BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  06/11/2008
Data da última atualização:  06/11/2008
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ANDREOTTI, R.; PEDROSO, M. S.; CAETANO, A. R.; MARTINS, N. F.
Afiliação:  Renato Andreotti e Silva, CNPGC; Marisela S. Pedroso Centro de Ingiería Genética y Biotecnologia Havana Cuba; Alexandre Rodrigues Caetano, CENARGEN; Natalia Florêncio Martins, CENARGEN.
Título:  Comparison of predicted binders in Rhipicephalus (Boophilus) microplus intestine protein variants BM86 Campo Grande Strain, BM86 and BM95.
Ano de publicação:  2008
Fonte/Imprenta:  Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, São Paulo, v. 17, n. 2, p. 93-98 abr./jun. 2008.
Idioma:  Inglês
Português
Conteúdo:  This paper reports the sequence analysis of Bm86 Campo Grande strain comparing it with Bm86 and Bm95 antigens from the preparations TickGardPLUS and GavacTM, respectively. The PCR product was cloned into pMOSBlue and sequenced. The secondary structure prediction tool PSIPRED was used to calculate alpha helices and beta strand contents of the predicted polypeptide. The hydrophobicity profile was calculated using the algorithms from the Hopp and Woods method, in addition to identification of potential MHC class-I binding regions in the antigens. Pair-wise alignment revealed that the similarity between Bm86 Campo Grande strain and Bm86 is 0.2% higher than that between Bm86 Campo Grande strain and Bm95 antigens. The identities were 96.5% and 96.3% respectively. Major suggestive differences in hydrophobicity were predicted among the sequences in two specific regions. O objetivo deste estudo foi analisar a seqüência de Bm86 cepa Campo Grande comparando-a com os antígenos Bm86 e Bm95 das preparações TickGardPLUS e GavacTM, respectivamente. O produto de PCR foi clonado em PMOSBlue e seqüenciado. Para calcular os conteúdos de alfa-hélice e fita beta do polipeptídio previsto, foi utilizada a ferramenta de prognóstico de estrutura secundária PSIPRED. O perfil de hidrofobicidade foi calculado usando os algoritmos de Hopp e Woods, além da identificação das possíveis regiões de ligação com MHC classe I nos antígenos. O alinhamento "pair-wise" revelou que a similaridade entre Bm86 cepa Cam... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Antigen; Bm86; Bm95; Rhipicephalus (Boophilus) microplus; Tick.
Thesagro:  Antígeno; Carrapato; Imunologia.
Thesaurus NAL:  immunology.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://www.rbpv.ufrrj.br/documentos/1722008/c17293_98.pdf
http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/177498/1/SP-19597-ID-30708.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Corte (CNPGC)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CENARGEN30708 - 1UPCSP - DDSP 1959719597
CNPGC12146 - 1UPCAP - --574.52405

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1.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Bovine genome sequenced: new tools and their applications. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 18.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Embrapa's animal genomics network and biotechnology for economically important traits. In: RDA AND EMBRAPA JOINT WORKSHOP [ON] STRATEGIC RESEARCH COOPERATION ON HORTICULTURE AND ANIMAL SCIENCE, 3., 2013, Suwon. Proceedings... [Jeonju]: RDA; Suwon: Embrapa Labex Korea, 2013. p. 191-214
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Marcadores SNP: conceitos básicos, aplicações no manejo e no melhoramento animal e perspectivas para o futuro. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 38, p. 64-71, 2009. Suplemento especial.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R. Revelado o mapa físico do genoma bovino. In: SANTOS, M. G. B. dos. (Org). Artigos técnicos divulgados na mídia: coletânea 2007. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 244). Publicado em 21/08/2007. Disponível em: Cultivar, cultivar210807; Boletim Pecuário, bpecuario210807; Clicnews, clicnews210807; Pets, pets210807; Hotel Virtual, hvirtual210807; Agrosoft, agrosoft210807; Portal Biotecnologia Ufla,...
