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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
24/10/2012 |
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Data da última atualização: |
25/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HORA JUNIOR, B. T. da; POLONI, J. de F.; LOPES, M. A.; DIAS, C. V.; GRAMACHO, K. P.; SCHUSTER, I.; SABAU, X.; CASCARDO, J. C. de M.; DI MAURO, S. M. Z.; GESTEIRA, A. da S.; BONATTO, D.; MICHELI, F. |
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Afiliação: |
BRAZ TAVARES DA HORA JUNIOR, UESC; JOICE DE FARIA POLONI, PUCRS; MAÍZA ALVES LOPES, UESC; CRISTIANO VILLELA DIAS, UESC; KARINA PERES GRAMACHO, CEPLAC; IVAN SCHUSTER, COODETEC; XAVIER SABAU, CIRAD; JÚLIO CÉZAR DE MATTOS CASCARDO, UESC; SÔNIA MARLI ZINGARETTI DI MAURO, UNESP; ABELMON DA SILVA GESTEIRA, CNPMF; DIEGO BONATTO, CEPLAC; FABIENNE MICHELI, UESC. |
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Título: |
Transcriptomics and systems biology analysis in identification of specific pathways involved in cacao resistance and susceptibility to witches. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular BioSystems, n.8, p. 1507-1519, 2012 |
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ISSN: |
1742-206X |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study reports on expression analysis associated with molecular systems biology of cacao-Moniliophthora perniciosa interaction. Gene expression data were obtained for two cacao genotypes (TSH1188, resistant; Catongo, susceptible) challenged or not with the fungus M. perniciosa and collected at three time points through disease. Using expression analysis, we identified 154 and 227 genes that are differentially expressed in TSH1188 and Catongo, respectively. The expression of some of these genes was confirmed by RT-qPCR. Physical protein?protein interaction (PPPI) networks of Arabidopsis thaliana orthologous proteins corresponding to resistant and susceptible interactions were obtained followed by cluster and gene ontology analyses. The integrated analysis of gene expression and systems biology allowed designing a general scheme of major mechanisms associated with witches? broom disease resistance/susceptibility. In this sense, the TSH1188 cultivar shows strong production of ROS and elicitors at the beginning of the interaction with M. perniciosa followed by resistance signal propagation and ROS detoxification. On the other hand, the Catongo genotype displays defense mechanisms that include the synthesis of some defense molecules but without success in regards to elimination of the fungus. This phase is followed by the activation of protein metabolism which is achieved with the production of proteasome associated with autophagy as a precursor mechanism of PCD. This work also identifies candidate genes for further functional studies and for genetic mapping and marker assisted selection. MenosThis study reports on expression analysis associated with molecular systems biology of cacao-Moniliophthora perniciosa interaction. Gene expression data were obtained for two cacao genotypes (TSH1188, resistant; Catongo, susceptible) challenged or not with the fungus M. perniciosa and collected at three time points through disease. Using expression analysis, we identified 154 and 227 genes that are differentially expressed in TSH1188 and Catongo, respectively. The expression of some of these genes was confirmed by RT-qPCR. Physical protein?protein interaction (PPPI) networks of Arabidopsis thaliana orthologous proteins corresponding to resistant and susceptible interactions were obtained followed by cluster and gene ontology analyses. The integrated analysis of gene expression and systems biology allowed designing a general scheme of major mechanisms associated with witches? broom disease resistance/susceptibility. In this sense, the TSH1188 cultivar shows strong production of ROS and elicitors at the beginning of the interaction with M. perniciosa followed by resistance signal propagation and ROS detoxification. On the other hand, the Catongo genotype displays defense mechanisms that include the synthesis of some defense molecules but without success in regards to elimination of the fungus. This phase is followed by the activation of protein metabolism which is achieved with the production of proteasome associated with autophagy as a precursor mechanism of PCD. This work al... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular systems biology. |
