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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
11/05/2020 |
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Data da última atualização: |
15/07/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARMO, C. D. do; SOUSA, M. B. e; SILVA, P. P. dos S.; OLIVEIRA, G. A. F.; CEBALLOS, H.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
CÁTIA DIAS DO CARMO; MASSAINE BANDEIRA E SOUSA; PRISCILA PATRÍCIA DOS SANTOS SILVA; GILMARA ALVARENGA FACHARDO OLIVEIRA; HERNÁN CEBALLOS; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Identification and validation of mutation points associated with waxy phenotype in cassava. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Plant Biology, v. 20, p.164, 2020. |
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ISSN: |
1471-2229 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
BACKGROUND: The granule-bound starch synthase I (GBSSI) enzyme is responsible for the synthesis of amylose, and therefore, its absence results in individuals with a waxy starch phenotype in various amylaceous crops. The validation of mutation points previously associated with the waxy starch phenotype in cassava, as well as the identification of alternative mutant alleles in the GBSSI gene, can allow the development of molecular-assisted selection to introgress the waxy starch mutation into cassava breeding populations. RESULTS: A waxy cassava allele has been identified previously, associated with several SNPs. A particular SNP (intron 11) was used to develop SNAP markers for screening heterozygote types in cassava germplasm. Although the molecular segregation corresponds to the expected segregation at 3:1 ratio (dominant gene for the presence of amylose), the homozygotes containing the SNP associated with the waxy mutation did not show waxy phenotypes. To identify more markers, we sequenced the GBSS gene from 89 genotypes, including some that were segregated from a cross with a line carrying the known waxy allele. As a result, 17 mutations in the GBSSI gene were identified, in which only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype. The evaluation of mutation points by discriminant analysis of principal component analysis (DAPC) also did not completely discriminate the waxy individuals. Therefore, we developed Kompetitive Allele Specific PCR (KASP) markers that allowed discrimination between WX and wx alleles. The results demonstrated the non-existence of heterozygous individuals of the MeWxEx6-del-C deletion in the analyzed germplasm. Therefore, the deletion MeWxEx6-del-C should not be used for assisted selection in genetic backgrounds different from the original source of waxy starch. Also, the alternative SNPs identified in this study were not associated with the waxy phenotype when compared to a panel of accessions with high genetic diversity. CONCLUSION: Although the GBSSI gene can exhibit several mutations in cassava, only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype in the original AM206-5 source. MenosBACKGROUND: The granule-bound starch synthase I (GBSSI) enzyme is responsible for the synthesis of amylose, and therefore, its absence results in individuals with a waxy starch phenotype in various amylaceous crops. The validation of mutation points previously associated with the waxy starch phenotype in cassava, as well as the identification of alternative mutant alleles in the GBSSI gene, can allow the development of molecular-assisted selection to introgress the waxy starch mutation into cassava breeding populations. RESULTS: A waxy cassava allele has been identified previously, associated with several SNPs. A particular SNP (intron 11) was used to develop SNAP markers for screening heterozygote types in cassava germplasm. Although the molecular segregation corresponds to the expected segregation at 3:1 ratio (dominant gene for the presence of amylose), the homozygotes containing the SNP associated with the waxy mutation did not show waxy phenotypes. To identify more markers, we sequenced the GBSS gene from 89 genotypes, including some that were segregated from a cross with a line carrying the known waxy allele. As a result, 17 mutations in the GBSSI gene were identified, in which only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype. The evaluation of mutation points by discriminant analysis of principal component analysis (DAPC) also did not completely discriminate the waxy individuals. Therefore, we developed Kompetitive Allele Specific PCR... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Florestas. Para informações adicionais entre em contato com cnpf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
27/04/2017 |
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Data da última atualização: |
27/04/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SILVA, D. da. |
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Título: |
Influência da armazenagem de sementes no vigor germinativo e qualidade de mudas de espécies florestais para o Estado de Mato Grosso. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
2015. |
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Páginas: |
165 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Engenharia Florestal, Área de Concentração em Silvicultura) - Setor de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Paraná, Curitiba. Orientador: Alessandro Camargo Angelo; Coorientadores: Cristiane Vieira Helm e Sérgio Gaiad. |
