| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
|
Data corrente: |
14/01/2011 |
|
Data da última atualização: |
20/05/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. |
|
Afiliação: |
DANIELLE COSTENARO-DA-SILVA, UFRGS; GISELE PASSAIA, CNPUV (bolsista); JOÃO A. P. HENRIQUES, UFRGS; ROGÉRIO MARGIS, UFRGS; GIANCARLO PASQUALI, UFRGS; LUIS FERNANDO REVERS, CNPUV. |
|
Título: |
Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. |
|
Ano de publicação: |
2010 |
|
Fonte/Imprenta: |
Plant Science, Limerick, v. 179, n. 5, p. 510-519, nov. 2010. |
|
Volume: |
179 |
|
Páginas: |
510-519 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Sultanine grapevine (Vitis vinifera L.) is one of the most important commercial seedless table-grape varieties and the main source of seedlessness for breeding programs around the world. Despite its commercial relevance, little is known about the genetic control of seedlessness in grapes, remaining unknown the molecular identity of genes responsible for such phenotype. Actually, studies concerning berry development in seedless grapes are scarce at the molecular level. We therefore developed a representational difference analysis (RDA) modified method named Bulk Representational Analysis of Transcripts (BRAT) in the attempt to identify genes specifically associated with each of the main developmental stages of Sultanine grapevine berries. A total of 2400 transcript-derived fragments (TDFs) were identified and cloned by RDA according to three specific developmental berry stages. After sequencing and in silico analysis, 1554 (64.75%) TDFs were validated according to our sequence quality cut-off. The assembly of these expressed sequence tags (ESTs) yielded 504 singletons and 77 clusters, with an overall EST redundancy of approximately 67%. Amongst all stage-specific cDNAs, nine candidate genes were selected and, along with two reference genes, submitted to a deeper analysis of their temporal expression profiles by reverse transcription-quantitative PCR. Seven out of nine genes proved to be in agreement with the stage-specific expression that allowed their isolation by RDA. |
|
Palavras-Chave: |
Desenvolvimento da baga; Expressão gênica; Identificação genética; PCR em tempo real; RDA; Uva de mesa; Uva sem semente. |
|
Thesagro: |
Biologia molecular; Genética; Uva; Viticultura. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/873059/1/PlantScienceRevers2010.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02505naa a2200337 a 4500
001 1873059
005 2019-05-20
008 2010 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCOSTENARO-DA-SILVA, D.
245 $aIdentification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine.$h[electronic resource]
260 $c2010
300 $a510-519 179
490 $v179
520 $aSultanine grapevine (Vitis vinifera L.) is one of the most important commercial seedless table-grape varieties and the main source of seedlessness for breeding programs around the world. Despite its commercial relevance, little is known about the genetic control of seedlessness in grapes, remaining unknown the molecular identity of genes responsible for such phenotype. Actually, studies concerning berry development in seedless grapes are scarce at the molecular level. We therefore developed a representational difference analysis (RDA) modified method named Bulk Representational Analysis of Transcripts (BRAT) in the attempt to identify genes specifically associated with each of the main developmental stages of Sultanine grapevine berries. A total of 2400 transcript-derived fragments (TDFs) were identified and cloned by RDA according to three specific developmental berry stages. After sequencing and in silico analysis, 1554 (64.75%) TDFs were validated according to our sequence quality cut-off. The assembly of these expressed sequence tags (ESTs) yielded 504 singletons and 77 clusters, with an overall EST redundancy of approximately 67%. Amongst all stage-specific cDNAs, nine candidate genes were selected and, along with two reference genes, submitted to a deeper analysis of their temporal expression profiles by reverse transcription-quantitative PCR. Seven out of nine genes proved to be in agreement with the stage-specific expression that allowed their isolation by RDA.
650 $aBiologia molecular
650 $aGenética
650 $aUva
650 $aViticultura
653 $aDesenvolvimento da baga
653 $aExpressão gênica
653 $aIdentificação genética
653 $aPCR em tempo real
653 $aRDA
653 $aUva de mesa
653 $aUva sem semente
700 1 $aPASSAIA, G.
700 1 $aHENRIQUES, J. A. P.
700 1 $aMARGIS, R.
700 1 $aPASQUALI, G.
700 1 $aREVERS, L. F.
