BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Área de Informação da Sede; Embrapa Soja.
Data corrente:  24/03/2011
Data da última atualização:  14/10/2011
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.
Afiliação:  RENATA STOLF-MOREIRA, UNESP Jaboticabal; ELIANA GERTRUDES DE MACEDO LEMOS, UNESP Jaboticabal; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; MAGDA APARECIDA BENEVENTI, UFRGS; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA, UEL; SELMA DOS SANTOS PEREIRA, UEL; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO.
Título:  Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean.
Ano de publicação:  2011
Fonte/Imprenta:  Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: Gm?-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the Gm?-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis.
Palavras-Chave:  Déficit hídrico; Estabilidade de expressão; Expressão gênica; Expression stability; RT-qPCR.
Thesagro:  Biotecnologia; Deficiência hídrica; Glycine Max; Soja.
Thesaurus Nal:  Agricultural biotechnology; Gene expression; Plant-water relations; Soybeans.
Categoria do assunto:  --
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/31023/1/46n01a08.pdf
http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168638/1/Identification-of-reference-genes-for-expression.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Soja (CNPSO)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
AI-SEDE49731 - 1UPEAP - PP630.72081P474
CNPSO31940 - 1UPCAP - PP

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Registros recuperados : 16
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1.Imagem marcado/desmarcadoFANTIN, L. H.; MEDRI, M. E.; GABRIEL, L. C.; NEUMAIER, N.; STOLF-MOREIRA, R. Anatomical characterization in soybean plants with soja louca II from SINOP-MT Brazil. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 9., 2013, Durban. [Proceedings...]. Durban: OPDT: OPOT, 2013. Abst. 133. 1 CD-ROM. WSRC.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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2.Imagem marcado/desmarcadoPOLIZEL-PODANOSQUI, A. M.; PEREIRA, R. M.; STOLF-MOREIRA, R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Identificação de genes diferencialmente expressos em soja em resposta à Phakopsora pachyrhizi pela metodologia ACP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 12, res. 1.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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3.Imagem marcado/desmarcadoROMERO, C. C. T.; STOLF-MOREIRA, R.; BRITO JUNIOR, S. L.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Phenotypic and molecular analysis of an incompatible interaction between soybean and the fungus Uromyces appendiculatus. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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4.Imagem marcado/desmarcadoCALZAVARA, A. K.; PAIVA, P. H. G.; GABRIEL, L. C.; OLIVEIRA, A. L. M.; MILANI, K.; OLIVEIRA, H. C.; BIANCHINI, E.; PIMENTA, J. A.; OLIVEIRA, M. C. N. de; DIAS-PEREIRA, J.; STOLF-MOREIRA, R. Associative bacteria influence maize (Zea mays L.) growth, physiology and root anatomy under different nitrogen levels. Plant biology, v. 20, n. 5, p. 870-878, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
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5.Imagem marcado/desmarcadoSTOLF-MOREIRA, R.; MEDRI, M. E.; NEUMAIER, N.; LEMOS, N. G.; BROGIN, R. L.; MARCELINO, F. C.; OLIVEIRA, M. C. N. de; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Cloning and quantitative expression analysis of drought-induced genes in soybean. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n. 2, p. 858-867, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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6.Imagem marcado/desmarcadoLINO, E. J.; STOLF-MOREIRA, R.; PEREIRA, R. M.; ROMERO, C. C. T.; SILLA, P. R.; NASCIMENTO, L. S. do; NASCIMENTO, L. C. do; CARAZZOLLE, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Genome-wide expression profiling of a incompatible interaction between Glycine max and Phakopsora pachyrizi revealed by next-generation sequencing. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 246-247.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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7.Imagem marcado/desmarcadoSTOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Área de Informação da Sede; Embrapa Soja.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSTOLF-MOREIRA, R.; MEDRI, M. E.; NEUMAIER, N.; LEMOS, N. G.; PIMENTA, J. A.; TOBITA, S.; BROGIN, R. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; OLIVEIRA, M. C. N.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Soybean physiology and gene expression during drought. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n. 4, p. 1946-1956, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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9.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, S. S.; GUIMARÃES, F. C. M.; CARVALHO, J. F. C.; STOLF-MOREIRA, R.; OLIVEIRA, M. C. N.; ROLLA, A. A. P.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Transcription factors expressed in soybean roots under drought stress. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 10, n. 4, p. 3689-3701, Oct. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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10.Imagem marcado/desmarcadoPOLIZEL, A. M.; MEDRI, M. E.; NAKASHIMA, K.; YAMANAKA, N.; FARIAS, J. R. B.; OLIVEIRA, M. C. N. de; MARIN, S. R. R.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; STOLF-MOREIRA, R.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; NEUMAIER, N.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; CARVALHO, J. F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Molecular, anatomical and physiological properties of a genetically modified soybean line transformed with rd29A:AtDREB1A for the improvement of drought tolerance. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 10, n. 4, p. 3641-3656, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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11.Imagem marcado/desmarcadoALMEIDA, H. O.; BARBOSA, M. de O.; MARQUES, A. E.; PEREIRA, T. H. A.; MAGALHAES JÚNIOR, M. J.; TESSAROLLO, N. G.; GAMES, P. D.; BARROS, E. G. de; STOLF-MOREIRA, R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, P. R. G.; BARACAT-PEREIRA, M. C. Enzimas marcadoras de indução de resistência diferencialmente reguladas em soja resistente e suscetível à ferrugem-asiática-da-soja. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 2, p. 163-172, fev. 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
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12.Imagem marcado/desmarcadoROMERO, C. C. T.; STOLF-MOREIRA, R.; BRITO JÚNIOR, S. L.; CATELLI, L. L.; PEREIRA, R. M.; LINO, E. J.; SILLA, P. R.; NASCIMENTO, L. S. do; NASCIMENTO, L. C. do; CARAZZOLLE, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Genome-wide expression analysis of soybean plants under an incompatible interaction with the fungus Uromyces appendiculatus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 219-220.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoKULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. BMC Genomics, v. 12, n. 307, jun. 2011. 17 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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14.Imagem marcado/desmarcadoKULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERÃO, M.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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15.Imagem marcado/desmarcadoBARACAT-PEREIRA, M. C.; ALMEIDA-SOUZA, H. O.; BARBOSA, M. O.; MARQUES, A. E.; PEREIRA, T. H. A.; MAGALHÃES JUNIOR, M. J.; TESSAROLLO, N. G.; GAMES, P. D.; BARROS, E. G.; STOLF-MOREIRA, R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, P. R. G. Soja resistente à ferrugem: participação de compostos voláteis nas respostas de defesa? In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 154, res. 266.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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16.Imagem marcado/desmarcadoSTOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. M.; CARARETO-ALVES, L.; MARCONDES, J.; PEREIRA, S. S.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, R. M.; NEUMAIER, N.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; OLIVEIRA, M. C. N. de; MARCELINO, F. C.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Transcriptional profiles of roots of different soybean genotypes subjected to drought stress. Plant Molecular Biology Reporter, Athens, v. 29, n. 1, p. 19-34, 2011.
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