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| Registros recuperados : 11 | |
| 2. |  | CAETANO, P.; SANTANA, C. G.; CARNEIRO, R. M. D. G.; SA, M. F. G. de; OLIVEIRA, J. T. A.; REIS, A. M. dos. Análise proteômica de raízes de feijão-de-corda (Vigna unguiculata) infectadas com o nematóide Meloidogyne incognita. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 276.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | MASCARENHAS, Y. S.; GONÇALVES, G. de M. O.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; CORRECHEL, V.; SILVA, M. A. S. da. Condutividade Hidráulica Saturada em áreas de várzeas tropicais sob cultivo de arroz irrigado por inundação. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 122. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 4. | | GONÇALVES, G. de M. O.; MASCARENHAS, Y. S.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, M. A. S. da. Composição da solução do solo em produção de arroz irrigado em várzeas tropicais utilizando diferentes doses e fontes nitrogenadas. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 101. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 5. | | SILVA, M. A. S. da; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; GONÇALVES, G. de M. O.; CAETANO, P. H. P.; MASCARENHAS, Y. S. Nitrato e amônio no solo: efeitos na eficiência agronômica e na produtividade de arroz irrigado tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 9., 2015, Pelotas. Ciência e tecnologia para otimização da orizicultura: anais. Brasília, DF: Embrapa; Pelotas: Sosbai, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | CAETANO, P. H. P.; GONÇALVES, G. de M. O.; MASCARENHAS, Y. S.; FERREIRA, A. C. B.; SILVA, M. A. S. da. Caracterização de Latossolo Vermelho de cerrado sob manejo convencional: efeitos nas propriedades químicas e físicas do solo em profundidade. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 79. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 7. | | MASCARENHAS, I. S.; GONÇALVES, G. de M. O.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; CORRECHEL, V.; SILVA, M. A. S. da. Características físicas de solos de várzea e produtividade do arroz irrigado por inundação. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 100. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | CAETANO, P.; PAES, N. S.; SALES, R. M. O. B.; DA SILVA, F. R.; CARNEIRO, R. M. D. G.; GROSSI DE SÁ, M. F.; MEHTA, A. Caracterização de bibliotecas subtrativas de cDNA de genótipos susceptível e resistente de algodão infectados com Meloidogyne incognita. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 127-129. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | CAETANO, P.; PAES, N. S.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R. da; CARNEIRO, R. M. D.; GROSSI DE SÁ, M. F.; MEHTA, A. Caracterização de bibliotecas subtrativas de c.DNA de genótipos suscetível e resistente de algodão infectados com Meloidogyne incognita. Nematologia Brasileira, Brasília, v. 31, n. 2, p. 152, 2007. Edição dos resumos do XXVII Congresso Brasileiro de Nematologia, Goiânia, GO, maio 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | GONÇALVES, G. de M. O.; MASCARENHAS, Y. S.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; FERNANDES, E. de P.; SILVA, M. A. S. da. Variações na concentração de íons na solução do solo em função de doses e fontes de fertilizantes nitrogenados no cultivo de arroz em várzea tropical. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 128. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 11. | | MASCARENHAS, Y. S.; SILVA, M. A. S. da; CORRECHEL, V.; SANTOS, A. B. dos; CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; COELHO, A. S.; GONÇALVES, G. M. de O.; CAETANO, P. H. P. Emission of nitrous oxide in flooded rice cultivation in tropical area of Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01497, 2020. Título em português: Emissão de óxido nitroso em cultivo de arroz inundado em área tropical do Brasil.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
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| Registros recuperados : 11 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
19/12/2018 |
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Data da última atualização: |
29/04/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
SILVA, P. R. A. da; VIDAL, M. S.; SOARES, C. de P.; POLESE, V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. |
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Afiliação: |
PAULA RENATA ALVES DA SILVA, BOLSISTA EMBRAPA AGROBIOLOGIA; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; CLEITON DE PAULA SOARES, UFRJ; VALÉRIA POLESE, UFRJ; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR,, UFRJ; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB. |
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Título: |
Sugarcane apoplast fluid modulates the global transcriptional profile of the diazotrophic bacteria Paraburkholderia tropica strain Ppe8. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
PLOS ONE, v. 13, n. 12, e0207863, 2018. |
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ISSN: |
1932-6203 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of genes involved in bacterial metabolism was regulated (up and down), suggesting that the metabolism of strain Ppe8 is modulated by the apoplast fluid. These results suggest that Ppe8 alters its gene expression pattern in the presence of apoplast fluid mainly in order to use compounds present in the fluid as well as to avoid the induction of plant defense mechanisms. This is a pioneer study showing the role played by the sugarcane apoplast fluid on the global modulation of genes in P. tropica strain Ppe8. MenosThe stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bacterial growth; RNA Sequence; Sugarcane variety RB867515; Transcriptomic profile. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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