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Conteúdo: |
O objetivo desta pesquisa foi de avaliar a influência da armazenagem de sementes no vigor germinativo e qualidade de mudas de espécies florestais para o estado de mato grosso. Foram estudadas três espécies ortodoxas (pinho cuiabano, cerejeira e cedro) e uma espécie recalcitrante (seringueira). Para as espécies ortodoxas foram pesquisadas as alterações fisiológicas e bioquímicas em sementes durante o armazenamento em três condições ambientais (câmara seca, câmara úmida e ambiente não controlado (laboratório) e sua influência na produção de mudas. Para a espécie recalcitrante (seringueira) foi avaliada a qualidade fisiológica de sementes durante secagem natural e o potencial da predição da viabilidade e de componentes bioquímicos durante o período por meio da utilização da técnica do infravermelho próximo (NIR). As sementes ortodoxas foram coletadas em uma área de produção não certificada do experimento de estudos de espécies nativas, localizada no campo experimental da EMPAER-MT, em São José dos Quatro Marcos, MT. As sementes recalcitrantes foram coletadas próximo ao ponto de máxima capacidade de maturidade fisiológica em pomares do clone IAN 873 localizado nas plantações Michelin em Itiquira MT. O lote das espécies logo após a coleta foi imediatamente enviados a UFPR para a realização dos estudos. O vigor das sementes de pinho cuiabano foi maior para as sementes armazenadas em câmara seca e úmida, as quais apresentaram os menores valores de TMG ao final do armazenamento. As mudas oriundas de sementes sem o efeito das condições de armazenamento apresentaram maior vigor e emergência de plântulas em relação aos demais tratamentos. Para a Cerejeira o armazenamento em ambiente não controlado apresentou menor grau de umidade no período refletindo na menor viabilidade e vigor que foi mais expressivo para as mudas oriundas de sementes sem o efeito das condições de armazenamento. As sementes de cedro apresentaram viabilidade alta antes do armazenamento reduzindo significativamente ao longo do tempo e das condições de armazenamento. Para a maioria das variáveis morfológicas houve forte correlação com o tempo médio de emergência de plântulas. Para as três espécies não houve alterações significativas para os principais componentes bioquímicos durante o período e condições de armazenamento. As avaliações para as sementes clonais de seringueira mostraram que, após 37 dias em ambiente não controlado a viabilidade foi baixa. Durante o período avaliado ocorreu uma redução do teor de lipídios totais, sendo este o principal componente bioquímico correlacionado ao declínio da viabilidade e vigor das sementes. A técnica de predição do infravermelho (NIR) pelo método dos componentes principais foi eficiente para separar as sementes por período de secagem natural (grau de umidade) os quais podem estimar a viabilidade indiretamente. MenosO objetivo desta pesquisa foi de avaliar a influência da armazenagem de sementes no vigor germinativo e qualidade de mudas de espécies florestais para o estado de mato grosso. Foram estudadas três espécies ortodoxas (pinho cuiabano, cerejeira e cedro) e uma espécie recalcitrante (seringueira). Para as espécies ortodoxas foram pesquisadas as alterações fisiológicas e bioquímicas em sementes durante o armazenamento em três condições ambientais (câmara seca, câmara úmida e ambiente não controlado (laboratório) e sua influência na produção de mudas. Para a espécie recalcitrante (seringueira) foi avaliada a qualidade fisiológica de sementes durante secagem natural e o potencial da predição da viabilidade e de componentes bioquímicos durante o período por meio da utilização da técnica do infravermelho próximo (NIR). As sementes ortodoxas foram coletadas em uma área de produção não certificada do experimento de estudos de espécies nativas, localizada no campo experimental da EMPAER-MT, em São José dos Quatro Marcos, MT. As sementes recalcitrantes foram coletadas próximo ao ponto de máxima capacidade de maturidade fisiológica em pomares do clone IAN 873 localizado nas plantações Michelin em Itiquira MT. O lote das espécies logo após a coleta foi imediatamente enviados a UFPR para a realização dos estudos. O vigor das sementes de pinho cuiabano foi maior para as sementes armazenadas em câmara seca e úmida, as quais apresentaram os menores valores de TMG ao final do armazenamento. As ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Espécie arbórea; Infravermelho; Orthodox seeds; Seed viability; Semente ortodoxa; Semente recalcitrante; Viabilidade. |
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Thesagro: |
Armazenamento; Essência florestal; Muda; Qualidade; Semente. |
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Thesaurus NAL: |
Near-infrared spectroscopy; Recalcitrant seeds. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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500 $aTese (Doutorado em Engenharia Florestal, Área de Concentração em Silvicultura) - Setor de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Paraná, Curitiba. Orientador: Alessandro Camargo Angelo; Coorientadores: Cristiane Vieira Helm e Sérgio Gaiad.
