|
|
Registros recuperados : 16 | |
1. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 6, p. 619-626, jun. 2013. Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
2. | | COSTA, E. V.; DINIZ, D. B.; VERONEZE, R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S. Estimating additive and dominance variances for complex traits in pigs combining genomic and pedigree information. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 2, p. 6303-6311, June 2015. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
3. | | PINHEIRO, V. R.; SILVA, F. F. e; GUIMARÃES, S. E. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F. Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 2, p. 190-196, fev. 2013. Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
4. | | VERARDO, L. L.; SILVA, F. F.; VARONA, L.; RESENDE, M. D. V. de; BASTIAANSEN, J. W. M.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Bayesian GWAS and network analysis revealed new candidate genes for number of teats in pigs. Journal of Applied Genetics, v. 56, n. 1, p. 123-132, Feb. 2015. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
5. | | AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; GLÓRIA, L. S. Comparison of dimensionality reduction methods to predict genomic breeding values for carcass traits in pigs. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 4, p. 12217-12227, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
6. | | AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; PETERNELLI, L. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S. Quadrados mínimos parciais uni e multivariado aplicados na seleção genômica para características de carcaça em suínos. Ciência Rural, Santa Maria, RS, v. 43, n. 9, p. 1642-1649, set. 2013. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
7. | | SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F. Genomic prediction for additive and dominance effects of censored traits in pigs. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr15048764, Oct. 2016. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
8. | | SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GLORIA, L. S.; SILVA, F. F. Genomic selection for slaughter age in pigs using the Cox frailty model. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 4, p. 12616-12627, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
9. | | SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
10. | | SILVA, F. F. e; ZAMBRANO, M. F. B.; VARONA, L.; GLÓRIA, L. S.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A.; LÁZARO, S. F.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F. Genome association study through nonlinear mixed models revealed new candidate genes for pig growth curves. Scientia Agricola, v. 74, n. 1, 2017. 7 P. Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Leite. |
| |
11. | | DUARTE, D. A. S.; FORTES, M. R. S.; DUARTE, M. de S.; GUIMARÃES, S. E. F.; VERARDO, L. L.; VERONEZE, R.; RIBEIRO, A. M. F.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Genome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs. Animal Production Science, v. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
12. | | SILVA, F. F.; JEREZ, E. A. Z.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S.; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; NASCIMENTO, M.; LIMA, R. O. de; GUIMARÃES, S. E. F. Bayesian model combining linkage and linkage disequilibrium analysis for low density-based genomic selection in animal breeding. Journal of Applied Animal Research, v. 46, n. 1, p. 873-878, 2018. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
13. | | SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Genomic growth curves of an outbred pig population. Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
14. | | BARROSO, L. M. A.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; SILVA, F. F.; SERÃO, N. V. L.; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. L.; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Regularized quantile regression for SNP marker estimation of pig growth curves. Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 8, n. 59, 2017. 9 p. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
15. | | AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, M. S.; DUIJVESTEINJN, N.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S.; KELLY, M. J.; VIANA, J. M. S.; KNOL, E. F. Supervised independent component analysis as an alternative method for genomic selection in pigs. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 131, p. 452-461, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
16. | | TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; SILVA, F. F. e; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F.; PAIXÃO, D. M.; BARROSO, L. M. A.; VERARDO, L. L.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S. Factor analysis applied to genome prediction for high-dimensional phenotypes in pigs. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 2, 2016. 10 p. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
Registros recuperados : 16 | |
|
|
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
21/03/2014 |
Data da última atualização: |
18/02/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 1 |
Autoria: |
SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. |
Afiliação: |
FABIANO FONSECA E SILVA, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; GILSON SILVÉRIO ROCHA, UVF; DARLENE ANA S. DUARTE, UFV; PAULO SÁVIO LOPES, UFV; OTÁVIO J. B. BRUSTOLIN, UFV; SANDER THUS, WAGENINGEN UNIVERSITY; JOSÉ MARCELO S. VIANA, UFV; SIMONE E. F. GUIMARÃES, UFV. |
Título: |
Genomic growth curves of an outbred pig population. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
In the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
Thesagro: |
Curva de Crescimento; Porco. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/99868/1/2013-API-GenomicGrowth.pdf
|
Marc: |
LEADER 02003naa a2200253 a 4500 001 1983083 005 2015-02-18 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, F. F. e 245 $aGenomic growth curves of an outbred pig population.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aIn the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. 650 $aCurva de Crescimento 650 $aPorco 653 $aMelhoramento genético 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aROCHA, G. S. 700 1 $aDUARTE, D. A. S. 700 1 $aLOPES, P. S. 700 1 $aBRUSTOLIN, O. J. B. 700 1 $aTHUS, S. 700 1 $aVIANA, J. M. S. 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 773 $tGenetics and Molecular Biology$gv. 36, n. 4, p. 520-527, 2013.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|