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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
20/05/2014 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROSSE, I. da C.; STEINBERG, R. da S.; COIMBRA, R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; FONSECA, C. G.; CARVALHO, M. R. S. |
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Afiliação: |
IZINARA DA CRUZ ROSSE, UFMG; RAPHAEL DA SILVA STEINBERG, UFMG; RONEY SANTOS COIMBRA, FIOCRUZ-Minas; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; RUI DA SILVA VERNEQUE, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; CLEUSA GRAÇA FONSECA, UFMG; MARIA RAQUEL SANTOS CARVALHO, UFMG. |
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Título: |
Novel SNPs and INDEL polymorphisms in the 30UTR of DGAT1 gene: in silico analyses and a possible association. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biological Reproduction, v. 41, n. 7, p. 4555-4563, 2014. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-014-3326-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Diacylglycerol-O-acyltransferase (DGAT1) gene encodes the rate-limiting enzyme of triglyceride synthesis. A polymorphism in this gene, DGAT1 K232A, has been associated with milk production and composition in taurine breeds. However, this polymorphism is not a good tool for ascertaining the effects of this QTL in Bos indicus (Zebu), since the frequency of the DGAT1 232A allele is too low in these breeds. We sequenced the 3'-untranslated region of DGAT1 gene in a sample of bulls of the breeds Guzerá (Bos indicus) and Holstein (Bos taurus) and, using in silico analysis, we searched for genetic variation, evolutionary conservation, regulatory elements, and possible substitution effects. Six single nucleotide (SNPs) and one insertion-deletion (INDEL) polymorphisms were found in the Guzerá bulls. Additionally, we developed a preliminary association study, using this INDEL polymorphism as a genetic marker. A significant association was detected (P ≤ 0.05) between the INDEL (DGAT1 3'UTR INDEL) and the breeding values (BV) for protein, fat, and milk yields over a 305-day lactation period. The DGAT1 3' UTR INDEL genotype I/I (I, for insertion) was associated with lower BVs (-38.77 kg for milk, -1.86 kg for fat, and -1.48 kg for protein yields), when compared to the genotype I/D (D, for deletion). I/D genotype was lower D/D genotype (-34.98 kg milk, -1.73 kg fat, and -1.09 kg protein yields). This study reports the first polymorphism of DGAT1 3'UTR in the Guzerá breed, as well as its association with BV for milk protein, fat, and milk yields. MenosDiacylglycerol-O-acyltransferase (DGAT1) gene encodes the rate-limiting enzyme of triglyceride synthesis. A polymorphism in this gene, DGAT1 K232A, has been associated with milk production and composition in taurine breeds. However, this polymorphism is not a good tool for ascertaining the effects of this QTL in Bos indicus (Zebu), since the frequency of the DGAT1 232A allele is too low in these breeds. We sequenced the 3'-untranslated region of DGAT1 gene in a sample of bulls of the breeds Guzerá (Bos indicus) and Holstein (Bos taurus) and, using in silico analysis, we searched for genetic variation, evolutionary conservation, regulatory elements, and possible substitution effects. Six single nucleotide (SNPs) and one insertion-deletion (INDEL) polymorphisms were found in the Guzerá bulls. Additionally, we developed a preliminary association study, using this INDEL polymorphism as a genetic marker. A significant association was detected (P ≤ 0.05) between the INDEL (DGAT1 3'UTR INDEL) and the breeding values (BV) for protein, fat, and milk yields over a 305-day lactation period. The DGAT1 3' UTR INDEL genotype I/I (I, for insertion) was associated with lower BVs (-38.77 kg for milk, -1.86 kg for fat, and -1.48 kg for protein yields), when compared to the genotype I/D (D, for deletion). I/D genotype was lower D/D genotype (-34.98 kg milk, -1.73 kg fat, and -1.09 kg protein yields). This study reports the first polymorphism of DGAT1 3'UTR in the Guzerá breed, as well as its a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
3'Untranslated region; DGAT1; Genetic association study. |
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Thesagro: |
Bos Indicus. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 24 | |
