| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Amazônia Oriental. Para informações adicionais entre em contato com cpatu.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
|
Data corrente: |
03/11/2022 |
|
Data da última atualização: |
12/12/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
|
Afiliação: |
CATERYNNE MELO KAUFFMANN, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ROSANA BLAWID, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
|
Título: |
Complete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
A cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. |
|
Palavras-Chave: |
Patchouli. |
|
Thesagro: |
Genoma; Vírus. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 01523naa a2200217 a 4500
001 2147984
005 2022-12-12
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5$2DOI
100 1 $aKAUFFMANN, C. M.
245 $aComplete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aA cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed.
650 $aGenoma
650 $aVírus
653 $aPatchouli
700 1 $aBOARI, A. de J.
700 1 $aSILVA, J. M. F.
700 1 $aBLAWID, R.
700 1 $aNAGATA, T.
773 $tArchives of Virology$gv. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 33 | |
| 6. |  | SOUZA, C. A. de; ROCHA, R. B.; MORAES, M. S.; SPINELLI, V. M.; ALVES, E. A. Caracterização da peneira média e percentual de grão tipo moca DE Coffea Canephora das variedades botânicas conilon e robusta. Enciclopédia Biosfera, Centro Científico Conhecer, Goiânia, v. 14 n. 26, p. 156-166, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
|    |
| 8. | | MORAES, M. S.; SANTANA, P. G.; SOUZA, C. A. de; DEPOLO, R. P.; ESPINDULA, M. C.; ROCHA, R. B. Desempenho das cultivares Robustas Amazônicos no município de Alta Floresta do Oeste, Rondônia. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 11.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2021, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2021. p. 21. Editores: Ana Karina Dias Salman; Henrique Nery Cipriani.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 10. | | SOUZA, C. A. de; TEIXEIRA, A. L.; TORRES, J. D.; SILVA, C. A.; ESPINDULA, M. C.; ROCHA, R. B. Adaptability and stability of Coffea arabica lines in the western Amazon. Coffee Science, v. 14, n. 2, p. 240-249, apr./jun. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 12. | | SANTANA, P. G.; SPINELLI, V. M.; ANDRADE, T. R.; SOUZA, C. A. de; MORAES, M. S.; ROCHA, R. B. Avaliação da variabilidade de características foliares entre genótipos de Coffea canephora. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 11.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2021, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2021. p. 57-62. Editores: Ana Karina Dias Salman; Henrique Nery Cipriani.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 13. | | MORAIS, J. A. de; ROCHA, R. B.; ALVES, E. A.; ESPINDULA, M. C.; TEIXEIRA, A. L.; SOUZA, C. A. de. Beverage quality of Coffea canephora genotypes in the western Amazon, Brazil. Acta Scientiarum. Agronomy, v. 43, e52095, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 16. | | SANTOS, M. R. A. dos; SOUZA, C. A. de; ROCHA, J. F. da; ARAUJO, L. V. de; ESPINDULA, M. C. Comparison of economic efficiency between in vitro and field methods for vegetative propagation of Coffea Canephora. Australian Journal of Basic and Applied Sciences, Pakistan, v. 9, n. 20, p. 1-7, jun. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 17. | | SOUZA, C. A. de; MAGALHÃES, G. M. de O.; SOUZA, P.; PAZ, E. S.; SANTOS, M. R. A. dos. Padrão de crescimento de calos friáveis de folhas, entrenó e nó de Capsicum annuum var. annuum cv. iberaba Jalapeño. In: JORNADA CIENTÍFICA CEDSA, 10., 2015, Porto Velho. [Anais...]. Porto Velho: Unir, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 18. | | ANDRADE, T. R.; RODRIGUES, R. F.; SANTANA, P. G.; DEPOLO, R. P.; SOUZA, C. A. de; ROCHA, R. B. Variabilidade genética entre matrizes de Coffea canephora das variedades botânicas Conilon e Robusta. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 11.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2021, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2021. p. 25. Editores: Ana Karina Dias Salman; Henrique Nery Cipriani.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 19. | | DEPOLO, R. P.; SOUZA, C. A. de; MORAES, M. S.; SANTANA, P. G.; SPINELLI, V. M.; ROCHA, R. B. Utilização de procedimentos de polinização in vitro para caracterização da autoincompatibilidade gametofítica do cafeeiro Coffea canephora. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 11.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2021, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2021. p. 24. Editores: Ana Karina Dias Salman; Henrique Nery Cipriani.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 20. | | SOUZA, C. A. de; ROCHA, R. B.; ALVES, E. A.; TEIXEIRA, A. L.; DALAZEN, J. R.; FONSECA, A. F. A. da. Characterization of beverage quality in Coffea canephora Pierre ex A. Froehner. Coffee Science, Lavras, v. 13, n. 2, p. 210-218, apr./jun. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| Registros recuperados : 33 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