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoGIBBS, R. A.; CAETANO, A. R. The genome sequence of taurine Cattle: a window to ruminant biology and evolution. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W085.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoARAÚJO, R. O. de; CAETANO, A. R. Low density genomic data for animal breeding: critical analysis and perspectives of the GoldenGate Beadxpress technology. Ciência Rural, Santa Maria, v. 46, n. 11, p. 2005-2011, nov. 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoREBELATO, A. B.; CAETANO, A. R. Runs of homozygosity for autozygosity estimation and genomic analysis in production animals. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 9, p. 975-984, Sept. 2018
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Área de Informação da Sede; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; GUIMARÃES, M. F. M. Genotipagem dos touros do teste de progênie: Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Associação Brasileira dos Criadores de Girolando, 2008. 1 Folder.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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9.Imagem marcado/desmarcadoIANELLA, P.; CAETANO, A. R.; MCMANUS, C.; PAIVA, S. R. Frequencias alélicas e genotípicas do gene PRNP em rebanhos de ovinos Santa Inês no Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. [Anais...]. [S.l.]: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSTAFUZZA, N. B.; CAETANO, A. R.; AMARAL, M. E. J. Mapeamento RH dos genes APOM, BDA20 e CRABP2 no genoma bovino. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 194.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoFACO, O.; PAIVA, S. R.; LOBO, R. N. B.; VILLELA, L. C. V.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTEL, C. M. Núcleo de consercação e melhoramento genético da raça Morada Nova: resultados preliminares. In: XIMENES, L. J. F.; MARTINS, G. A.; MORAIS, O. R. de; COSTA, L. S. de A.; NASCIMENTO, J. L. S. do (Coord.). Ciência e tecnologia na pecuária de caprinos e ovinos. Fortaleza: Banco do Nordeste do Brasil, 2010. Cap. 12. p. 311-337. (Série BNB. Ciência e Tecnologia, 5).
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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12.Imagem marcado/desmarcadoIANELLA, P.; MCMANUS, C. M. P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Adaptation of a low-cost medium-throughput genotyping system for ovine prion protein gene polymorphims associated with scrapie. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 4, p. 3180-3185, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, J. M. da; CARDOSO, F. F.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Accuracy of low- to medium-density genotype imputation in a Hereford and Braford cattle population from Brazil. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster K11.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sul.
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14.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; ARAÚJO, R. O. de; BIEGELMEYER, P.; CARDOSO, F. F. Aplicações práticas de dados genômicos no melhoramento genético animal: progressos recentes e perspectivas futuras. In: ARAGAO, F. J. L.; MOREIRA, J. R. de A. (Ed.). Mendel: das leis da hereditariedade à engenharia genética. Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 193-218
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoALMEIDA, I. G.; IANELLA, P.; FARIA, M. T.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Bulked segregant analysis of the pirarucu (Arapaima gigas) genome for identification of sex-specific molecular markers. Genetics and Molecular Research v. 12, n. 4, p. 6299-6308, Dec. 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Área de Informação da Sede; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES FILHO, E. A.; STAFUZZA, N. B.; CAETANO, A. R.; AMARAL, M. E. J. Mapeamento de genes do complexo MHC em búfalo de rio utilizando primers derivados do genoma bovino. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 211
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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17.Imagem marcado/desmarcadoLAZZARI, B.; NARDELLI-COSTA, J.; PANZITTA, F.; STELLA, A.; CAETANO, A. R.; MARIANI, P. A pipeline for automatic detection of SNPs in goat polymorphic sequences. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN ASSOCIATION FOR ANIMAL PRODUCTION, 56., 2005, Uppsala, Sweden. Book of abstracts. [Uppsala]: Wageningen Academic Publ., 2005. p. 369.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; EDEAL, J. B.; BURNS, K.; JOHNSON, R. K.; TUGGLE, C. K.; POMP, D. Physical mapping of genes in the porcine ovarian transcriptome. Animal Genetics, Oxford, GB, v. 36, n. 4, p. 322-330, Aug. 2005.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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19.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; LOPA, T. B. P.; BIEGELMEYER, P.; CAETANO, A. R. Avanços nos programas de avaliação genética aplicados à pecuária de corte. In: JORNADA [DO] NÚCLEO DE ESTUDOS EM SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 8.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 1., 2013, Porto Alegre. A vez da inovação na pecuária de corte: anais. Porto Alegre: NESPRO-UFRGS: SENAR, 2013. p. 179-196. 1 CD-ROM. Editores: Maria Eugênia Andrighetto Canozzi, Bárbara Bremm, João Batista Gonçalves Costa Júnior, Júlio Otávio Jardim Barcellos.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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20.Imagem marcado/desmarcadoPAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc. Detection and evaluation of selection signatures in sheep. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018 Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
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