| |
|
|
| Registros recuperados : 48 | |
| 3. |  | MORAES, E.; NASCIMENTO, M. T. Estudo populacional de Symphonia globulifera (Clusiaceae) em dois fragmentos de mata Atlantica de baixada. Serie Tecnica IPEF, Piracicaba, v. 12, n. 32, p. 144, 1998. Edicao das Memorias do Simposio sobre Ecologia e Manejo de Fragmentos Florestais, 2., 1998, Piracicaba. Resumo dos paineis.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
|   |
| 6. | | NASCIMENTO, M. L.; LAHR, F. R. Analise de sistemas estruturais e construtivos de pontes de madeira. In: CONGRESSO FLORESTAL PANAMERICANO, 1.; CONGRESSO FLORESTAL BRASILEIRO, 7., 1993, Curitiba. Floresta para o Desenvolvimento: Política, Ambiente, Tecnologia e Mercado: anais. São Paulo: SBS; [S.l.]: SBEF, 1993. v.2, p.771.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 10. | | NASCIMENTO, M. T.; SILVA, G. C. da. Efeitos do corte seletivo de madeira na estrutura e diversidade arborea de um remanescente de mata de tabuleiro no norte fluminense. Serie Tecnica IPEF, Piracicaba, v. 12, n. 32, p. 144-145, 1998. Edicao das Memorias do Simposio sobre Ecologia e Manejo de Fragmentos Florestais, 2., 1998, Piracicaba. Resumo dos paineis.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 12. | | WAGATSUMA, L. S.; KOBYIAMA, M.; NASCIMENTO, M. C. A. O. Efeito da mataciliar e da cobertura do solo por resíduos de cultura do milho e da rampa sobre a temperatura sobre a temperatura do solo. SBPN - Scientific Journal, Curitiba, v. 4, supl. 1, p. 56-57, 2000. Edição dos Anais da 8ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Pesquisadores Nikkeis, Curitiba, 2000. Resumos.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 13. | | CARVALHO, F. A.; BRAGA, J. M. A.; NASCIMENTO, M. T. Estrutura da comunidade arbórea de fragmentos de Floresta Atlântica Ombrófila submontana na região de Imbaú, Município de Silva Jardim, Rio de Janeiro, Brasil. Rodriguésia, Rio de Janeiro, v. 60, n. 3, p. 695-710, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 17. | | OTTATI, A. L. T.; WILCKEN, C. F.; NASCIMENTO, M. L.; ORLATO, C. Biologia de Nystalea nyseus (Cramer, 1780) (Lepidoptera: Notodontidae) em Eucalyptus grandis. Floresta, Curitiba, v. 30, n. 1/2, p. 177, 2000. Edição dos Anais do Seminário sobre Proteção Florestal: Incêndios, Pragas e Doenças. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 18. | | NASCIMENTO, M. L.; WILCKEN, C. F.; OTTATI, A. L. T.; ORLATO, C. Biologia de Sarsina violascens Herrich-Schaeffer, 1856 (Lepidoptera: Lymantriidae) em Eucalyptus grandis. Floresta, Curitiba, v. 30, n. 1/2, p. 176, 2000. Edição dos Anais do Seminário sobre Proteção Florestal: Incêndios, Pragas e Doenças. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| Registros recuperados : 48 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
03/01/2018 |
|
Data da última atualização: |
03/01/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
B - 4 |
|
Autoria: |
LAGROTTA, M. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R. |
|
Afiliação: |
Marcos Rodrigues Lagrotta, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; Fabyano Fonseca e Silva, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Moysés Nascimento, UFV; Darlene Ana Souza Duarte, UFV; Camila Ferreira Azevedo, UFV; Rodrigo Reis Mota, University of Liège. |
|
Título: |
Computação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 35, n. 3, p. 440-448, 2017. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Em seleção genômica (SG), o grande número de marcadores moleculares utilizados, bem como a demanda computacional dos modelos bayesianos, fundamentados nos algoritmos Monte Carlo Via Cadeias de Markov, faz com que as análises exijam semanas ou até meses de processamento. A computação paralela representa uma solução natural para este problema, visto que esta subdividi um algoritmo em várias tarefas independentes, as quais podem ser processadas em paralelo, reduzindo o tempo de processamento. Objetivou-se comparar a eficiência de processamento do método BayesCπ programado em paralelo com o seu algoritmo sequencial padrão. Duas estratégias de paralelização foram estudadas. A primeira envolveu a análise de múltiplas cadeias MCMC em paralelo, e a segunda referiu-se à paralelização de uma única cadeia MCMC. Utilizou-se a biblioteca MPI e o pacote OpenMPI associado ao compilador gfortran para execução em paralelo desses algoritmos. Foram utilizados dados simulados considerando 10.000 marcadores SNPs e 4.100 indivíduos. O algoritmo sequencial padrão foi processado em 77,29 horas. Ao usar múltiplas cadeias em paralelo o processamento foi 77% mais rápido (17,75hs), enquanto que a estratégia de paralelização de uma única cadeia apresentou um ganho de desempenho de 15% (65,37hs). Conclui-se que a computação paralela é eficiente e pode ser aplicada à SG. |
|
Palavras-Chave: |
Marcadores SNP; Regressão Bayesiana. |
|
Thesaurus NAL: |
Genetic improvement; Statistics. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170170/1/2017-M.Deon-RBM-Computacao.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02126naa a2200241 a 4500
001 2084055
005 2018-01-03
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aLAGROTTA, M. R.
245 $aComputação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aEm seleção genômica (SG), o grande número de marcadores moleculares utilizados, bem como a demanda computacional dos modelos bayesianos, fundamentados nos algoritmos Monte Carlo Via Cadeias de Markov, faz com que as análises exijam semanas ou até meses de processamento. A computação paralela representa uma solução natural para este problema, visto que esta subdividi um algoritmo em várias tarefas independentes, as quais podem ser processadas em paralelo, reduzindo o tempo de processamento. Objetivou-se comparar a eficiência de processamento do método BayesCπ programado em paralelo com o seu algoritmo sequencial padrão. Duas estratégias de paralelização foram estudadas. A primeira envolveu a análise de múltiplas cadeias MCMC em paralelo, e a segunda referiu-se à paralelização de uma única cadeia MCMC. Utilizou-se a biblioteca MPI e o pacote OpenMPI associado ao compilador gfortran para execução em paralelo desses algoritmos. Foram utilizados dados simulados considerando 10.000 marcadores SNPs e 4.100 indivíduos. O algoritmo sequencial padrão foi processado em 77,29 horas. Ao usar múltiplas cadeias em paralelo o processamento foi 77% mais rápido (17,75hs), enquanto que a estratégia de paralelização de uma única cadeia apresentou um ganho de desempenho de 15% (65,37hs). Conclui-se que a computação paralela é eficiente e pode ser aplicada à SG.
650 $aGenetic improvement
650 $aStatistics
653 $aMarcadores SNP
653 $aRegressão Bayesiana
700 1 $aSILVA, F. F. e
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aNASCIMENTO, M.
700 1 $aDUARTE, D. A. S.
700 1 $aAZEVEDO, C. F.
700 1 $aMOTA, R. R.
773 $tRevista Brasileira de Biometria, Lavras$gv. 35, n. 3, p. 440-448, 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