| 5. |  | PEREIRA FILHO, I. A.; PACHECO, C. A. P.; CRUZ, J. C.; KARAM, D.; GUISCEM, J. M. Produtividade e algumas características do milho pipoca BRS Ângela, semeada em diferentes espaçamentos e densidades de semeaduras. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 24., 2002, Florianópolis, SC. Meio ambiente e a nova agenda para o agronegócio de milho e sorgo: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Florianópolis: Epagri, 2002. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | ZUCARELI, C.; BRZEZINSKI, C. R.; GUISCEM, J. M.; HENNING, F. A.; NAKAGAWA, J. Qualidade fisiológica de sementes de milho doce classificadas pela espessura e largura. Pesquisa Agropecuária Tropical, Goiânia, v. 44, n. 1, p. 71-78, jan./mar. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 7. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. de A.; NAKAGAWA, J.; ZANOTTO, M. D.; MATEUS, G. P. Fatores ambientais que afetam a taxa de secagem no grão de milho (Zea mays L.) após a maturidade fisiológica. Revista Brasileira de Agrometeorologia, Santa Maria, v. 9, n. 1, p. 83-89, 2001.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 8. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; NAKAGAWA, J.; ZANOTTO, M. D. Cultivo tardio da cultura do milho (Zea mays,L.) e sua relação com graus dias e radiação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 11.; REUNIÃO LATINO-AMERICANA DE AGROMETEOROLOGIA, 2., 1999, Florianópolis. Anais... Campinas: SBA, 1999.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; CRUZ, J. C.; PEREIRA FILHO, I. A.; ZANOTTO, M. D.; NAKAGAWA, J. Avaliação de métodos para estimar área foliar de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia, MG. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos expandidos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlandia, 2000. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; PEREIRA FILHO, I. A.; CRUZ, J. C.; NAKAGAWA, J.; ZANOTTO, M. Avaliação de métodos para estimar área foliar de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlândia, 2000. p. 138.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 11. | | CRUZ, J. C.; CORREA, L. A.; PEREIRA FILHO, I. A.; PEREIRA, F. T. F.; VERSIANI, R. P.; GUISCEM, J. M. O milho que se planta. Cultivar, Pelotas, v. 4, n. 42, p. 30-39, 2002.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 12. | | CRUZ, J. C.; CORRÊA, L. A.; PEREIRA FILHO, I. A.; PEREIRA, F. T. F.; GUISCEM, J. M.; VERSIANI, R. P. Milho: semente certa. Cultivar Grandes Culturas, Pelotas, v. 6, n. 65, p. 26-35, set. 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; NAKAGAWA, J.; ZANOTTO, M.; PEREIRA, I. A.; CRUZ, J. C. Desenvolvimento fisiológico e fenológico do milho (Zea mays L.) no cultivo da safrinha. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia, MG. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos expandidos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlandia, 2000. nao paginado 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 14. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; NAKAGAWA, J.; ZANOTTO, M.; PEREIRA, L. P.; CRUZ, J. C. Desenvolvimento fisiológico e fenológico do milho (Zea mays L.) no cultivo da safrinha. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlândia, 2000. p. 99.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 16. | | CRUZ, J. C.; PEREIRA FILHO, I. A.; GUISCEM, J. M.; COELHO, A. M.; MONTEIRO, M. A. R. Influência da adubação nitrogenada e do ambiente na produção de grãos de variedades de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 24., 2002, Florianópolis, SC. Meio ambiente e a nova agenda para o agronegócio de milho e sorgo: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Florianópolis: Epagri, 2002. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 18. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; MAGALHAES, P. C.; CRUZ, J. C.; PEREIRA FILHO, I. A. Crescimento e desenvolvimento de cultivares de milho (Zea mays L.) no plantio de "safrinha". In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 24., 2002, Florianópolis, SC. Meio ambiente e a nova agenda para o agronegócio de milho e sorgo: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Florianópolis: Epagri, 2002. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | GUISCEM, J. M.; SANS, L. M. A.; NAKAGAWA, J.; CRUZ, J. C.; PEREIRA FILHO, I. A.; MATEUS, G. P. Crescimento e desenvolvimento da cultura do milho (Zea mays, L.) em semeadura tardia e sua relação com graus-dia e radiação solar global. Revista Brasileira de Agrometeorologia, Santa Maria, v. 9, n. 2, p. 251-260, 2001.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | CRUZ, J. C.; PEREIRA FILHO, I. A.; GARCIA, J. C.; MOREIRA, J. A. A.; FERNANDES, J. S. da C.; GUISCEM, J. M. Sistemas de produção de milho na região de Sete Lagoas, MG. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO, 8., 2010, São Luís. Agricultura familiar: crise alimentar e mudanças climáticas globais: anais. São Luís: Universidade Estadual do Maranhão, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| Registros recuperados : 24 | |
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