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Thesagro: |
Cação. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aThis study reports on expression analysis associated with molecular systems biology of cacao-Moniliophthora perniciosa interaction. Gene expression data were obtained for two cacao genotypes (TSH1188, resistant; Catongo, susceptible) challenged or not with the fungus M. perniciosa and collected at three time points through disease. Using expression analysis, we identified 154 and 227 genes that are differentially expressed in TSH1188 and Catongo, respectively. The expression of some of these genes was confirmed by RT-qPCR. Physical protein?protein interaction (PPPI) networks of Arabidopsis thaliana orthologous proteins corresponding to resistant and susceptible interactions were obtained followed by cluster and gene ontology analyses. The integrated analysis of gene expression and systems biology allowed designing a general scheme of major mechanisms associated with witches? broom disease resistance/susceptibility. In this sense, the TSH1188 cultivar shows strong production of ROS and elicitors at the beginning of the interaction with M. perniciosa followed by resistance signal propagation and ROS detoxification. On the other hand, the Catongo genotype displays defense mechanisms that include the synthesis of some defense molecules but without success in regards to elimination of the fungus. This phase is followed by the activation of protein metabolism which is achieved with the production of proteasome associated with autophagy as a precursor mechanism of PCD. This work also identifies candidate genes for further functional studies and for genetic mapping and marker assisted selection.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| 1. |  | RAMOS, T. C. D. A.; OLIVEIRA, J. C. M. D.; SOUZA, F. A.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; MARRIEL, I. E. Produção de ácidos orgânicos como mecanismo de biossolubilização de rochas silicáticas por fungos filamentosos isolados de solos ferruginosos. In: SIMPÓSIO DE MICROBIOLOGIA DA UFMG, 4., 2017, Belo Horizonte. Metabolismo microbiano: saúde, ambiente e biotecnologia: resumos. Belo Horizonte: UFMG, 2017. p. 140.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 2. | | RAMOS, T. C. D. A.; COTA, L. V.; COSTA, R. V.; SILVA, D. D.; NOLASCO, A. A. R.; LANZA, F. E.; PARREIRA, D. F.; COSTA, G. M. C. Componentes epidemiológicos de isolados de Exserohilum turcicum em genótipos de sorgo. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, p. 979, ago. 2011. 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves. Resumo 1403.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 3. | | RAMOS, T. C. D. de A.; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; COSTA, R. V. da; FIGUEIREDO, J. E. F.; LANZA, F. E. Componentes genéticos da resistência à Ramulispora sorghi. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 4. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; SILVA, J. A. A.; LANZA, F. E.; COSTA, G. M. C.; RAMOS, T. C. D. de A.; KARAM, D. Efeito in vitro de glyphosate sobre rizobactérias do gênero Bacillus app. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 5. | | PARREIRA, D. F.; ZAMBOLIM, L.; COSTA, R. V.; COTA, L. V.; SILVA, D. D.; NEVES, W. S.; RAMOS, T. C. D. A.; LANZA, F. E. Primeiro relato de patótipos de Colletotrichum graminicola em colmos de milho no Brasil. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, p. 317, ago. 2011. Suplemento. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves. Resumo 545.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 6. | | REIS, D. P. dos; FONSECA, L. M. F. da; RAMOS, T. C. D. de A; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; GUIMARAES, L. J. M.; MARRIEL, I. E. Ecologia microbiana da rizosfera de plantas de milho inoculadas com Azospirillum sp: III. diversidade metabólica da comunidade bacteriana. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 7. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; COSTA, G. M. C.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D.; RAMOS, T. C. D. de A.; LANZA, F. E.; CORREA, C. L. Diagnóstico molecular de Pantoea ananatis. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 75-81. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 8. | | COSTA, G. M. C.; COSTA, R. V. da; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; RAMOS, T. C. D. de A.; LANZA, F. E. Resistência genética e características de espigas na incidência de grãos ardidos em milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 9. | | LANZA, F. E.; COSTA, R. V. da; ZAMBOLIM, L.; SILVA, D. D. da; COTA, L. V.; MOURA, L. de O.; MARCONDES, M. M.; RAMOS, T. C. D'. de A.; CORREA, C. L.; NICOLI, A. Metodologia para inoculação de Fusarium verticillioides em milho, via solo, em casa de vegetação. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 496-503. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 10. | | LANZA, F. E.; CORREA, C. L.; COSTA, R. V. da; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; MARCONDES, M. M.; NICOLI, A.; COSTA, G. M. C.; RAMOS, T. C. D. de A.; MOURA, L. de O. Eficiência do controle químico na redução da incidência de grãos ardidos em milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 657-664.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 11. | | LANZA, F. E.; FIGUEIREDO, J. E. F.; COSTA, R. V. da; MOURA, L. de O.; MARCONDES, M. M.; SILVA, D. D. da; COTA, L. V.; CORREA, C. L.; NICOLI, A.; RAMOS, T. C. D. de A. Efeito do tratamento de sementes com o biofungicida bacteriano CNPMS22 na sobrevivência e desenvolvimento de plantas de milho em solo infestado com Fusarium verticillioides. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 555-562.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 12. | | COSTA, G. M. C.; COSTA, R. V.; COTA, L. V.; CRUZ, J. C.; SILVA, D. D. da; NOLASCO, A. A. R.; LANZA, F. E.; PARREIRA, D. F.; RAMOS, T. C. D. Incidência de grãos ardidos em milho sob diferentes populações de plantas e doses de nitrogênio. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, p. 514, ago. 2011. Suplemento. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves. Resumo 773.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 13. | | COSTA, G. M. C.; COSTA, R. V. da; COTA, L. V.; SILVA, D. D.; NOLASCO, A. A. R.; LANZA, F. E.; PARREIRA, D. F.; RAMOS, T. C. D.; SILVA, O. A. da. Efeito do genótipo, espaçamento e densidade de plantio na incidência de grãos e sementes ardidos em milho. Informativo ABRATES, Londrina, v. 21, n. 2, ago. 2011. Edição dos Anais do XVII Congresso Brasileiro de Sementes, Natal, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 14. | | MOURA, L. de O.; COTA, L. V.; COSTA, R. V. da; SILVA, D. D. da; LANZA, F. E.; RAMOS, T. C. D´ de A.; MARCONDES, M. M.; CORREA, C. L.; NICOLI, A.; COSTA, G. M. C. Efeito da época e dose de aplicação de fungicida no controle da antracnose do sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 563-570. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 15. | | NOLASCO, A. A. R.; COSTA, R. V. da; COTA, L. V.; SILVA, D. D.; COSTA, G. M. C.; LANZA, F. E.; PARREIRA, D. F.; RAMOS, T. C. D.; SILVA, P. G.; SILVA, O. A. da. Controle químico de grãos ardidos em milho. Informativo ABRATES, Londrina, v. 21, n. 2, ago. 2011. Edição dos Anais do XVII Congresso Brasileiro de Sementes, Natal, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | RAMOS, T. C. D'. de A. R.; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; COSTA, R. V. da; LANZA, F. E.; NICOLI, A.; COSTA, G. M. C.; MOURA, L. de O.; CORREA, C. L.; MARCONDES, M. Recomendação para o controle químico da helmintosporiose do sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 768-774. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 17. | | NICOLI, A.; ZAMBOLIM, L.; COSTA, R. V. da; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; LANZA, F. E.; RAMOS, T. C. D'. de A.; MARCONDES, M. M.; MOURA, L. de O.; CORREA, C. L. Reação de plantas de milho inoculadas nas folhas e no colmo com diferentes isolados de Colletotrichum graminicola. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 474-480. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | RAMOS, T. C. D'. de A.; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; COSTA, R. V. da; LANZA, F. E.; NICOLI, A.; COSTA, G. M. C.; MOURA, L. de O.; CORREA, C. L.; MARCONDES, M. Resistência de sorgo a Ramulispora sorghi. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 761-767. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | RAMOS, T. C. D. A.; COTA, L. V.; COSTA, R. V.; SILVA, D. D. da; NOLASCO, A. A. R.; LANZA, F. E.; PARREIRA, D. F.; COSTA, G. M. C. Virulência de isolados de Exserohilum turcicum em genótipos de sorgo. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, p. 980, ago. 2011. Suplemento. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves. Resumo 1404.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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