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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/07/2013 |
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Data da última atualização: |
19/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
JESUS, O. N. de; FREITAS, J. P. de; DANTAS, J. L.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
ONILDO NUNES DE JESUS, CNPMF; J. P. DE FREITAS; J. L. DANTAS; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Use of morpho-agronomic traits and DNA profiling for classification of genetic diversity in papaya. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v.1, n.2, Mar. 2013. |
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ISSN: |
1676-5680 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
We examined the genetic diversity of papaya (Carica papaya) based on morph-agronomic and molecular data. Twenty-seven genotypes grown in Brazil were analyzed with 11 AFLP primer combinations, 23 ISSR markers, 22 qualitative and 30 quantitative descriptors. For the joint analyses, we used the Gower algorithm (Joint Gower) and the average value of the individual dissimilarity matrix for each type of data (Average-Joint Gower); 359 AFLP and 52 ISSR polymorphic bands were found. Approximately 29.2 and 7.7% of the AFLP and ISSR bands, respectively, were genotype-specific and may therefore be used for papaya variety protection. Although there was a significant correlation between the qualitative and quantitative descriptor dissimilarity matrices (r = 0.43), the morph-agronomic data were not highly correlated with the molecular data. Moreover, correlation between AFLP and ISSR dissimilarity matrices was nearly null (r = -0.01). Joint Gower analysis of all data showed high correlations, especially for AFLP markers, most likely due to the larger number of bands, generating a strong bias in the diversity estimates. The Joint-Average-Gower analysis allowed a better balance between the correlations for the continuous and the discrete variables. The results generated by clustering analysis distinguished 5 genetically distinct groups. While we found that papaya genotypes are significantly variable for many traits, we observed that Joint-Average-Gower analysis allowed for genotype clustering based on the most widely used criterion for classifying papaya genotypes, which is fruit type ('Formosa' or 'Solo'). This information helps provide an accurate estimate of the genetic diversity and structure of papaya germplasm, which will be used for further breeding strategies. MenosWe examined the genetic diversity of papaya (Carica papaya) based on morph-agronomic and molecular data. Twenty-seven genotypes grown in Brazil were analyzed with 11 AFLP primer combinations, 23 ISSR markers, 22 qualitative and 30 quantitative descriptors. For the joint analyses, we used the Gower algorithm (Joint Gower) and the average value of the individual dissimilarity matrix for each type of data (Average-Joint Gower); 359 AFLP and 52 ISSR polymorphic bands were found. Approximately 29.2 and 7.7% of the AFLP and ISSR bands, respectively, were genotype-specific and may therefore be used for papaya variety protection. Although there was a significant correlation between the qualitative and quantitative descriptor dissimilarity matrices (r = 0.43), the morph-agronomic data were not highly correlated with the molecular data. Moreover, correlation between AFLP and ISSR dissimilarity matrices was nearly null (r = -0.01). Joint Gower analysis of all data showed high correlations, especially for AFLP markers, most likely due to the larger number of bands, generating a strong bias in the diversity estimates. The Joint-Average-Gower analysis allowed a better balance between the correlations for the continuous and the discrete variables. The results generated by clustering analysis distinguished 5 genetically distinct groups. While we found that papaya genotypes are significantly variable for many traits, we observed that Joint-Average-Gower analysis allowed for genotype clusteri... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genetic variability; Melhoramento genético; Variabilidade genética. |
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Thesagro: |
Carica Papaya; Mamão. |
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Thesaurus Nal: |
