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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
05/01/2012 |
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Data da última atualização: |
19/07/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. |
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Afiliação: |
FRANCELI R. KULCHESKI, UFRGS; LUIZ F. V. DE OLIVEIRA, UFRGS; LORRAYNE G. MOLINA, UFRGS; MAURÍCIO P. ALMERÃO, UFRGS; FABIANA A. RODRIGUES; JULIANA MARCOLINO; JOICE F. BARBOSA; RENATA STOLF MOREIRA; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; LEANDRO C. NASCIMENTO, UNICAMP; MARCELO F. CARAZZOLLE, UNICAMP; GONÇALO A. G. PEREIRA, UNICAMP; ROGÉRIO MARGIS, UFRGS. |
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Título: |
Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 12, article 307, jun. 2011. |
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Páginas: |
17 p. |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-12-307 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also different for the distinct genotypes submitted to the pathogen stress. Most miRNAs were down regulated during the fungus infection in the susceptible genotype; however, in the resistant genotype, most miRNAs did not vary during rust attack. A prediction of the putative targets was carried out for conserved and novel miRNAs families. Conclusions: Validation of our results with quantitative RT-qPCR revealed that Solexa sequencing is a powerful tool for miRNA discovery. The identification of differentially expressed plant miRNAs provides molecular evidence for the possible involvement of miRNAs in the process of water deficit- and rust-stress responses. MenosBackground: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also di... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Deficiência hídrica; Gene marcador; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Soil water deficit; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
LEADER 03244naa a2200385 a 4500
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005 2024-07-19
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520 $aBackground: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also different for the distinct genotypes submitted to the pathogen stress. Most miRNAs were down regulated during the fungus infection in the susceptible genotype; however, in the resistant genotype, most miRNAs did not vary during rust attack. A prediction of the putative targets was carried out for conserved and novel miRNAs families. Conclusions: Validation of our results with quantitative RT-qPCR revealed that Solexa sequencing is a powerful tool for miRNA discovery. The identification of differentially expressed plant miRNAs provides molecular evidence for the possible involvement of miRNAs in the process of water deficit- and rust-stress responses.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 1. |  | FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; CARANHATO, A. L. H.; MARIN, S. R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Correlação entre a porcentagem de alinhamentos únicos em bibliotecas de RNAseq de soja sob deficit hídrico com diferentes tamanhos de fragmento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 685-687.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 2. | | MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; MARIN, S. R. R.; ANDREATTA, E. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MERTZ-HENNING, L. M.; HARMON, F.; NEPOMUCENO, A. L. Análise in sílico de splicing alternativo em Arabidopsis thaliana DBR1 mutante. In: CONGRESO DE LA SOJA DEL MERCOSUR, 7.; A TODA SOJA, 2019, Rosario. Reformular la Soja para Impulsar una Cadena de Conocimiento: [anais]. Rosario: ACSOJA, 2019. MERCOSOJA, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 3. | | PASSOS, G. P.; BARBOSA, D. A.; FERREIRA, L. C.; MORAES, L. A. C.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B.; MERTZ-HENNING, L. M. Respostas fisiológicas e crescimento de plantas de soja submetidas ao estresse por encharcamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 4. | | BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; MANDARINO, J. M. G.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Quantificação dos níveis de inibidor de tripsina em folhas de eventos de soja GM com fator de transcrição ABA induzido. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 675-678.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 5. | | BARBOSA. D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; CARANHATO, A. L. H.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Seleção de plantas de soja geneticamente modificadas para resistência ao herbicida glufosinato de amônio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 672-674.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 6. | | MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; ANDREATA, E. C.; CARANHATO, A. L. H.; MARIN, S. R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Influência do tamanho de reads e presença de duplicatas não naturais em bibliotecas de RNA-Seq de soja sob deficit hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 688-690.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 7. | | BARBOSA, D. A.; PASSOS, G. P.; FERREIRA, L. C.; OLIVEIRA, M. C. N.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N. Influência do déficit hídrico sobre parâmetros agronômicos das cultivares de soja Embrapa 48 e BR 16 em condições de campo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 8. | | HUTH, C.; BARBOSA, D. A.; PASSOS, G. P.; MERTZ-HENNING, L. M.; KRZYZANOWSKI, F. C.; LOPES, S. J.; HENNING, F. A. Deterioração por umidade em sementes de soja com variação no conteúdo de lignina no tegumento. Informativo ABRATES, Brasília, v. 25, n.2, set. 2015. Edição de Anais d XIX Congresso Brasileiro de Sementes, Foz do Iguaçu, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 9. | | MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; HENNING, F. