BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sul.
Data corrente:  10/05/2011
Data da última atualização:  04/08/2011
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  STEIBEL, J. P.; BATES, R. O.; ROSA, G. J. M.; TEMPELMAN, R. J.; RILINGTON, V. D.; RAGAVENDRAN, A.; RANEY, NANCY E.; RAMOS, A. M.; CARDOSO, F. F.; EDWARDS, D. B.; ERNST, C. W.
Afiliação:  JUAN PEDRO STEIBEL, Department of Animal Science, Michigan State University; RONALD O. BATES, Department of Animal Science, Michigan State University; GUILHERME J. M. ROSA, Department of Animal Sciences, University of Wisconsin; ROBERT J. TEMPELMAN, Department of Animal Science, Michigan State University; VALENCIA D. RILINGTON, Department of Animal Science, Michigan State University; ASHOK RAGAVENDRAN, Department of Animal Science, Michigan State University; NANCY E. RANEY, Department of Animal Science, Michigan State University; ANTONIO MARCOS RAMOS, Department of Animal Science, Michigan State University; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; DAVID B. EDWARDS, Department of Animal Science, Michigan State University; ERNST, C. W., Department of Animal Science, Michigan State University.
Título:  Genome-wide linkage analysis of global gene expression in loin muscle tissue identifies candidate genes in pigs.
Ano de publicação:  2011
Fonte/Imprenta:  PLoS ONE, San Francisco, v. 6, n. 2, e16766, Feb. 2011.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Background: Nearly 6,000 QTL have been reported for 588 different traits in pigs, more than in any other livestock species. However, this effort has translated into only a few confirmed causative variants. A powerful strategy for revealing candidate genes involves expression QTL (eQTL) mapping, where the mRNA abundance of a set of transcripts is used as the response variable for a QTL scan. Methodology/Principal Findings: We utilized a whole genome expression microarray and an F2 pig resource population to conduct a global eQTL analysis in loin muscle tissue, and compared results to previously inferred phenotypic QTL (pQTL) from the same experimental cross. We found 62 unique eQTL (FDR ,10%) and identified 3 gene networks enriched with genes subject to genetic control involved in lipid metabolism, DNA replication, and cell cycle regulation. We observed strong evidence of local regulation (40 out of 59 eQTL with known genomic position) and compared these eQTL to pQTL to help identify potential candidate genes. Among the interesting associations, we found aldo-keto reductase 7A2 (AKR7A2) and thioredoxin domain containing 12 (TXNDC12) eQTL that are part of a network associated with lipid metabolism and in turn overlap with pQTL regions for marbling, % intramuscular fat (% fat) and loin muscle area on Sus scrofa (SSC) chromosome 6. Additionally, we report 13 genomic regions with overlapping eQTL and pQTL involving 14 local eQTL. Conclusions/Significance: Results of this analysis... Mostrar Tudo
Thesagro:  Genética; Suíno.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/33973/1/METAS-2011-FFC-Steibel-et-al-2011-PLoS-ONE-62-e16766.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CPPSUL12163 - 1UPCAP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; TEMPELMAN, R. J. Linear reaction norm models for genetic merit prediction of Angus cattle under genotype by environment interaction. Journal of Animal Science, Champaign, v. 90, n. 7, p. 2130-2141, July 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; SHIOTSUKI, L.; TEMPELMAN, R. J. Metodologia para estimação do mérito genético de animais com paternidade incerta sob inferência bayesiana. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2008. 48 p. il. color. (Embrapa Pecuária Sul. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 32).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M. de; TEMPELMAN, R. J. Genotype by environment interaction and prediction of genetic merit. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society of Animal Science, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M.; QUEIJO, O. M. L.; TEMPELMAN, R. J. Metodologia para avaliação genética de populações multirraciais usando modelos hierárquicos bayesianos. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2008. il. (Embrapa Pecuária Sul. Documentos, 75).
