BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  14/02/2013
Data da última atualização:  08/01/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  BITAR, M.; DRUMMOND, M. G.; COSTA, M. G. S.; LOBO, F. P.; CALZAVARA-SILVA, C. E.; BISCH, P. M.; MACHADO, C. R.; MACEDO, A. M.; PIERCE, R. J.; FRANCO, G. R.
Afiliação:  MAINÁ BITAR, UFRJ, UFMG; MARCELA GONÇALVES DRUMMOND, UFMG, Univ. Lille Nord de France; MAURICIO GARCIA SOUZA COSTA, UFRJ; FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; CARLOS EDUARDO CALZAVARA-SILVA, Fiocruz; PAULO MASCARELLO BISCH, UFRJ; CARLOS RENATO MACHADO, UFMG; ANDRÉA MARA MACEDO, UFMG; RAYMOND J. PIERCE, Univ. Lille Nord de France; GLÓRIA REGINA FRANCO, UFMG.
Título:  Modeling the zing finger protein SmZF1 from Schistosoma mansoni: Insights into DNA binding and gene regulation.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  Journal of Molecular Graphics and Modelling, New York, v. 39, p. 29-38, 2013.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Zinc finger proteins are widely found in eukaryotes, representing an important class of DNA-binding proteins frequently involved in transcriptional regulation. Zinc finger motifs are composed by two antiparallel b-strands and one a-helix, stabilized by a zinc ion coordinated by conserved histidine and cysteine residues. In Schistosoma mansoni, these regulatory proteins are known to modulate morphological and physiological changes, having crucial roles in parasite development. A previously described C2H2 zinc finger protein, SmZF1, was shown to be present in cell nuclei of different life stages of S. mansoni and to activate gene transcription in a heterologous system. A high-quality SmZF1 tridimensional structure was generated using comparative modeling. Molecular dynamics simulations of the obtained structure revealed stability of the zinc fingers motifs and high flexibility on the terminals, comparable to the profile observed on the template X-ray structure based on thermal b-factors. Based on the protein tridimensional features and amino acid composition, we were able to characterize four C2 H2 zinc finger motifs, the first involved in protein?protein interactions while the three others involved in DNA binding. We defined a consensus DNA binding sequence using three distinct algorithms and further carried out docking calculations, which revealed the interaction of fingers 2?4 with the predicted DNA. A search for S. mansoni genes presenting putative SmZF1 binding sites reve... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Ligação de DNA; Regulação gênica.
Thesagro:  Schistosoma Mansoni.
Thesaurus Nal:  DNA-binding proteins; Gene expression regulation; Zinc finger motif.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA17190 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C. Adubacao de pastagens. Planaltina: [s.n., s.d.]. 4p.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C. Amostragem de solos, corretivos e fertilizantes. In: SOUSA, D. M. G. de; LOBATO, E. (Ed.). Cerrado: correcao do solo e adubacao. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2002. p. 63-79.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C. Fontes, doses e metodos de aplicacao do potassio em solos com baixa retencao de cations e sua utilizacao pelas plantas. Porto Alegre: UFRGS, 1983. 128p. Dissertacao Mestrado.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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4.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C. Deficiência de manganês em lavouras de soja. Planaltina: Embrapa Cerrados, 1996. 2p. (Embrapa Cerrados. Guia Tecnico do Produtor Rural, 1).
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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5.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C. Magnitude, interaction and amelioration of subsurface acidity constraints to soybean root growth in solution. Raleigh: North Carolina State University, 1993. 197p. Ph.D. Thesis.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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6.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C. Recomendacao e pratica de adubacao e calagem na regiao Centro-Oeste do Brasil. In: SIMPOSIO SOBRE CALAGEM E ADUBACAO DE PASTAGENS, 1., 1985, Nova Odessa, SP. Calagem e adubacao de pastagens. Piracicaba: POTAFOS, 1986. p.309-334.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; LOBATO, E. Calagem e fontes de fósforo na produção de Brachiaria decumbens Stapf. Planaltina: EMBRAPA-CPAC, 1980. 2p. (EMBRAPA-CPAC. Pesquisa em Andamento, 3).
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; VILELA, L. Broadcast and annual band application of lime and fertilizers on soybean production. Soil Science Society of North Carolina Proceedings, v.36, p.50-52, 1993.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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9.Imagem marcado/desmarcadoLOBATO, E.; SANZONOWICZ, C. Effects of P sources pastures. In: AGRONOMIC-ECONOMIC RESEARCH ON SOILS OF THE TROPICS. 1978-1979 report. Raleigh, N.C.: North Carolina State University, 1980. p.51-61.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; MIELNICZUK, J. Fontes, doses e metodos de aplicacao de potassio no solo. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.20, n.2, p.189-195, fev. 1985.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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11.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; MIELNICZUK, J. Fontes, doses e metodos de aplicacao de potassio no solo. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.20, n.2, p.189-195, 1985.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; MIELNICZUK, J. Distribuição do potássio no perfil de um solo, influenciado pela planta, fontes e métodos de aplicação de adubos. Revista Brasileira de Ciencia do Solo, Campinas, v. 9, p. 45-50, 1985.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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13.Imagem marcado/desmarcadoCOUTO, W.; SANZONOWICZ, C. Cor do solo, lencol freatico e disponibilidade de agua num latossolo vermelho-amarelo sob cerrado. Revista Brasileira de Ciencia do Solo, Campinas, v.8, n.2, p.255-257, 1984.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; COUTO, W. Efeito de cálcio, enxofre e outros nutrientes no rendimento e nodulação de Leucaena leucocephala em um solo de cerrado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 16, n. 6, p. 789-794, nov./dez. 1981 Título em inglês: Effect de calcium, sulphur and other nutrients on dry matter yield and nodulation of Leucaena leucocephala in "Cerrado" soil.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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15.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; COUTO, W. Efeito de calcio, enxofre e outros nutrientes no rendimento e nodulacao de Leucaena leucocephala em um solo de cerrado. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.16, n.6, p.789-794, 1981.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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16.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; COUTO, W. Niveis e fontes de fosforo para o estabelecimento e manutencao de Andropogon gayanus consorciado com Stylosanthes capitata num solo de cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 1.; REUNIAO ANUAL DA SBZ, 17., 1980, Fortaleza, CE. Anais... Fortaleza: SBZ, 1980. p.572. Resumo.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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17.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; JASTER, F. Níveis de NPK em capim-pangola em solo de campo nativo do Paraná. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 16, n. 2, p. 159-163, mar. 1981 Título em inglês: Response of Pangola grass to NPK fertilization in a native field of Paraná.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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18.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; NAZARENO, R. B. Adubacao nitrogenada na flutuacao bienal do cafeeiro no cerrado. In: REUNIAO BRAS. FERTILIDADE DO SOLO E NUTRICAO DE PLANTAS, 25.; REUNIAO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS,8.; SIMPOSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 6.; REUNIAO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 3., 2000, Santa Maria, RS. Fertbio 2000: biodinamica do solo. [S.l.: s.n.], 2000. nao paginado.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; AMABILE, R. F. Adubação nitrogenada do girassol, no período chuvoso e na safrinha na região do cerrado. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2001. 2 p. (Embrapa Cerrado. Recomendacao Tecnica, 30).
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSANZONOWICZ, C.; SMYTH, T. J. Effect of hydrogen on soybean root growth in a subsurface solution. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 30, n. 2, p. 255-261, fev. 1995. Título em português: Efeito do hidrogênio na solução subsuperficial no crescimento de raízes de soja.
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Unidades Centrais.
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