Algorithms; Genetic resources. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aWe examined the genetic diversity of papaya (Carica papaya) based on morph-agronomic and molecular data. Twenty-seven genotypes grown in Brazil were analyzed with 11 AFLP primer combinations, 23 ISSR markers, 22 qualitative and 30 quantitative descriptors. For the joint analyses, we used the Gower algorithm (Joint Gower) and the average value of the individual dissimilarity matrix for each type of data (Average-Joint Gower); 359 AFLP and 52 ISSR polymorphic bands were found. Approximately 29.2 and 7.7% of the AFLP and ISSR bands, respectively, were genotype-specific and may therefore be used for papaya variety protection. Although there was a significant correlation between the qualitative and quantitative descriptor dissimilarity matrices (r = 0.43), the morph-agronomic data were not highly correlated with the molecular data. Moreover, correlation between AFLP and ISSR dissimilarity matrices was nearly null (r = -0.01). Joint Gower analysis of all data showed high correlations, especially for AFLP markers, most likely due to the larger number of bands, generating a strong bias in the diversity estimates. The Joint-Average-Gower analysis allowed a better balance between the correlations for the continuous and the discrete variables. The results generated by clustering analysis distinguished 5 genetically distinct groups. While we found that papaya genotypes are significantly variable for many traits, we observed that Joint-Average-Gower analysis allowed for genotype clustering based on the most widely used criterion for classifying papaya genotypes, which is fruit type ('Formosa' or 'Solo'). This information helps provide an accurate estimate of the genetic diversity and structure of papaya germplasm, which will be used for further breeding strategies.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 1. |  | VIVALDINI, A.; WATANABE, A.; CRESTANA, S. Avaliação e monitoramento da perda de solo utilizando argila marcada com terras raras como traçador. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 12., 2020, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2020. Editores técnicos: Cristiane Sanchez Farinas, Daniel Souza Corrêa, José Manoel Marconcini, Maria Fernanda Berlingieri Durigan, Paulo Sérgio de Paula Herrmann Junior. 58 Embrapa Instrumentação. Documentos, 71.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 2. | | WATANABE, A. BRAMORSKI, J.; POSADAS, A.; CRESTANA, S. Abordagem multifractal para avaliação da rugosidade superficial do solo. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 649-652. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 3. | | WATANABE, A. M.; BRAMORSKI, J.; POSADAS, A. N.; CRESTANA, S. Uso de métodos não-lineares para a caracterização da rugosidade superficial do solo. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 30 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 4. | | WATANABE, A.; TADINI, A. M.; NICOLODELLI, G.; PEREIRA, D. M. B. Caracterização de um sistema LIBS com pulso duplo operando em modo ortogonal para aplicação em solos. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.39. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 5. | | WATANABE, A. M.; PINTO, B. D. L.; BRAMORSKI, J.; POSADAS, A. N.; CRESTANA, S. Medidas de variáveis físicas, simulação da dinâmica de carbono e análise multifractal para avaliação de rugosidade de solos tropicais. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 121. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 6. | | WATANABE, A. M.; PINTO, B. D. L.; BRAMORSKI, J.; POSADAS, A. N.; CRESTANA, S. Medidas de variáveis físicas, visando à simulação da dinâmica de carbono e análise multifractal para avaliação de rugosidade de um solo tropical. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 3., 2011, São Carlos. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação, 2011. p. 60. ( Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 104). Editado por: Luiz Francisco Zafalon; Patricia Tholon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 8. | | GOUNELLA, R. H.; WATANABE, A. M.; POSADAS, A. N.; VAZ, C. M. P.; CRESTANA, S. Determinação quantitativa de carbono e análises multifractais de imagens obtidas por microtomografia de raios-x em solos tropicais. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 47. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 10. | | CASTRO, L. F. S.; WATANABE, A.; SCHWAMBACK, D.; WENDLAND, E. C.; CRESTANA, S. Variabilidade temporal do escoamento superficial e perda de solo em Neossolos Quartzarênicos. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 14., 2022, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2022. Editores técnicos: Cristiane Sanchez Farinas, Daniel Souza Corrêa, Maria Alice Martins, Maria Fernanda Berlingieri Durigan, Paulo Sérgio de Paula Herrmann Júnior. 