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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
06/01/2010 |
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Data da última atualização: |
06/01/2010 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
AGUIAR, B. G. A.; SOUZA, I. G. B. de; SANTOS, M. F. dos; LIMA, P. S. da C. |
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Afiliação: |
Bruno Guedes Alcoforado Aguiar, Faculdade NOVAFAPI; Isis Gomes Brito de Souza, UFPI; Michelli Ferreira dos Santos, UFPI; Paulo Sarmanho da Costa Lima, Embrapa Meio-Norte. |
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Título: |
Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 26., 2009, Gramado. Agricultura forte: alimento, energia e meio ambiente. Gramado: CONFAEAB: SARGS, 2009. Ref. T108 |
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Páginas: |
4 p. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso. |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Espécie oleaginosa. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aO Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 2. |  | RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 3. | | SANTOS, M. F.; SOUZA, I. G. B.; GOMES, S. O.; SILVA, G. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of microsatellite markers in the spiny lobster, Panulirus echinatus Smith, 1869 (Decapoda: Palinuridae) by Illumina MiSeq sequencing. Journal of Genetics, v. 97, Online resources, p. e25-e30, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 5. | | GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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| 6. | | RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 7. | | SOUZA, I. G. B.; VALENTE, S. E. S.; BRITTO, F. B.; SOUZA, V. A. B. de; LIMA, P. S. da C. RAPD analysis of the genetic diversity of mango (Mangifera indica) germplasm in Brazil. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 10, n. 4, p. 3080-3089, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | SANTOS, M. F. dos; SOUZA, I. G. B. de; LIMA, P. S. da C.; NASCIMENTO, M. P. S. B. C. do. Seleção de primers RAPD para análise de diversidade genética em canafístula (Senna spectabilis). In: SIMPOSIO INTERNACIONAL SOBRE MELHORAMENTO DE FORRAGEIRAS, 2., 2009, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. ref. B05. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 9. | | SOUZA, I. G. B. de; KRAEMER, J. E. G.; DINIZ, F. M.; SOUZA, V. A. B. de; BRITTO, F. B.; LIMA, P. S. da C. Seleção de primers para o uso de RAPD na análise de diversidade genética em manga (Mangifera indica L.). In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 7.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 4.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 5.; SEMINÁRIO DE EXTENSÃO, 1., 2007, Teresina. Produção científica na realidade comtemporânea: anais. Teresina: UESPI-PROP, 2007. 6 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 10. | | SANTOS, M. F. dos; SOUZA, I. G. B. de; ARAÚJO, E. C. E.; SOUZA, V. A. B. de; SITTOLIN, I. M.; LIMA, P. S. da C. Análise de similaridade de genótipos de babaçu (Orbignya phalerata Mart) com base no marcador RAPD. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 4 p. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | SOUZA, I. G. B.; PATERSON, I.; McBRIDE, M. C.; SOUZA, B. A.; PEREIRA, F. M.; LOPES, M. T. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of 23 microsatellite loci in the stingless bee Melipona subnitida using next-generation sequencing. Conservation Genetics Resources, v. 7, n. 1, p. 239-241, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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