BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  14/02/2013
Data da última atualização:  08/01/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  BITAR, M.; DRUMMOND, M. G.; COSTA, M. G. S.; LOBO, F. P.; CALZAVARA-SILVA, C. E.; BISCH, P. M.; MACHADO, C. R.; MACEDO, A. M.; PIERCE, R. J.; FRANCO, G. R.
Afiliação:  MAINÁ BITAR, UFRJ, UFMG; MARCELA GONÇALVES DRUMMOND, UFMG, Univ. Lille Nord de France; MAURICIO GARCIA SOUZA COSTA, UFRJ; FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; CARLOS EDUARDO CALZAVARA-SILVA, Fiocruz; PAULO MASCARELLO BISCH, UFRJ; CARLOS RENATO MACHADO, UFMG; ANDRÉA MARA MACEDO, UFMG; RAYMOND J. PIERCE, Univ. Lille Nord de France; GLÓRIA REGINA FRANCO, UFMG.
Título:  Modeling the zing finger protein SmZF1 from Schistosoma mansoni: Insights into DNA binding and gene regulation.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  Journal of Molecular Graphics and Modelling, New York, v. 39, p. 29-38, 2013.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Zinc finger proteins are widely found in eukaryotes, representing an important class of DNA-binding proteins frequently involved in transcriptional regulation. Zinc finger motifs are composed by two antiparallel b-strands and one a-helix, stabilized by a zinc ion coordinated by conserved histidine and cysteine residues. In Schistosoma mansoni, these regulatory proteins are known to modulate morphological and physiological changes, having crucial roles in parasite development. A previously described C2H2 zinc finger protein, SmZF1, was shown to be present in cell nuclei of different life stages of S. mansoni and to activate gene transcription in a heterologous system. A high-quality SmZF1 tridimensional structure was generated using comparative modeling. Molecular dynamics simulations of the obtained structure revealed stability of the zinc fingers motifs and high flexibility on the terminals, comparable to the profile observed on the template X-ray structure based on thermal b-factors. Based on the protein tridimensional features and amino acid composition, we were able to characterize four C2 H2 zinc finger motifs, the first involved in protein?protein interactions while the three others involved in DNA binding. We defined a consensus DNA binding sequence using three distinct algorithms and further carried out docking calculations, which revealed the interaction of fingers 2?4 with the predicted DNA. A search for S. mansoni genes presenting putative SmZF1 binding sites reve... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Ligação de DNA; Regulação gênica.
Thesagro:  Schistosoma Mansoni.
Thesaurus Nal:  DNA-binding proteins; Gene expression regulation; Zinc finger motif.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA17190 - 1UPCAP - DD
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21.Imagem marcado/desmarcadoCUENCA, M. A. G.; DOMPIERI, M. H. G.; SANTIAGO, A. D.; SANTOS, F. R. dos. Fatores da variação da produção e substituição de cultivos em municípios do agreste alagoano. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 114).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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22.Imagem marcado/desmarcadoFERREIRA, W. S.; DOMPIERI, M. H. G.; SANTOS, A.; RUSSO, S. L.; PAIXAO, A. E. Analysis through control charts of the number of guests of a hotel establishment in Aracaju, Sergipe, Brazil. Espacios, v. 38, n. 26, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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23.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; CUENCA, M. A. G.; SILVA, M. A. S. da. Análise do avanço e retração de cultivos agrícolas no extremo sul da Bahia, a partir do modelo Shift-Share. Revista Econômica do Nordeste, Fortaleza, v. 51, n. 3, p. 9-24, jul./set., 2020 p. 9-24.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
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24.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; COUTINHO, P. A. Q.; SILVA, M. A. S. da. Efficient use of Landsat-8 data to minimize cloud coverage in the analysis of soybean, corn, and cotton cultivation. Revista Contemporânea, v. 4, n. 11, p. e6683, 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Territorial.
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25.Imagem marcado/desmarcadoCUENCA, M. A. G.; DOMPIERI, M. H. G.; SANTOS, F. R. dos. Expansão da produção do milho e substituição de cultivos na região do sertão ocidental, no Estado de Sergipe. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. 31 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 120).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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26.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; SILVA, M. A. S. da; RUSSO, S. L. Modelagem Box-Jenkins sazonal na análise da produção de fertilizantes intermediários no Brasil. In: CONGRESSO DE ESTATÍSTICA, 5.; SEMANA ACADÊMICA DE ESTATÍSTICA, 8., 2017, São Cristóvão. Anais ... São Cristóvão, DF: Universidade Federal de Sergipe, 2017.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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27.Imagem marcado/desmarcadoMACIEL, R. J. S.; SILVA, M. A. S. da; MATOS, L. N.; DOMPIERI, M. H. G. A neural qualitative approach for automatic territorial zoning. A neural qualitative approach for automatic territorial zoning. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON GEOCOMPUTATION, 21., 2017, Leeds. Celebrating 21 years of GeoComputation: extended abstracts. Leeds: University of Leeds, 2017. p. 1-7. GeoComputation 2017.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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28.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; TAKEMURA, C. M.; MENDES, A. M.; PIVETA, G. M. Ocupação do solo na Região Metropolitana de Campinas: urbanização e produção de alimentos. Campinas: Embrapa Territorial, 2024. 17 p. (Embrapa Territorial. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 47). ODS 2.