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L. Transformação genética de soja com gene chave da biossíntese do ABA e os reflexos na qualidade e desempenho das sementes. Informativo ABRATES, Londrina, v. 27, n.2, ago. 2017. Número especial. Edição dos Resumos do XX Congresso Brasileiro de Sementes, Foz do Iguaçu, 2017. p. 229.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; CARNEIRO, E. A.; QUEIROZ, A. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; HENNING, F. A.; NEPOMUCENO, A. L. Desempenho de soja GM para a tolerância à seca sob estresse osmótico na germinação. Informativo ABRATES, Londrina, v. 27, n.2, ago. 2017. Número especial. Edição dos Resumos do XX Congresso Brasileiro de Sementes, Foz do Iguaçu, 2017. p. 222.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 11. | | ANDREATA, E. C.; COUTINHO, I. D.; MARIN, S. R. R.; BELINATO, C. F.; MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; NEPOMUCENO, A. L.; COLNAGO, L. A.; MERTZ-HENNING, L. M. ACETIC ACID APPLICATION TO ENHANCE DROUGHT TOLERANCE IN SOYBEAN In: Congresso Brasileiro de Genética, 65., 2019, Lindóia. [S. l.: s. n.], 2019. Ebook. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; QUEIROZ, A. A.; CARNEIRO, E. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Análise comparativa entre parâmetros morfofisiológicos de soja GM e convencional sob déficit hídrico. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA, 36., 2017, Londrina, PR. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2017. p. 183-185. (Embrapa Soja. Documentos, 388). Editado por Alvadi Antonio Balbinot Junior, Fernando Augusto Henning, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 13. | | CARANHATO, A. L. H.; BRAGA, P.; BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; OLIVEIRA, M. F.; MERTZ-HENNING, L. M.; MELO, C. L. P.; NEPOMUCENO, A. L. Respostas fisiológicas para a tolerância a seca em diferentes genótipos de soja obtidos a partir da introgressão da construção 35S:AtAREB1FL. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. P. 700-702.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 14. | | SILVA, T. W.; MARINHO, J. P.; BARBOSA, D. A.; PASSOS, G. P.; FERREIRA, L. C.; MORAES, L. A. C.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N. Mecanismos de resposta da cultivar de soja BR 16 submetida ao déficit hídrico. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 10., 2015, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2015. p. 239-245.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 15. | | JOAQUIM, P. I. L.; MOLINARI, M. D. C.; MARIN, S. R. R.; BARBOSA, D. A.; VIANA, A. J. C.; RECH, E. L.; HENNING, F. A.; NEPOMUCENO, A. L.; MERTZ-HENNING, L. M. Nitrogen compounds transporters: candidates to increase the protein content in soybean seeds. Journal of Plant Interactions, v. 17, n. 1, p. 309-318, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 16. | | BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; ROSA, J.; ANDREATTA, E. C.; MACEDO, C. R.; BARBOSA, E. G. G.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Índice SPAD e rendimento como descritores de sensibilidade ao déficit hídrico em cultivares e linhagens transgênicas de soja. In: CONGRESO DE LA SOJA DEL MERCOSUR, 7.; A TODA SOJA, 2019, Rosario. Reformular la Soja para Impulsar una Cadena de Conocimiento: [anais]. Rosario: ACSOJA, 2019. MERCOSOJA, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 17. | | ANDREATA, E. C.; MOLINARI, M. D. C.; MARIN, S. R. R.; BARBOSA, D. A.; QUEIROZ, A. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L.; MERTZ-HENNING, L. M. Efeito do genótipo e da construção gênica na eficiência de transformação de soja via Agrobacterium tumefaciens. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 12., 2017, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2017. p. 54-64.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | QUEIROZ, A. A.; MARINHO, J. P.; CARANHATO, A. L. H.; BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M.; ALMEIDA, L. C. M.; SANTOS, E. D.; SOUZA, K. R.; ANDREATA, E. C.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação de germinação dos genótipos de soja sob diferentes potenciais osmóticos induzidos por polietilenoglicol 8000. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 12., 2017, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2017. p. 177-184.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; CARNEIRO, E. A.; QUEIROZ, A. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Número de cópias e padrão de segregação em soja geneticamente modificada via Agrobacterium. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA, 36., 2017, Londrina, PR. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2017. p. 179-181. (Embrapa Soja. Documentos, 388). Editado por Alvadi Antonio Balbinot Junior, Fernando Augusto Henning, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | BARBOSA, D. A.; MOLINARI, M. D. C.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; CARNEIRO, E. A.; QUEIROZ, A. A.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Eficiência de transformação via Agrobacterium tumefaciens e análise de segregação de eventos transgênicos obtidos a partir de diferentes genótipos de soja. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA, 36., 2017, Londrina, PR. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2017. p. 173-175. (Embrapa Soja. Documentos, 388). Editado por Alvadi Antonio Balbinot Junior, Fernando Augusto Henning, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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