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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
25/04/2006 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Autoria: |
SANTOS, M. T.; FERRAZ, L. F. C.; REIS, F. C.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.; OTTOBONI, L. M. M. |
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Afiliação: |
CBMEG/Unicamp; CBMEG/Unicamp; CBMEG/Unicamp; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; GORAN NESIC, CNPTIA; CBMEG/Unicamp. |
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Título: |
Análise estrutural e funcional da proteína CMP quinase de Acidithiobacillus ferrooxidans. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóias: SBG, 2005. |
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Páginas: |
p. 1075. |
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ISBN: |
85-89109-05-4 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Na publicação: Falcão, PK. |
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Conteúdo: |
Acidithiobacilius ferrooxidans é uma bactéria Gram-negativa de grande importância econômica, envolvida na biolixiviação de metais. A biolixiviação pode ser afetada por vários fatores dentre eles, alterações no pH ótimo de cultivo da bactéria (pH 1,8). Curvas de crescimento e experimentos de respirometria mostraram que tanto o crescimento quanto o consumo de oxigênio são afetados quando a bactéria é cultivada em pH 1,2 e 3,0. A análise da expressão diferencial de genes através de RAP-PCR (RNA arbitrarily primed polymerase chain reaction), utilizando RNA isolado de células cultivadas em diferentes pHs, permitiu o isolamento de um cDNA com expressão mais acentuada em pH 1,8. A seqüência deste cDNA apresentou similaridade com o gene cmk que codifica a enzima citosina monofosfato quinase (CMP quinase). Esta enzima é essencial para o crescimento da bactéria pois catalisa a fosforilação de nucleosídeos monofosfato (preferencialmente citosina - CMP), passo indispensável na síntese de ácidos nucléicos. A seqüência completa do gene foi obtida com base no genoma não anotado de Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC23270 (www.tigr.com). Uma busca por estruturas que poderiam ser utilizadas na modelagem desta proteína foi realizada no banco de dados de estruturas de proteínas (PDB-Protein Data Bank). Como resultado obtivemos duas estruturas, uma CMP quinase complexada com substrato e outra em sua forma livre, ambas com identidade superior a 55%. Utilizando o programa de modelagem MODELLER foram obtidos dois modelos tri-dimensionais da enzima CMP quinase de A. ferrooxidans. A avaliação e análise estrutural destes modelos com o objetivo de entender melhor o funcionamento desta enzima está sendo feita com o auxílio do programa Gold STING. As diferenças estruturais observadas entre os dois modelos são resultado da presença do substrato. A modelagem molecular estrutural permite fazer análises funcionais com base na estrutura tridimensional da proteína. A expressão reprimida do gene cmk em diferentes pHs ressaltam a importância do pH ótimo na expressão de genes relevantes em Acidithiobacillus ferrooxidans. MenosAcidithiobacilius ferrooxidans é uma bactéria Gram-negativa de grande importância econômica, envolvida na biolixiviação de metais. A biolixiviação pode ser afetada por vários fatores dentre eles, alterações no pH ótimo de cultivo da bactéria (pH 1,8). Curvas de crescimento e experimentos de respirometria mostraram que tanto o crescimento quanto o consumo de oxigênio são afetados quando a bactéria é cultivada em pH 1,2 e 3,0. A análise da expressão diferencial de genes através de RAP-PCR (RNA arbitrarily primed polymerase chain reaction), utilizando RNA isolado de células cultivadas em diferentes pHs, permitiu o isolamento de um cDNA com expressão mais acentuada em pH 1,8. A seqüência deste cDNA apresentou similaridade com o gene cmk que codifica a enzima citosina monofosfato quinase (CMP quinase). Esta enzima é essencial para o crescimento da bactéria pois catalisa a fosforilação de nucleosídeos monofosfato (preferencialmente citosina - CMP), passo indispensável na síntese de ácidos nucléicos. A seqüência completa do gene foi obtida com base no genoma não anotado de Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC23270 (www.tigr.com). Uma busca por estruturas que poderiam ser utilizadas na modelagem desta proteína foi realizada no banco de dados de estruturas de proteínas (PDB-Protein Data Bank). Como resultado obtivemos duas estruturas, uma CMP quinase complexada com substrato e outra em sua forma livre, ambas com identidade superior a 55%. Utilizando o programa de modelagem MODELLER fo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Biolixiviação de metais; Proteína CMP quinase. |
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Thesagro: |
Bactéria. |
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Thesaurus Nal: |
Acidithiobacillus ferrooxidans. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 59 | |