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Territorial.
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29.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; SOUZA, D. T. de; ROCHA, J. D.; SILVA, M. A. S. da. Perspectivas para o etanol de milho brasileiro. Campinas: Embrapa Territorial, 2024. 12 p. (Embrapa Territorial. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 44). ODS 7.
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Territorial.
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30.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; SILVA, M. A. S. da; NOGUEIRA JUNIOR, L. R. Mapeamento de áreas de vegetação nativa no Território do Sertão Ocidental de Sergipe. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2018. 20 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 140).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Territorial.
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31.Imagem marcado/desmarcadoPACHECO, E. P.; DOMPIERI, M. H. G.; TEIXEIRA, A. H. de C. Recomendação de adubação nitrogenada de milho em função do NDVI obtido no agreste do Sealba: primeira aproximação. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2020. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Comunicado Técnico, 237).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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32.Imagem marcado/desmarcadoPIOVEZAN, U.; DOMPIERI, M. H. G.; CENTURION, S. R.; PELLEGRIN, L. A. Receptores gps para estudo do comportamento espacial de bovinos em pastagens nativas do Pantanal. Corumbá: Embrapa Pantanal, 2017. 33 p. (Embrapa Pantanal. Documentos, 153).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal; Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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33.Imagem marcado/desmarcadoNOGUEIRA JUNIOR, L. R.; AMORIM, J. R. A. de; DOMPIERI, M. H. G. Terraceamento: conservação do solo e da água no polo de produção de milho, em Sergipe. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. 10 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Comunicado técnico, 199).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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34.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; SILVA, M. A. S. da; NOGUEIRA JUNIOR, L. R. Sistemas de referência terrestre e posicionamento por satélite. Aracaju, SE: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 197).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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35.Imagem marcado/desmarcadoBRITO, A. S.; COSTA, D. M.; BARROS, I. de; DOMPIERI, M. H. G.; TEODORO, A. V. The role of secondary restinga forests in the conservation of Dichotomius schiffleri (Coleoptera: Scarabaeinae). Brazilian Journal of Biology, v. 83, e248995, 2022.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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36.Imagem marcado/desmarcadoBRITO, A. S.; COSTA, D. M.; BARROS, I. de; DOMPIERI, M. H. G.; TEODORO, A. V. The role of secondary restinga forests in the conservation of Dichotomius schiffleri (Coleoptera: Scarabaeinae). Brazilian Journal of Biology, v. 83, e248995, 2023.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Territorial.
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37.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, P. K. A.; SILVA, M. A. S. da; COSTA, J. V. T. A.; KANO, C.; DOMPIERI, M. H. G. Análise da distribuição espacial das armadilhas para o monitoramento da praga Bactrocera Carambolae no Amapá entre 2014 e 2019. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17., 2023, Campinas. Anais [...]. Campinas: Embrapa Territorial, 2023. 12 p. CIIC 2023. Nº 23508.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Territorial.
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38.Imagem marcado/desmarcadoAMORIM, J. R. A. de; CRUZ, M. A. S.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; DOMPIERI, M. H. G. Influência da sazonalidade da precipitação na qualidade da água superficial no polo de produção de milho em Sergipe. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. 31 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 113).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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39.Imagem marcado/desmarcadoDOMPIERI, M. H. G.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; SILVA, M. A. S. da; SALES, J. B. M. de. Cadastro ambiental rural e inscrição dos campos experimentais da Embrapa Tabuleiros Costeiros, Sergipe. Aracaju, SE: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 191).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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40.Imagem marcado/desmarcadoPACHECO, E. P.; DOMPIERI, M. H. G.; TEIXEIRA, A. H. de C.; COUTO, J. P. DE A.; HAYASI, C. H. Estudo preliminar para recomendação de adubação nitrogenada na cultura do milho em função do NDVI calculado a partir de imagens aéreas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRICULTURA DE PRECISÃO, 2018, Curitiba. Construção dos dados na era da digitalização agrícola: anais. [S.l.]: AsBraAP, [2018]. p. 451-455. ConBAP 2018.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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