BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária.
Data corrente:  25/01/2010
Data da última atualização:  01/03/2010
Tipo da produção científica:  Software
Autoria:  YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H.
Afiliação:  MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ROBERTO HIROCHI HERAI, UNICAMP.
Título:  MappingTools. Versão 1.0.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009.
Descrição Física:  1 CD-ROM.
Idioma:  Português
Conteúdo:  Ferramenta que integra outros sistemas de mapeamento de sequências de dados biológicas em distintos genomas de referência, tanto animais quanto de plantas. Funcional no estudo de mapeamento de sequências na tentativa de identificação de novos padrões biológicos. Instalação do Software Mapping Tools. -configurar os arquivo software/Bioinf/src/AddressBundle.properties, especificando os seguintes itens: -localização das bases de dados: genomas; -localização das ferramentas externas: mapeamento; -construir, com uso da ferramenta NetBeans, arquivo de distribuição em formato WAR, e hospedar em algum diretório de um servidor de aplicações com suporte a sistemas Java para WEB, como Apache Tomcat 6.0. -para executá-lo, acessar o endereço: http://www.ip_servidor:porta/Bioinf/gui/content/tools/blat/insertOneSequence.jsp
Palavras-Chave:  Dados biológicos; Mapeamento.
Thesagro:  Animal; Genoma; Planta.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA14520 - 1UMTSW - CDMAPP_Tools1.02010.00003

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1.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. bayesDNA. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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2.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. Mathematical grammar of biology. Switzerland: Springer, 2017. 82 p. il. (Springer briefs in mathematics).
Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros
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3.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. NGS_KmerFreq. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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4.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. GCSPR. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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5.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. FLCDNA2GENOME. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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6.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. FLCDNA2MRNA. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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7.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. HinvClusterFilter. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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8.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. HinvTissueIdentification. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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9.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B. Projeções ortogonais sobre conjuntos convexos para restauração de imagens comprimidas pelo JPEG. Revista Ciência e Tecnologia, Americana, v. 7, n. 10, p. 55-68, jun. 2004.
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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10.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff's "Grammar of Biology": new fractal-like rules. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts]... [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster P1003.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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11.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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12.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. MappingTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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13.Imagem marcado/desmarcadoROMANIUC, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. JM-CNV. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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14.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; SHIMABUKURO, A. I. Nucleotide frequencies in human genome and Fibonacci numbers. Bulletin of Mathematical Biology, v. 70, n. 3, p. 643-653, Apr. 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
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15.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of human interchromosomal trans-splicing in sequence databanks. Briefings in Bioinformatics, London, v. 2, n. 2, p. 198-209, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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16.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detecting evidences of inter-chromosomal trans-spliced genes using a bioinformatic approach. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-meeting 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A bioinformatics approach to detect interchromosomal trans-splicing in bovine full length cDNA databanks. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 18., 2010, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. Não paginado. P869. PAG-XVIII.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FusionFinder. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.
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19.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; YAMAGISHI, M. E. B. gene_name_to_refseq. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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20.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FastaSequenceTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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