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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
17/11/2006 |
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Data da última atualização: |
28/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; FALCAO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; LUIZ CÉSAR BORRO; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; GORAN NESIC, CNPTIA. |
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Título: |
Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. |
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Páginas: |
18 p. |
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Série: |
(Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 14). |
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ISSN: |
1677-9266 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles obtidos pelas principais técnicas para seleção de parâmetros na literatura.Termos para indexação classificação de enzimas,predição de função de proteínas, estruturas de proteínas, banco de dados de proteínas, seleção de parâmetros, métodos para classsificação de dados. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Classificação de proteínas; Mineração de dados. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/bitstream/doc/2836/1/bp14.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
07/12/2010 |
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Data da última atualização: |
06/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
FAJARDO, C. G.; DAVIDE, L. C.; PEREIRA, A. V. |
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Afiliação: |
CRISTIANE GOUVÊA FAJARDO, UFLA; LISETE CHAMA DAVIDE, UFLA; ANTONIO VANDER PEREIRA, CNPGL. |
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Título: |
Characterization of interphase nuclei from triploid hybrids between Pennisetum purpureum Schumach and Pennisetum glaucum (L.) R. Br. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência e Agrotecnologia, v. 34, n. 5, p. 1124-1128, set./out. 2010. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1413-70542010000500007 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study evaluated the structure and the volume of interphase nuclei from root meristems of the genotypes of napier grass (Pennisetum purpureum), pearl millet (Pennisetum glaucum) and hybrids resultant of such breeding. In napier grass, nuclei were areticulate. Both pearl millet and the triploid hybrid had semi-reticulate nuclei; also, the hybrid presented a small proportion (6%) of areticulate nuclei. Pearl millet had the highest averages of nuclear dimensions, such as volume, diameter and radius, followed by the interspecific hybrid and napier grass. There was no intraspecific variation for the type of nuclear structure, which indicates this feature is important for cytotaxonomic studies involving the genus Pennisetum. Results demonstrated that chromatin organization in these nuclei was influenced by the number and size of chromosomes, affecting the nucleus volume in the analyzed taxa. |
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Palavras-Chave: |
Interphase chromatin; Napier grass; Nuclear volume; Pearl millet. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/868971/1/Vander2010CiencAgrotec2.pdf
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Marc: |
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520 $aThis study evaluated the structure and the volume of interphase nuclei from root meristems of the genotypes of napier grass (Pennisetum purpureum), pearl millet (Pennisetum glaucum) and hybrids resultant of such breeding. In napier grass, nuclei were areticulate. Both pearl millet and the triploid hybrid had semi-reticulate nuclei; also, the hybrid presented a small proportion (6%) of areticulate nuclei. Pearl millet had the highest averages of nuclear dimensions, such as volume, diameter and radius, followed by the interspecific hybrid and napier grass. There was no intraspecific variation for the type of nuclear structure, which indicates this feature is important for cytotaxonomic studies involving the genus Pennisetum. Results demonstrated that chromatin organization in these nuclei was influenced by the number and size of chromosomes, affecting the nucleus volume in the analyzed taxa.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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