Tipo: Documentos
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5.Imagem marcado/desmarcadoMOTA, R. R.; TEMPELMAN, R. J.; CARDOSO, F. F.; AGUILAR, I. G.; LOPES, P. S. Genomic wide-selection for tick resistance in Hereford and Braford cattle via reaction norm model. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; STEIBEL, J. P.; ROSA, G. J. M.; ERNST, C. W.; BATES, R. O.; TEMPELMAN, R. J. Assessment of different selective phenotyping design strategies for genomics studies with outbred F2 populations. Journal of Animal Science, Savoy, v. 85, p. 373, 2007. Supplement 1.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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7.Imagem marcado/desmarcadoMOTA, R. R.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S.; TEMPELMAN, R. J.; SOLLERO, B. P.; AGUILAR, I.; CARDOSO, F. F. Analyses of reaction norms reveal new chromosome regions associated with tick resistance in cattle. Animal, v. 12, n. 2, p. 205-214, Feb. 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; ROSA, G. J. de M.; TEMPELMAN, R, J.; TORRES JUNIOR, R. A. de A. Modelos hierárquicos bayesianos para estimação robusta e análise de dados censurados em melhoramento animal. Revista Brasileira de Zootecnia, v.38, p. 72-80, jul. 2009. Suplemento especial. Edição dos Anais da 46. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2009, Maringá.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota TécnicaCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sul.
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9.Imagem marcado/desmarcadoMOTA, R. R.; TEMPELMAN, R. J.; LOPES, P. S.; AGUILAR, I.; SILVA, F. F.; CARDOSO, F. F. Genotype by environment interaction for tick resistance of Hereford and Braford beef cattle using reaction norm model. Genetics Selection Evolution, v. 48, 14 Jan. 2016. Article 3.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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10.Imagem marcado/desmarcadoMOTA, R. R.; LOPES, P. S.; TEMPELMAN, R. J.; SILVA, F. F.; AGUILAR, I.; GULIAS GOMES, C. C.; CARDOSO, F. F. Genome-enabled prediction for tick resistance in Hereford and Braford beef cattle via reaction norm models. Journal of Animal Science, v. 94, n. 5, p. 1834-1843, May 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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11.Imagem marcado/desmarcadoERNST, C. W.; STEIBEL, J. P.; ROSA, G. J. M.; TEMPELMAN, R. J.; BATES, R. O.; RILINGTON, V. D.; RAGAVENDRAN, A.; RANEY, N. E.; RAMOS, A. M.; CARDOSO, F. F.; EDWARDS, D. B. Genome-wide expression QTL (eQYL) analysis of loin muscle tissue to identify candidate genes in pigs. In: ADSA CSAS ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2009, Montreal. Electronic abstracts... Champaign: ADSA: ASAS, 2009. LB4. Publicado em: Jornal of Animal Science, Champaign, v. 87, p. ii, 2009. Electronic Supplement 2.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoSTEIBEL, J. P.; BATES, R. O.; ROSA, G. J. M.; TEMPELMAN, R. J.; RILINGTON, V. D.; RAGAVENDRAM, A.; RANEY, N. E.; RAMOS, A. M.; CARDOSO, F. F.; EDWARDS, D. B.; ERNST, C. W. Genome-wide linkage analysis of gene expression of loin muscle tissue identifies candidate genes in pigs. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society of Animal Science, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoSTEIBEL, J. P.; BATES, R. O.; ROSA, G. J. M.; TEMPELMAN, R. J.; RILINGTON, V. D.; RAGAVENDRAN, A.; RANEY, NANCY E.; RAMOS, A. M.; CARDOSO, F. F.; EDWARDS, D. B.; ERNST, C. W. Genome-wide linkage analysis of global gene expression in loin muscle tissue identifies candidate genes in pigs. PLoS ONE, San Francisco, v. 6, n. 2, e16766, Feb. 2011.
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