BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária.
Data corrente:  21/11/2012
Data da última atualização:  21/11/2012
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ZERLOTINI NETO, A.; AGUIAR, E. R. G. R.; YU, F.; XU, H.; LI, Y.; YOUNG, N. D.; GASSER, R. B.; PROTASIO, A. V.; BERRIMAN, M.; ROOS, D. S.; KISSINGER, J. C.; OLIVEIRA, G.
Afiliação:  ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; ERIC R. G. R. AGUIAR, Fiocruz Minas; FUDONG YU, Shanghai Center for Bioinformation Technology; HUAYONG XU, Shanghai Jiao Tong University; YIXUE LI, Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai Jiao Tong University; NEIL D. YOUNG, University of Melbourne; ROBIN B. GASSER, University of Melbourne; ANNA V. PROTASIO, Wellcome Trust Sanger Institute; MATTHEW BERRIMAN, Wellcome Trust Sanger Institute; DAVID S. ROOS, University of Pennsylvania; JESSICA C. KISSINGER, University of Georgia; GUILHERME OLIVEIRA, Fiocruz Minas.
Título:  SchistoDB: an updated genome resource for the three key schistosomes of humans.
Ano de publicação:  2012
Fonte/Imprenta:  Nucleic Acids Research, p. 1-4, 2012.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The new release of SchistoDB (http://SchistoDB.net) provides a rich resource of genomic data for key blood flukes (genus Schistosoma) which cause disease in hundreds of millions of people worldwide. SchistoDB integrates whole-genome sequence and annotation of three species of the genus and provides enhanced bioinformatics analyses and data-mining tools. A simple, yet comprehensive web interface provided through the Strategies Web Development Kit is available for the mining and visualization of the data. Genomic scale data can be queried based on BLAST searches, annotation keywords and gene ID searches, gene ontology terms, sequence motifs, protein characteristics and phylogenetic relationships. Search strategies can be saved within a user?s profile for future retrieval and may also be shared with other researchers using a unique web address.
Palavras-Chave:  Dados genômicos.
Thesaurus NAL:  Genome; Schistosoma.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
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CNPTIA16941 - 1UPCAP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; CINTRA, L. C. Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. Campinas: Embrapa informática Agropecuária, 2016. 36 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 149).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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2.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. flanSnps. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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3.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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4.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Utilização da plataforma Galaxy na análise de dados de RNAseq. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 175-178.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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5.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, F. D.; MOURA, D. G. de; SILVA, D. F.; HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A. BDGF: um sistema web para recuperação de informação de genótipos e fenótipos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas. Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Campinas: Editora da Unicamp: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. p. 429-438. SBIAgro 2017. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. Reconstructing the whole mitochondrial DNA (mtDNA) from nuclear genome. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 42. X-meeting 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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7.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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8.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, F. D.; MOURA, D. G. de; SILVA, D. F. da; HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A. BDGF: a database and webbased information retrieval system for genotype and phenotype. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 238. X-Meeting 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCHUD, T. C. S.; ZERLOTINI NETO, A.; CARMO, A. S. do; MUNARI, D. P.; SILVA, M. V. G. B. Identificação de variação no número de cópias em bovinos leiteiros usando dados de NGS. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSIMÕES, M.; BAHIA, D.; TORRES, K.; ZERLOTINI NETO, A.; ARTIGUENAVE, F.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; OLIVEIRA, G. SNP identification in Schistosoma mansoni expressed genes. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 131. X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Kuser.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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11.Imagem marcado/desmarcadoCHUD, T. C. S.; BICKHART, D. M.; ZERLOTINI NETO, A.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B.; MUNARI, D. P. Copy number variation in dairy cattle using next-generation sequencing. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l. : s.n.], 2018. 1 p. PAG 2018. P0490. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Marcos Vinicius B. da Silva.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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12.Imagem marcado/desmarcadoCASASSOLA, A.; BRAMMER, S. P.; CHAVES, M. S.; NHANI JUNIOR, A.; FALCAO, P. R. K.; ZERLOTINI NETO, A.; STEFANATO, F; BOYD, L. Perfil de expressão de genes em trigo em resposta à infecção por ferrugem da folha. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 8.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 9., 2014, Canela; REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 9.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 10., 2015, Passo Fundo. Anais... Passo Fundo: Biotrigo Genética: Embrapa Trigo, 2015. 2015-Melhoramento, Aptidão Industrial e Sementes-Trabalho 98. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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13.Imagem marcado/desmarcadoROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M. Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. In: INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS CONFERENCE, 36., 2017, Dublin. Proceedings... Dublin: University College Dublin, 2017. p. 156 - 157.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. Article number: 13747. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste.
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15.Imagem marcado/desmarcadoMORÉ, D. D.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. A.; ZERLOTINI NETO, A.; GULIAS-GOMES, C. C.; IBELLI, A. M. G.; CATOIA, V.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. A. Genetics mechanisms of resistance and response to tick infestation in Hereford cattle: a global view. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 66. ISAFG 2013. AB.59.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul.
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16.Imagem marcado/desmarcadoVERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.:s.n.], 2018. 6 p. WCGALP 2018. Na publicação: A. Zerlotini, J. C. C. Panetto.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Informática Agropecuária.
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17.Imagem marcado/desmarcadoCRUZ, I. R. DA; GERALDO, J. A.; LEITE, L. R.; ZERLOTINI NETO, A.; ARAUJO, F.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; CARVALHO, M. R. S.; OLIVEIRA, G. Efficient gap-closure of eukaryotic genome sequence assemblies by third-generation sequencing. In: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatica and Computacion Biology, 10., 2012, Campinas. Resumos...
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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18.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 47. X-meeting 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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19.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; AGUIAR, E. R. G. R.; YU, F.; XU, H.; LI, Y.; YOUNG, N. D.; GASSER, R. B.; PROTASIO, A. V.; BERRIMAN, M.; ROOS, D. S.; KISSINGER, J. C.; OLIVEIRA, G. SchistoDB: an updated genome resource for the three key schistosomes of humans. Nucleic Acids Research, p. 1-4, 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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20.Imagem marcado/desmarcadoCRATIVOL, C.; REGULSKI, M.; BERTALAN, M.; MCCOMBIE, W. R.; SILVA, F. R. da; ZERLOTINI NETO, A.; VICENTINI, R.; FARINELLI, L.; HEMERLY, A. S.; MARTIENSSEN, R. A.; FERREIRA, P. C. G. Sugarcane genome sequencing by methylation filtration provides tools for genomic research in the genus Saccharum. The Plant Journal, Oxford, v. 79, n. 1, p. 162-172, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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