520 $aO objetivo desta pesquisa foi de avaliar a influência da armazenagem de sementes no vigor germinativo e qualidade de mudas de espécies florestais para o estado de mato grosso. Foram estudadas três espécies ortodoxas (pinho cuiabano, cerejeira e cedro) e uma espécie recalcitrante (seringueira). Para as espécies ortodoxas foram pesquisadas as alterações fisiológicas e bioquímicas em sementes durante o armazenamento em três condições ambientais (câmara seca, câmara úmida e ambiente não controlado (laboratório) e sua influência na produção de mudas. Para a espécie recalcitrante (seringueira) foi avaliada a qualidade fisiológica de sementes durante secagem natural e o potencial da predição da viabilidade e de componentes bioquímicos durante o período por meio da utilização da técnica do infravermelho próximo (NIR). As sementes ortodoxas foram coletadas em uma área de produção não certificada do experimento de estudos de espécies nativas, localizada no campo experimental da EMPAER-MT, em São José dos Quatro Marcos, MT. As sementes recalcitrantes foram coletadas próximo ao ponto de máxima capacidade de maturidade fisiológica em pomares do clone IAN 873 localizado nas plantações Michelin em Itiquira MT. O lote das espécies logo após a coleta foi imediatamente enviados a UFPR para a realização dos estudos. O vigor das sementes de pinho cuiabano foi maior para as sementes armazenadas em câmara seca e úmida, as quais apresentaram os menores valores de TMG ao final do armazenamento. As mudas oriundas de sementes sem o efeito das condições de armazenamento apresentaram maior vigor e emergência de plântulas em relação aos demais tratamentos. Para a Cerejeira o armazenamento em ambiente não controlado apresentou menor grau de umidade no período refletindo na menor viabilidade e vigor que foi mais expressivo para as mudas oriundas de sementes sem o efeito das condições de armazenamento. As sementes de cedro apresentaram viabilidade alta antes do armazenamento reduzindo significativamente ao longo do tempo e das condições de armazenamento. Para a maioria das variáveis morfológicas houve forte correlação com o tempo médio de emergência de plântulas. Para as três espécies não houve alterações significativas para os principais componentes bioquímicos durante o período e condições de armazenamento. As avaliações para as sementes clonais de seringueira mostraram que, após 37 dias em ambiente não controlado a viabilidade foi baixa. Durante o período avaliado ocorreu uma redução do teor de lipídios totais, sendo este o principal componente bioquímico correlacionado ao declínio da viabilidade e vigor das sementes. A técnica de predição do infravermelho (NIR) pelo método dos componentes principais foi eficiente para separar as sementes por período de secagem natural (grau de umidade) os quais podem estimar a viabilidade indiretamente.
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Embrapa Florestas (CNPF) |
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