| 7. |  | SANTOS, E. F. dos; KAMCHEN, S. G.; VENDRUSCULO, L. G.; LOPES, L. B. Processamento de imagens 3D visando análises morfométricas em bovinos nelore. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 3.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 8., 2019, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2019. p. 91. Editores Técnicos: Alexandre Ferreira do Nascimento, Bruno Rafael da Silva, Edison Ulisses Ramos Junior, Eulália Soler Sobreira Hoogerheide, Isabela Volpi Furtini, José Ângelo Nogueira de Menezes Júnior, Marina Moura Morales, Silvio Tulio...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 8. | | ARAÚJO, E. de O.; CAMACHO, M. A.; SANTOS, E. F. dos; CÂMARA, A. P. Eficiência de absorção, transporte e utilização de BORO e ZINCO pelo algodoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p.1580-1586| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 10. | | SILVA, A. M. O.; TAVARES-DIAS, M.; FERNANDES, J. S.; SANTOS, E. F. Helmintos do jaraqui-escama-grossa Semaprochilodus insignis (Prochilodontidae) na Amazônia Central. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA DE PESCA, 17., 2011, Belém, PA. Engenharia de pesca: construindo o desenvolvimento sustentável do setor pesqueiro nacional: [anais]. Belém, PA: AEP: FAEP, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 11. | | GONÇALVES, R. A.; SANTOS, E. F.; OLIVEIRA, M. S. B.; PINHEIRO, D. A.; TAVARES-DIAS, M. Fauna parasitária de Hypostomus emarginatus Valenciennes, 1840 e Harttia duriventris Rapp-py-Daniel & Oliveira, 2001 (Loricariidae) da planície de inundação do Estado do Amapá. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE PATOLOGISTAS DE ORGANISMOS AQUÁTICOS, 11., 2012, Bonito, MS. Sanidade e ambiente aquático: compromisso com a sustentabilidade: [resumos]. Maringá: ABRAPOA, 2012. 1 CD-ROM. ENBRAPOA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 13. | | GONÇALVES, R. A.; OLIVEIRA, M. S. B.; SANTOS, E. F.; TAVARES-DIAS, M. Aspectos ecológicos da comunidade de parasitos em duas espécies de Loricariidae da Bacia Igarapé Fortaleza, Estado do Amapá, Brasil. Biota Amazônia, Macapá, v. 4, n.1, p. 15-21, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 14. | | ARAÚJO, E. de O.; CAMACHO, M. A.; SANTOS, E. F. dos; CÂMARA, A. P. Teor, conteúdo, eficiência de absorção, transporte e utilização de nitrogênio e fósforo pelo algodoeiro cultivado sob diferentes concentrações de BORO e ZINCO. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p.1709-1717| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 15. | | DIAS, M. T.; NEVES, L. R.; SANTOS, E. F.; DIAS, M. K. R.; MARINHO, R. G. B.; ONO, E. A. Prevalência do crustáceo Perulernaea gamitanea Thatcher & Paredes, 1985 (Copepoda: Lernaeidae), em Colossoma macropomum (Characidae) e seus híbridos tambacu e tambatinga cultivados na Amazônia Oriental. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE PATOLOGISTAS DE ORGANISMOS AQUÁTICOS, 11., 2010, Campinas. [Anais...]. Maringá: ABRAPOA; Campinas: UNICAMP, 2010. ENBRAPOA. Resumo simples.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 16. | | PINHEIRO, D. A.; TAVARES-DIAS, M.; DIAS, M. K. R.; SANTOS, E. F.; MARINHO, R. das G. B. Primeiro registro da ocorrência de protozoários em tamoatá Hoplosternum littorale no Brasil. Boletim do Instituto de Pesca, São Paulo, v. 39, n. 2, p. 169-177, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 17. | | TAVARES-DIAS, M.; NEVES, L. R.; SANTOS, E. F.; DIAS, M. K. R.; MARINHO, R. G. B.; ONO, E. A. Perulernaea gamitanae (Copepoda: Lernaeidae) parasitizing tambaqui (Colossoma macropomum) (Characidae) and the hybrids tambacu and tambatinga, cultured in northern Brazil. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 63, n. 4, p. 988-995, Aug. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 18. | | SANTOS, E. F. dos; ARAUJO, E. de O.; CAMACHO, M. A.; CÂMARA, A. P.; OLIVEIRA, L. P. de. Produção de biomassa por genótipos de Gossypium barbadense em resposta ao fosforo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p.1645-1650| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 19. | | PINHEIRO, D. A.; TAVARES-DIAS, M.; DIAS, M. W. R.; SANTOS, E. F.; MARINHO, R. G. B. Protozoários parasitando brânquias de Hoplosternum littorale (Siluriformas, Callichthyidae) de área de várzea no Estado do Amapá. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA DE PESCA, 17., 2011, Belém, PA. Engenharia de pesca: construindo o desenvolvimento sustentável do setor pesqueiro nacional: [anais]. Belém, PA: AEP: FAEP, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 20. | | SANTOS, E. F. dos; ARAÚJO, E. de O.; CAMACHO, M. A.; CÂMARA, A. P.; MARCANTE, N. C. Eficiência de absorção, translocação e utilização de nitrogenio por genótipos de Gossypium barbadense cultivado sob diferentes doses de fosforo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p. 1574-1579| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| Registros recuperados : 59 | |
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