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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
02/08/2023 |
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Data da última atualização: |
26/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, T. G.; FONSECA, F. C. de A.; ALVES, G. S. C.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. |
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Afiliação: |
TAÍSA GODOY GOMES, Universidade de Brasília; FERNANDO CAMPOS DE ASSIS FONSECA, Universidade de Brasília; GABRIEL SERGIO COSTA ALVES, Universidade de Brasília; FELIX GONCALVES DE SIQUEIRA, CNPAE; ROBERT NEIL GERARD MILLER, Universidade de Brasília. |
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Título: |
Development of reference genes for RT-qPCR analysis of gene expression in Pleurotus pulmonarius for biotechnological applications. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, n. 12296, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39115-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Jatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as analysis of target genes for application in biorefinery models. MenosJatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Jatropha Curcas; Refinaria. |
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Thesaurus Nal: |
Oilseed crops. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155580/1/Development-of-reference.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
19/05/2021 |
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Data da última atualização: |
08/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
MOREIRA, J. M. M. A. P.; SIMIONI, F. J.; BUSCHINELLI, C. C. de A. |
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Afiliação: |
JOSE MAURO M AVILA PAZ MOREIRA, CNPF; FLÁVIO JOSÉ SIMIONI, Universidade do Estado de Santa Catarina; CLAUDIO CESAR DE A BUSCHINELLI, CNPMA. |
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Título: |
A viabilização econômica da cultura do eucalipto. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
In: OLIVEIRA, E. B. de; PINTO JUNIOR, J. E. (Ed.). O eucalipto e a Embrapa: quatro décadas de pesquisa e desenvolvimento. Brasília, DF: Embrapa, 2021. cap. 25. |
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Páginas: |
p. 907-939. |
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Descrição Física: |
il. color. |
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ISBN: |
978-65-87380-04-9 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
RESUMO. Uma parcela significativa dos trabalhos de economia florestal desenvolvidos no âmbito da Embrapa tem por base estudos de cadeias produtivas e análises de custos de produção, em condições determinísticas e de riscos. No presente capítulo, estes temas foram discutidos tendo por foco plantações de eucalipto destinadas ao uso energético, com destaque para os principais fatores que devem ser observados no estudo dos mesmos. As informações foram obtidas em entrevistas e reuniões com produtores e técnicos envolvidos nas cadeias produtivas dos polos de produção selecionados, painéis de custos para levantamento dos sistemas modais de produção, além de outras técnicas de pesquisa, objetivando o seu completo mapeamento. Distintas realidades foram observadas, desde a produção em pequena escala, com baixo uso de insumos e em unidades familiares para fornecimento de lenha que ocorrem em Santa Cruz do Sul, RS, como a produção em alta escala e de alto padrão tecnológico verificada em Minas Gerais destinada à produção de carvão vegetal. Por outro lado, uma situação mais consolidada em Itapeva, SP e outra com expansão nas regiões de Rio Verde e Cristalina em Goiás possibilitaram identificar importantes fatores que são relevantes para o bom desempenho da atividade. A descrição da estrutura de organização e funcionamento da cadeia produtiva em cada polo estudado e uma análise detalhada dos aspectos econômicos da atividade, considerando alguns dos fatores que mais impactam sobre sua viabilidade foram apresentados. Por fim, de posse de um conjunto de informações e da experiência acumulada, foram apresentadas algumas recomendações aos produtores que desejam ingressar na atividade, ou mesmo aos que já estão, visando o aumento de seu resultado econômico e sustentabilidade de seus negócios.
ABSTRACT. Eucalypts are the mostly commonly planted tree species in the Brazilian forestry sector. The economic success of the activity depends on a set of factors that cross-cut the entire supply chain, including production costs and risks associated with forests for energy use. Thus, the aims of this chapter are to present the experience of researchers analyzing the eucalypt supply chain in several production centers in Brazil: Itapeva, São Paulo; Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul; the central region of Minas Gerais; Rio Verde, Goiás; and Cristalina, Goiás. In order to provide a complete overview, information was collected through interviews and meetings with producers and technicians involved in the supply chain at each center, along with economic analyses to assess the modal production system, and other techniques. A description of the organization?s structure and supply chain operation is provided for each center, along with a detailed analysis of the economic aspects of the activity, considering some crucial factors that have a significant impact on viability. Diff erent contextual realities can be observed: from small-scale production with low use of inputs for firewood on small farms in Santa Cruz do Sul, to large-scale, high-tech charcoal production systems in Minas Gerais. On the other hand, a more established situation in Itapeva, SP and another in expansion in Goiás enabled us to identify important factors that are relevant to improve performance. Finally, based on this background and accumulated experience, some recommendations are suggested for producers who wish to participate in the activity, or those who already do so, with insights on how to increase economic results and business sustainability. MenosRESUMO. Uma parcela significativa dos trabalhos de economia florestal desenvolvidos no âmbito da Embrapa tem por base estudos de cadeias produtivas e análises de custos de produção, em condições determinísticas e de riscos. No presente capítulo, estes temas foram discutidos tendo por foco plantações de eucalipto destinadas ao uso energético, com destaque para os principais fatores que devem ser observados no estudo dos mesmos. As informações foram obtidas em entrevistas e reuniões com produtores e técnicos envolvidos nas cadeias produtivas dos polos de produção selecionados, painéis de custos para levantamento dos sistemas modais de produção, além de outras técnicas de pesquisa, objetivando o seu completo mapeamento. Distintas realidades foram observadas, desde a produção em pequena escala, com baixo uso de insumos e em unidades familiares para fornecimento de lenha que ocorrem em Santa Cruz do Sul, RS, como a produção em alta escala e de alto padrão tecnológico verificada em Minas Gerais destinada à produção de carvão vegetal. Por outro lado, uma situação mais consolidada em Itapeva, SP e outra com expansão nas regiões de Rio Verde e Cristalina em Goiás possibilitaram identificar importantes fatores que são relevantes para o bom desempenho da atividade. A descrição da estrutura de organização e funcionamento da cadeia produtiva em cada polo estudado e uma análise detalhada dos aspectos econômicos da atividade, considerando alguns dos fatores que mais impactam sobre sua viab... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Embrapa Florestas. |
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Thesagro: |
Cadeia Produtiva; Carvão Vegetal; Cavaco; Energia; Eucalipto; Historia; Lenha; Pesquisa Florestal; Produção Florestal. |
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Thesaurus NAL: |
Eucalyptus. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/223339/1/EmbrapaFlorestas-2021-LV-EucaliptoEmbrapa-cap25.pdf
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Marc: |
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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