773 $tPlant Science, Limerick$gv. 179, n. 5, p. 510-519, nov. 2010.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 20 | |
| 7. |  | BUSS, J. H.; GALLI, V.; LABONDE, J.; MESSIAS, R.; SILVA, S. D. dos A. e; MARGIS, R. Expressão de dgat2 ao longo do desenvolvimento de sementes de tungue (Vernicia fordii). In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA, 4.; REUNIÃO TÉCNICA DE AGROENERGIA, 4., 2012, AMRIGS: Porto Alegre. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. Organizado por Sérgio Delmar dos Anjos e Silva Ivan Rodrigues de Almeida.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
|    |
| 8. | | COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. Plant Science, Limerick, v. 179, n. 5, p. 510-519, nov. 2010. 179 510-519| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
| |
| 9. | | COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 206. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
| |
| 10. | | TURCHETTO ZOLET, A. C.; CRUZ, F.; VENDRAMIN, G. G.; SIMON, M. F.; SALGUEIRO, F.; MARGIS PINHEIRO, M.; MARGIS, R. Large-scale phylogeography of the disjunct Neotropical tree species Schizolobium parahyba (Fabaceae-Caesalpinioideae). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 65, p. 174-182, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 11. | | DIAS, B. F. de O.; SIMÕES-ARAÚJO, J. L.; RUSSO, C. A. M.; MARGIS, R.; ALVES-FERREIRA, M. Unravelling MADS-box gene family in Eucalyptus spp.: A starting point to an understanding of their developmental role in trees. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 28, n. 3, Suppl., p. 501-510, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 12. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A brazilian soybean database. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 13. | | MAGALHÃES JÚNIOR, A. M. de; MARTINS, J. F. da S.; TERRES, A. L.; FAGUNDES, P. R. R.; FRANCO; D. F.; MARGIS, R.; MARGIS, M.; DODE, L. B.; PETERS, J. A. Desenvolvimento de linhagens transgênicas de arroz irrigado( Oryza sativa L.) através da engenharia genética. Pelotas: Embrapa-CPACT, 1999. 4 p. (EMBRAPA- CPACT. Pesquisa em Andamento, 51)| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 14. | | PIROVANI, C. P.; SANTIAGO, A. da S.; SANTOS, L. S. dos; MICHELI, F.; MARGIS, R.; GESTEIRA, A. da S.; ALVIM, F. C.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. de M. Theobroma cacao cystatins impair Moniliophthora perniciosa mycelial growth and are involved in postponing cell death symptoms. Planta, Heidelberg, v. 232, n. 6, p. 1485–1497, 2010. Disponível em: <http://www.springerlink.com/content/c41483451417h040/fulltext.pdf>. Acesso em 26 out. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 15. | | WEBER, R. L. M. W.; WIEBKE-STROHM, B.; BREDEMEIER, C.; MARGIS-PINHEIRO, M.; BRITO, G. G. de; RECHENMACHER, C.; BERTAGNOLLI, P. F.; SÁ, M. E. L. de; CAMPOS, M. de A.; AMORIM, R. M. S. de; BENEVENTI, M. A.; MARGIS, R.; GROSSI-DE SA, M. F.; BODANESE-ZANETTINI, M. H. Expression of an osmotin-like protein from Solanum nigrum confers drought tolerance in transgenic soybean. BMC Plant Biology, v. 14:343, 2014. (Open Access).| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 16. | | KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. BMC Genomics, v. 12, article 307, jun. 2011. 17 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 17. | | KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERÃO, M.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 18. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G.; GROSSI-DE-SA, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J. D.; BENKO-ISEPPON, A. M.; SCHUSTER, I; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BARACAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANNETINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA: a Brazilian Soybean Genome Consortium. In: THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE STATUS OF PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH, 17., 2009, San Diego. Final Abstract Guide. [S.l.], 2009. p. 55, P034.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 19. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G.; GROSSI DE SA, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J. D.; BENKO-ISEPPON, A. M.; SCHUSTER, I; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BARACAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANNETINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA: a Brazilian soybean genome consortium. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 108, ref. O201. Apresentado também no: In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 20. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G. de; SA, M. de F. G. de; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J.; ISEPPON, A. M. B.; SCHUSTER, I.; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BACARAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANETTINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. de M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA - A brazilian soybean genome consortium. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 108, ref. O201. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| Registros recuperados : 20 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
