. The EIA is widely disseminated in the Brazilian territory with a high seroprevalence in the Brazilian Pantanal and is mainly diagnosed using agar gel immunodiffusion (AGID). There are few complete EIAV genome sequences available in GenBank, which had an impact on molecular detection studies. In this study, we conducted molecular detection and sequencing of EIAV proviral DNA from Brazilian horses. We analysed the genomic region from exon 1 of tat to gag (tat-gag). Comparative serological tests, comprising AGID and two enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs), were also conducted. Of the 133 samples, 58 were positive in the tat-gag PCR, and 49 nucleotide sequences of 272 bp were obtained. Using this developed tat-gag PCR EIAV proviral DNA was detected in 7% of the AGID-negative samples and 26% of the AGID-negative samples were positive in at least one of the ELISA tests used. Using phylogenetic analysis, the Brazilian Pantanal EIAV sequences grouped in a different clade of EIAV sequences from other countries. Thus, the EIAV sequences can contribute to the knowledge of the tat-gag genomic region in the circulating viruses in the Brazilian Pantanal, in addition to providing new information about the genetic diversity. In addition, the serological results demonstrate the greater sensitivity of the ELISAs used in this study compared to AGID for EIA diagnosis.
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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| Registros recuperados : 37 | |
| 1. |  | NOGUEIRA, M. S. R.; FREIRE FILHO, F. R. Avaliacao da eficiencia do isolamento biologico de virus do caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) atraves do uso de linhagens imunes. Fitopatologia Brasileira, v. 23, supl., p. 321, ago. 1998. Resumo, 618. Edição do CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 31., 1998, Fortaleza. Resumos.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 4. | | NOGUEIRA, M. S. R.; FREIRE FILHO, F. R.; ATHAYDE SOBRINHO, C. Avaliação de métodos de inoculação de vírus em caupi (Vigna Unguiculata(L.) Walp.). Fitopatologia Brasileira, v. 25, p. 446, supl., ago. 2000. Resumo 622. Edição do CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 33., 2001, Belém. Palestras e resumos.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | NOGUEIRA, M. S. R.; FREIRE FILHO, F. R.; SITTOLIN, I. M.; BRIOSO, P. S. T. Melhoramento genético do caupi para a resistência ao CPSMV, no Estado do Rio de Janeiro. Fitopatologia Brasileira, v. 26, supl., p. 520, ago., 2001. Edição do CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 34., 2001, São Pedro. Palestras e resumos.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 9. | | SITTOLIN, I. M.; SANTOS, F. D. S.; FREIRE FILHO, F. R.; NOGUEIRA, M. S. R. Reações de linhagens e cultivares locais de feijão-caupi à inoculação com os vírus CPSMV e CABMV. Tropical Plant Pathology, v. 33, supl., p. S 289, ago. 2008. Edição do CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 41., 2008, Belo Horizonte. Resumos...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | NOGUEIRA, M. do S. da R.; FREIRE, S. de C. L.; FREIRE FILHO, F. R.; BEZERRA, A. A. de C. Caracteristicas fenologicas de oito cultivares locais de caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.). In: CONGRESSO NACIONAL DE GENETICA, 44., 1998, Aguas de Lindoia. Programa e resumos... Aguas de Lindoia: SBG, 1998. Genetics and Molecular Biology, v. 21, n. 3, p. 217. Supplement. Resumo n. 46.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 13. | | SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; NOGUEIRA, M. S. R; FREIRE FILHO, F. R. Avaliação de genótipos de feijão-caupi para resistência ao CPSMV. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S259, ago. 2009. Suplemento. Ref. 879. Edição dos Resumos do 42° Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | NOGUEIRA, M. S. R.; OLIVEIRA, C. R. R.; SITTOLIN, I. M.; FREIRE FILHO, F. R.; BRIOSO, P. S. T. Quebra de resistência, em feijão-caupi, pela infecção mista do Cucumber mosaic virus e Cowpea aphid borne mosaic virus. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S279, ago. 2009. Suplemento. Ref. 950. Edição dos Resumos do 42° Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 17. | | BEZERRA, A. A. de C.; FREIRE FILHO, F. R.; ROCHA, F. M. R. da; NOGUEIRA, M. do S. da R. Variabilidade genetica e herdabilidade em caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) de crescimento determinado. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENETICA, 44., 1998, Aguas de Lindoia. Programa e resumos... Aguas de Lindoia: SBG, 1998. Genetics and Molecular Biology, v. 21, n. 3, p. 217. Supplement. Resumo n.47.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | NOGUEIRA, M. do S. da R.; MOURA, R. M. de; LEÃO, U. S.; FREIRE FILHO, F. R.; RIBEIRO, V. Q.; BRIOSO, P. S. T. Avaliação da resistência e da produção de massa seca em genótipos de feijão-caupi submetidos à infecção viral. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/220a.pdf. Acesso em: 07 ago. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | BERNARDO, K. A. da S.; CRUZIO, A. S.; FREIRE FILHO, F. R.; RIBEIRO, V. Q.; NOGUEIRA, M. do S. da R.; SANTOS, T. P. da S. Avaliação preliminar de famílias de F2:3 de feijão-caupi com de inflorescência composta. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/182a.pdf. Acesso em: 02 ago. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | NOGUEIRA, M. do S. da R.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, C. R. R. de; BARROS, G. B.; BRIOSO, P. S. T.; RIBEIRO, V. Q. Avaliação da reação de genótipos de feijão-caupi a infecção por vírus por meio dos efeitos qualitativos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil: [anais]. Búzios: SBMP, 2011. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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