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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
20/03/2012 |
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Data da última atualização: |
01/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P.; ACOSTA, J. J.; PETER, G. F.; DAVIS, J. M.; GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; KIRST, M. |
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Afiliação: |
MÁRCIO F. R. JÚNIOR RESENDE, University of Florida; University of Florida; University of Florida; University of Florida; UFV; DARIO GRATTAPAGLIA, CENARGEN; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; University of Florida. |
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Título: |
Accelerating the domestication of trees using genomic selection: accuracy of prediction models across ages and environments. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
New Phytologist, v. 193, p. 617-624, 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic selection is increasingly considered vital to accelerate genetic improvement. However, it is unknown how accurate genomic selection prediction models remain when used across environments and ages. This knowledge is critical for breeders to apply this strategy in genetic improvement. Here, we evaluated the utility of genomic selection in a Pinus taeda population of c. 800 individuals clonally replicated and grown on four sites, and genotyped for 4825 singlenucleotide polymorphism (SNP) markers. Prediction models were estimated for diameter and height at multiple ages using genomic random regression best linear unbiased predictor (BLUP). Accuracies of prediction models ranged from 0.65 to 0.75 for diameter, and 0.63 to 0.74 for height. The selection efficiency per unit time was estimated as 53?112% higher using genomic selection compared with phenotypic selection, assuming a reduction of 50% in the breeding cycle. Accuracies remained high across environments as long as they were used within the same breeding zone. However, models generated at early ages did not perform well to predict phenotypes at age 6 yr. These results demonstrate the feasibility and remarkable gain that can be achieved by incorporating genomic selection in breeding programs, as long as models are used at the relevant selection age and within the breeding zone in which they were estimated. |
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Palavras-Chave: |
Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Pinus Taeda. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aGenomic selection is increasingly considered vital to accelerate genetic improvement. However, it is unknown how accurate genomic selection prediction models remain when used across environments and ages. This knowledge is critical for breeders to apply this strategy in genetic improvement. Here, we evaluated the utility of genomic selection in a Pinus taeda population of c. 800 individuals clonally replicated and grown on four sites, and genotyped for 4825 singlenucleotide polymorphism (SNP) markers. Prediction models were estimated for diameter and height at multiple ages using genomic random regression best linear unbiased predictor (BLUP). Accuracies of prediction models ranged from 0.65 to 0.75 for diameter, and 0.63 to 0.74 for height. The selection efficiency per unit time was estimated as 53?112% higher using genomic selection compared with phenotypic selection, assuming a reduction of 50% in the breeding cycle. Accuracies remained high across environments as long as they were used within the same breeding zone. However, models generated at early ages did not perform well to predict phenotypes at age 6 yr. These results demonstrate the feasibility and remarkable gain that can be achieved by incorporating genomic selection in breeding programs, as long as models are used at the relevant selection age and within the breeding zone in which they were estimated.
650 $aPinus Taeda
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700 1 $aKIRST, M.
773 $tNew Phytologist$gv. 193, p. 617-624, 2012.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
08/09/2015 |
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Data da última atualização: |
14/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
GONÇALVES, Z. S.; INVENÇÃO, D. L R. S. da; REBOUÇAS, T. A.; ROQUE, R. de L.; LEDO, C. A. da S.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P. |
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Afiliação: |
ZALMAR SANTANA GONÇALVES, UESF; DANIEL RIBEIRO SILVA DA INVENÇÃO, UFRB; TAMYRES AMORIM REBOUÇAS, UFRB; RAFAELLA DE LIMA ROQUE, UESF; CARLOS ALBERTO DA SILVA LEDO, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF. |
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Título: |
Análise multivariada de dados agronômicos, físico-químicos e moleculares em genótipos de plátanos. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO E DO CARIBE DE BANANAS E PLÁTANOS, 3., 2015. Corupá. Musáceas no subtrópico: desafios e oportunidades frente à variabilidade climática. Corupá, SC: Rede da America Latina e Caribe para a Pesquisa e Desenvolvimento da Banana - MUSALAC, 2015. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os plátanos são cultivados no Brasil principalmente nas regiões Norte e Nordeste, com algumas áreas de cultivo no Centro-Oeste e Sudeste. Os plátanos se diferenciam das bananas basicamente devido ao maior conteúdo de amido e ao seu modo de preparo. Objetivou-se estimar a diversidade genética entre 10 genótipos de plátanos usando simultaneamente dados quantitativos e marcadores moleculares ISSR, bem como selecionar as variáveis que mais contribuem para a caracterização dos genótipos por meio dos critérios de Singh, Jolliffe e análises das variáveis canônicas. |
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Palavras-Chave: |
Gentótipo. |
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Thesagro: |
Banana. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/129166/1/Analise-multivariada.pdf
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Marc: |
LEADER 01445nam a2200205 a 4500
001 2023450
005 2016-03-14
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aGONÇALVES, Z. S.
245 $aAnálise multivariada de dados agronômicos, físico-químicos e moleculares em genótipos de plátanos.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESSO LATINO-AMERICANO E DO CARIBE DE BANANAS E PLÁTANOS, 3., 2015. Corupá. Musáceas no subtrópico: desafios e oportunidades frente à variabilidade climática. Corupá, SC: Rede da America Latina e Caribe para a Pesquisa e Desenvolvimento da Banana - MUSALAC$c2015
520 $aOs plátanos são cultivados no Brasil principalmente nas regiões Norte e Nordeste, com algumas áreas de cultivo no Centro-Oeste e Sudeste. Os plátanos se diferenciam das bananas basicamente devido ao maior conteúdo de amido e ao seu modo de preparo. Objetivou-se estimar a diversidade genética entre 10 genótipos de plátanos usando simultaneamente dados quantitativos e marcadores moleculares ISSR, bem como selecionar as variáveis que mais contribuem para a caracterização dos genótipos por meio dos critérios de Singh, Jolliffe e análises das variáveis canônicas.
650 $aBanana
653 $aGentótipo
700 1 $aINVENÇÃO, D. L R. S. da
700 1 $aREBOUÇAS, T. A.
700 1 $aROQUE, R. de L.
700 1 $aLEDO, C. A. da S.
700 1 $aFERREIRA, C. F.
700 1 $aAMORIM, E. P.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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