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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
28/08/2007 |
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Data da última atualização: |
17/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SIMÕES, M.; BAHIA, D.; ZERLOTINI, A.; TORRES, K.; ARTIGUENAVE, F.; NESHICH, G.; KUSER, P.; OLIVEIRA, G. |
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Afiliação: |
MARIANA SIMÕES, Fiocruz; DIANA BAHIA, Fiocruz; ADHEMAR ZERLOTINI, Fiocruz; KLEIDER TORRES, Fiocruz; FRANÇOIS ARTIGUENAVE, Inra; GORAN NESHICH, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; GUILHERME OLIVEIRA, Fiocruz, Santa Casa de Belo Horizonte. |
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Título: |
Single nucleotide polymorphisms identification in expressed genes of Schistosoma mansoni. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular and Biochemical Parasitology, v. 154, p. 134-140, 2007. |
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DOI: |
10.1016/j.molbiopara.2007.04.003 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphism (SNP) markers have been shown to be useful in genetic investigations of medically important parasites and their hosts. In this paper, we describe the prediction and validation of SNPs in ESTs of Schistosoma mansoni. We used 107,417 public sequences of S. mansoni and identified 15,614 high-quality candidate SNPs in 12,184 contigs. The presence of predicted SNPs was observed in well characterized antigens and vaccine candidates such as those coding for myosin; Sm14 and Sm23; cathepsin B and triosephosphate isomerase (TPI). Additionally, SNPs were experimentally validated for the cathepsin B. A comparative model of the S. mansoni cathepsin B was built for predicting the possible consequences of amino acid substitutions on the protein structure. An analysis of the substitutions indicated that the amino acids were mostly located on the surface of the molecule, and we found no evidence for a significant conformational change of the enzyme. However, at least one of the substitutions could result in a structural modification of an epitope |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Comparative modeling; Computational biology; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Schistosoma Mansoni. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Cathepsin B; Models; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 1. |  | PEREIRA, A. M.; KRUMREICH, F. D.; RAMOS, A. H.; KROLOW, A. C. R.; SANTOS, R. B.; GULARTE, M. A. Physicochemical characterization, carotenoid content and protein digestibility of pumpkin access flours for food application. Food Science and Technology, Campinas, v. 40, Dec. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 3. | | TIMM, N. da S.; RAMOS, A. H.; FERREIRA, C. D.; BIDUSKI, B.; EICHOLZ, E. D.; OLIVEIRA, M. de. Effects of drying temperature and genotype on morphology and technological, thermal, and pasting properties of corn starch. International Journal of Biological Macromolecules, v. 165, Part A, p. 354-364, Dec. 2020. 11 p. BIOMAC.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 4. | | TIMM, N. da S.; EICHOLZ, E. D.; LANG, G. H.; RAMOS, A. H.; FERREIRA, C. D.; OLIVEIRA, M. de. Efeitos de diferentes métodos e temperatura de secagem sobre propriedades químicas da farinha de milho branco. In: REUNIÃO TÉCNICA SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE MILHO E SORGO, 1., 2019, Chapecó. Anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2019. p. 330-333. Misosul.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | AUDINO, L. D.; NOGUEIRA, J. M.; SILVA, P. G. da; NESKE, M. Z.; RAMOS, A. H. B.; MORAES, L. P. de M.; BORBA, M. F. S. Identificação dos coleópteros (insecta: Coleoptera) das regiões de Palmas (município de Bagé) e Santa Barbinha (município de Caçapava do Sul, RS). Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2007. 92 p. il. color. (Embrapa Pecuária Sul. Documentos, 70).| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 6. | | SILVA, P. G. da; GARCIA, M. A. da R.; AUDINO, L. D.; NOGUEIRA, J. M.; MORAES, L. P. de; RAMOS, A. H. B.; VIDAL, M. B.; BORBA, M. F. S. Besouros rola-bosta: insetos benéficos das pastagens. Revista Brasileira de Agroecologia, Porto Alegre, v. 2, n. 2, p. 1428-1432, out. 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 7. | | BORBA, M. F. S.; TRINDADE, J. P. P.; CARDOSO, F. F.; NESKE, M. Z.; AUDINO, L. D.; PILLON, C. N.; MORAES, L. P.; RAMOS, A. H. B.; NOGUEIRA, J.; COSTA, A. C. da; RIBEIRO, M. M.; SCHLICK, F. E. Ecologização da pecuária familiar na Serra do Sudeste. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2009. 68 p. il. color. (Embrapa Pecuária Sul. Documentos, 98)| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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