BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  20/04/2006
Data da última atualização:  17/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  YAMAGISHI, M. E. B.; BEZERRA, G. B. P.; QUINALIA, T.; KUSER, P. R.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; CRUZ, S. A. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; NESHICH, G.; RAY, N.; MAIGRET, B.
Afiliação:  MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; GEORGE B. P. BEZERRA; THIAGO QUINALIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSÉ GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; SÉRGIO APARECIDO BRAGA DA CRUZ, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA; NICHOLAS RAY, Inria Lorraine; BERNARD MAIGRET, Universite Henri Poincare.
Título:  An interative protein interface surface Java Viewer.
Ano de publicação:  2005
Fonte/Imprenta:  In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005.
Páginas:  p. 17.
Idioma:  Inglês
Notas:  X-meeting 2005. Presented posters.
Conteúdo:  More than 50% of protein structures deposited in the PDB database have two or more chains according to the PDB Metrics1 software. Therefore, there are a plenty of protein complexes in the PDB database. It is important to understand the physical-chemical forces that are involved in protein complexes aggregation. In order to facilitate this analyze, it would be desirable to get two protein chains and visualize their contact interface surfaces separately, and paint over each one of them a common physical-chemical property that could be important in the complex formation. Using weighted Delaunay triangulation and marching tetrahedra algorithms from the CGAL library these contact interface surfaces were generated and rendered in an Interactive Java Viewer based on JavaView2 library. The surfaces can be rotated, translated, scaled and it is possible to identify from which amino acid a given vertice came from, among other useful features. All the physical-chemical parameters available in Java Protein Dossier - JPD can be used to paint the surfaces facilitating the analyses.
Palavras-Chave:  Interface; Java.
Thesagro:  Proteína.
Thesaurus Nal:  Proteins.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA11133 - 2UPCRA - DD570.285XME2006.00009
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1.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA; D. CIAMPI, A. Estudos genéticos de Manilkara huberi Ducke A. (CHEV), sapotaceae, com base em marcadores microssatélites: subsídios para o manejo e a conservação da espécie. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 106.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMAGALHÃES, M. T. Q.; SOUZA K. C. D.; CIAMPI, A. Y. Análise da variabilidade genética de Hymenaea courbaril (Jatobá) com uso de marcador molecular RAPD em diferentes biomas do território brasileiro. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 5., 2000, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. p. 41.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA, D.; CIAMPI, A. Y. Sistema de cruzamento e fluxo gênico em maçaranduba Manilkara Huberi (Ducke) A. Chev. na floresta nacional do Tapajós. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 610.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA, D.; CIAMPI, A. Y. Caracterização genética molecular de maçaranduba - anilkara huberi (Ducke) A.Chev. (Sapotaceae): potencial implicação na definição de um programa de manejo sustentável. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 155.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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5.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA, D.; CIAMPI, A. Y. Caracterização genética molecular de maçaranduba - manilkara huberi (Ducke) A.Chev. (Sapotaceae): potencial implicação na definição de um programa de manejo sustentável. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 159.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA, D.; CIAMPI, A. Y. Variabilidade no cpDNA em Manilkara huberi, espécie sob manejo sustentável na Amazônia brasileira. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 7, p. 859-867, jul. 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais.
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7.Imagem marcado/desmarcadoFERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; SILVA, P. H.; SANTOS, V. J.; VILARINHOS, A. D.; CIAMPI, A. Y.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PAPPAS, M. de C. R.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SANTOS, V. J. dos; MILLER, R. N. G; AZEVEDO, V. C. R. Optimization and validation of SSR Markers in banana. In: INTERNATIONAL HORTICULTURAL CONGRESS, 28., 2010, Lisboa. Science and horticulture for people: programme & book of abstracts. Lisboa: ISHS, 2010. 1 CD-ROM. 2 p.759. PDF. S18.208.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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