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Biblioteca(s):  Embrapa Mandioca e Fruticultura.
Data corrente:  20/12/2010
Data da última atualização:  19/01/2011
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  LOCALI-FABRIS, E. C.; MAFRA, V. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO- ALVES, M.; FRANCISCO, C. S.; FREITAS ASTUA, J. de; KISHI, L. T.; MACHADO, M. A.
Afiliação:  Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Valéria S. Mafra, APTA; Polyana Kelly. Martins, APTA; Marcelo Ribeiro-Alves, Fiocruz; Carolina S. Francisco, APTA; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF; Luciano T. Kishi, APTA; Marcelo A. Machado, APTA.
Título:  Gene set enrichment analysis in sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus.
Ano de publicação:  2010
Fonte/Imprenta:  In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM.
Idioma:  Inglês
Notas:  0058 PSO Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010
Conteúdo:  Huanglongbing (HLB) is known as the most devastating disease of citrus. Two species of Candidatus Liberibacter have been reported in Brazil, Ca. L. asiaticus (CaLas) and Ca. L. americanus (CaLam). Since CaLas is prevalent worldwide, most of the studies have focused that species and very little information is available on CaLam. With the objective to investigate differences in metabolic pathways of Citrus sinensis in response to CaLam, we used a genome- wide microarray approach to identify differentially expressed genes in symptomatic plants when compared to control plants. Hybridizations were performed by Roche Nimblegen with a customized 385K chip containing 32,000 unigenes of C. sinensis. The raw data were pre-processed using the Robust Multiarray Average (RMA). Normalized data were imported to R/Bioconductor where statistical analyses were performed. A Bayesian moderated t-test was calculated and p-values were adjusted for multiple comparisons by the false discovery rate correction. A total of 634 genes with P-values ?0.05, fold change |FC| ? 2.0 and odds probability ? 0.95 were considered differentially expressed. From those, 419 were up- and 215 down-regulated in symptomatic plants. In order to identify enriched gene ontologies regulated in infected plants we applied a gene set enrichment analysis approach and found 45 different biological processes including those involved in response to jasmonic acid stimulus, signaling and metabolism, 17 molecular functions, includin... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Huanglongbing; Plant disease.
Thesagro:  Doença de Planta; Fruta Cítrica.
Thesaurus Nal:  Candidatus Liberibacter; Citrus.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPMF27091 - 1UPCPL - PPCD 2010.0112010.011
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1.Imagem marcado/desmarcadoPAULA, L. B. de; LIN. H.; STUCHI, E. S.; FRANCISCO, C. S.; SAFADY, N. G.; COLETTA-FILHO, H. D. Genetic diversity of 'Candidatus Liberibacter asiaticus' in Brazil analyzed in different geographic regions and citrus varieties. European Journal of Plant Pathology, v.154, p.863-872, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMAFRA, V.; MARTINS, P. K; FRANCISCO, C. S.; RIBEIRO-ALVES, M.; ASTUA, J. de F.; MACHADO, M. A. Candidatus Liberibacter americanus induces significant reprogramming of the transcriptome of the susceptible citrus genotype. BMC Genomics, p.14-247, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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3.Imagem marcado/desmarcadoBOVANAES, L.; STUCHI, E. S.; SAFADY, N. G.; FRANCISCO, C. S.; GIL, M. C. S.; COLETTA-FILHO, H. D. Genetic structure of Candidatus Liberibacter asiaticus in brazil: the geographic regions and host effects. In: INTERNATIONAL CITRUS CONGRESS, 2016, Foz do Iguaçu. Sustainable citriculture: the role of applied knowledge: abstract book. Londrina: IAPAR; Campinas: IAC, 2016. Resumo S6-319, p. 88.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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4.Imagem marcado/desmarcadoLOCALI-FABRIS, E. C.; MAFRA, V. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO- ALVES, M.; FRANCISCO, C. S.; FREITAS ASTUA, J. de; KISHI, L. T.; MACHADO, M. A. Gene set enrichment analysis in sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus. In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM. 0058 PSO Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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