49 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 12. | | OTAVIANI JUNIOR, P. L.; SEGNINI, A.; FERREIRA, E. C.; WATANABE, A. M.; OLIVEIRA, P. P. A.; SILVA, W. T. L. da; MILORI, D. M. B. P. Avaliação do teor de carbono em solos através da técnica de espectroscopia de infravermelho proximo (NIRS). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 118. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 13. | | TRANI, P. E.; KANO, C.; DAMATTO JÚNIOR, E. R.; TONET, R. M.; AGUIAR, L. F. de; WATANABE, A. T.; MIAZATO, T. Chuchu. In: CANTARELLA, H.; QUAGGIO, J. A.; MATTOS JUNIOR, D.; BOARETTO, R. M.; RAIJ, B. van (Org.). Boletim 100: recomendações de adubação e calagem para o Estado de São Paulo. 3. ed. Campinas: IAC, 2022. p. 388-391. (Boletim técnico, 100).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 14. | | TRANI, P. E.; KANO, C.; DAMATTO JÚNIOR, E. R.; TONET, R. M.; AGUIAR, L. F. DE; WATANABE, A. T.; VARGAS, P. F.; MIAZATO, T. Chuchu. Boletim Técnico CATI, Campinas, n. 251, p. 46-48, mar. 2018.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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| 15. | | WATANABE, A. M.; VIVALDINI, A. R. S.; VILLELA, J. M.; ROSALEM, L. M. P.; BRAZ, C. E. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; WENDLAND, E. C.; CRESTANA, S. Estudo e monitoramento da perda de solo em condições controladas, utilizando terras raras como traçador. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 4., 2019, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2019. p. 752. Editores: Paulino Ribeiro Villas-Boas, Maria Alice Martins, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Ladislau Matin Neto. IV SIAGRO. 205-209. Editores: Paulino Ribeiro Villas-Boas, Maria Alice Martins, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Ladislau Matin Neto. IV SIAGRO.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 16. | | WATANABE, A. M.; VIVALDINI, A. R. S.; VILLELA, J. M.; ROSALEM, L. M. P.; BRAZ, C. E. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; WENDLAND, E. C.; CRESTANA, S. Estudo e monitoramento da perda de solo em condições controladas, utilizando terras raras como traçador. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 4., 2019, São Carlos, SP. Ciência, inovação e mercado: anais. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2019. Editores: Paulino Ribeiro Villas-Boas, Maria Alice Martins, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Ladislau Martin Neto. SIAGRO 2019. 205-209| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 17. | | NICOLODELLI, G.; SENESI, G. S.; RANULFI, A.; WATANABE, A.; CABRAL, J.; MARANGONI, B. S.; BOAS, P. R. V.; PEREIRA, D. M. B. Development of a Double-Pulse (DP) Laser-Induced Breakdown Spectroscopy (LIBS) Setup in the Orthogonal Configuration for Enviromental Applications. In: Latin América Optics and Photonics Conference 2016, Medellin, Colombia, Proceedings ... [S.l.:s.n.], 2016, não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | SEGNINI, A.; OTAVIANI JUNIOR, P. L.; WATANABE, A. M.; XAVIER, A. A. P.; OLIVEIRA, P. P. A.; MARTIN NETO, L.; MILORI, D. M. B. P. Efeito da intensificação do manejo da pecuária no sequestro de carbono em solos de pastagem: avaliação do estoque e da estabilidade da matéria orgânica do solo. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 62. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 19. | | NICOLODELLI, G.; ROMANO, R. A.; SENESI, G. S.; CABRAL, J.; WATANABE, A.; TELLI, S.; BORDONAL, R. de O.; CARVALHO, J. L. N.; MARANGONI, B. S.; MILORI, D. M. B. P. Evaluation of nitrogen fertilization in sugarcane leaves using laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) coupled with principal component analysis (PCA). In: LATIN AMERICA OPTICS AND PHOTONICS CONFERENCE, 2018, Peru. Proceedings... USA: OSA, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 20. | | SILVA, E. D. S. da; COUTO, L. D. do; AMORIM, O.; ANTINARELLI, L. M. R.; MEURER, I. R.; WATANABE, A. S. A.; SILVA, M. R.; GUIMARAES, R. J. de P. S. e; COIMBRA, E. S. Estudo socioepidemiológico e georeferenciamento da infecção pelo SARS-COV-2 em um município com baixa densidade populacional no estado de Minas Gerais, Brasil. Brazilian Journal of Infectious Diseases, v. 27, S1, 102812, p. 54-55, 2023. Edição dos resumos do 23º Congresso Brasileiro de Infectologia realizado de 19 a 22 de setembro de 2023, em Salvador, BA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 27 | |
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