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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
22/01/2025 |
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Data da última atualização: |
22/01/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, L. L.; DOMINGUES-CASTAÑO, P.; GIANVECCHIO, S. B.; SAKAMOTO, L. S.; RODRIGUES, G. R. D.; SOARES, T. L. da S.; BONILHA, S. F. M.; SANTOS, J. de O.; ALBUQUERQUE, L. G. de; SILVA, J. A. I. de V.; MERCADANTE, M. E. Z. |
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Afiliação: |
LUANA LELIS SOUZA, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; PABLO DOMINGUEZ-CASTAÑO, FUNDACIÓN UNIVERSITARIA AGRARIA DE COLOMBIA-; SARAH BERNARDES GIANVECCHIO, INSTITUTO DE ZOOTECNIA; LEANDRO SANNOMIYA SAKAMOTO, INSTITUTO DE ZOOTECNIA; GUSTAVO ROBERTO DIAS RODRIGUES, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; TAINARA LUANA DA SILVA SOARES, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; SARAH FIGUEIREDO MARTINS BONILHA, CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO; JULIANA DE OLIVEIRA SANTOS MARCATTO, CNPMA; LUCIA GALVÃO ALBUQUERQUE, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; JOSINEUDSON AUGUSTO II VASCONCELOS SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; MARIA EUGÊNIA ZERLOTTI MERCADANTE, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA. |
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Título: |
Heritability estimates and genome-wide association study of methane emission traits in Nellore cattle. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Science, v. 102, skae 82, 2024. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1093/jas/skae182 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The objectives of the present study were to estimate the heritability for daily methane emission (CH4 ) and residual daily methane emission (CH4 res) in Nellore cattle, as well as to perform genome-wide association studies (GWAS) to identify genomic regions and candidate genes influencing the genetic variation of CH4 and CH4 res. Methane emission phenotypes of 743 Nellore animals belonging to 3 breeding programs were evaluated. CH4 was measured using the sulfur hexafluoride (SF6 ) tracer technique (which involves an SF6 permeation tube introduced into the rumen, and an appropriate apparatus on each animal), and CH4 res was obtained as the difference between observed CH4 and CH4 adjusted for dry matter intake. A total of 6,252 genotyped individuals were used for genomic analyses. Data were analyzed with a univariate animal model by the single-step GBLUP method using the average information restricted maximum likelihood (AIREML) algorithm. The effects of single nucleotide polymorphisms (SNPs) were obtained using a single-step GWAS approach. Candidate genes were identified based on genomic windows associated with quantitative trait loci (QTLs) related to the 2 traits. Annotation of QTLs and identification of candidate genes were based on the initial and final coordinates of each genomic window considering the bovine genome ARS-UCD1.2 assembly. Heritability estimates were of moderate to high magnitude, being 0.42 ± 0.09 for CH4 and 0.21 ± 0.09 for CH4 res, indicating that these traits will respond rapidly to genetic selection. GWAS revealed 11 and 15 SNPs that were significantly associated (P < 10−6) with genetic variation of CH4 and CH4 res, respectively. QTLs associated with feed efficiency, residual feed intake, body weight, and height overlapped with significant markers for the traits evaluated. Ten candidate genes were present in the regions of significant SNPs; 3 were associated with CH4 and 7 with CH4 res. The identified genes are related to different functions such as modulation of the rumen microbiota, fatty acid production, and lipid metabolism. CH4 and CH4res presented sufficient genetic variation and may respond rapidly to selection. Therefore, these traits can be included in animal breeding programs aimed at reducing enteric methane emissions across generations. MenosAbstract: The objectives of the present study were to estimate the heritability for daily methane emission (CH4 ) and residual daily methane emission (CH4 res) in Nellore cattle, as well as to perform genome-wide association studies (GWAS) to identify genomic regions and candidate genes influencing the genetic variation of CH4 and CH4 res. Methane emission phenotypes of 743 Nellore animals belonging to 3 breeding programs were evaluated. CH4 was measured using the sulfur hexafluoride (SF6 ) tracer technique (which involves an SF6 permeation tube introduced into the rumen, and an appropriate apparatus on each animal), and CH4 res was obtained as the difference between observed CH4 and CH4 adjusted for dry matter intake. A total of 6,252 genotyped individuals were used for genomic analyses. Data were analyzed with a univariate animal model by the single-step GBLUP method using the average information restricted maximum likelihood (AIREML) algorithm. The effects of single nucleotide polymorphisms (SNPs) were obtained using a single-step GWAS approach. Candidate genes were identified based on genomic windows associated with quantitative trait loci (QTLs) related to the 2 traits. Annotation of QTLs and identification of candidate genes were based on the initial and final coordinates of each genomic window considering the bovine genome ARS-UCD1.2 assembly. Heritability estimates were of moderate to high magnitude, being 0.42 ± 0.09 for CH4 and 0.21 ± 0.09 for CH4 res, indicating t... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Emissão de gases de efeito estufa; QTLs. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado Nelore; Hereditariedade; Melhoramento Genético Animal; Variação Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; genes; Genetic variance; Greenhouse gas emissions; Methane. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 2. |  | VASCONCELOS, R. D. de; VIEGAS, I. de J. M. Avaliação do efeito de níveis de calcário no desenvolvimento e na absorção de nutrientes, em plantas de heliconia (Golden torch). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 3.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 9., 2006, Belém, PA. Agricultura sustentável na Amazônia: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | VASCONCELOS, R. D. de; VIEGAS, I. de J. M.; FRAZAO, D. A. C.; BOTELHO, S. M. Avaliação do efeito de níveis de calcário no desenvolvimento e na absorção de nutrientes, em plantas de heliconia. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 2.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL (AVALIAÇÃO-2004), 8., 2005, Belém, PA. Ciência e tecnologia com inclusão social: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2005. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | CONCEIÇÃO, H. E. O. da; QUADROS, B. R. de; VASCONCELOS, R. D. de; GONÇALVES, M. F.; SILVA, E. S. A. Avaliação de sensibilidade de plantas ao fluoreto atmosférico. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 3., 2004, Brasília, DF. Anais. Brasília, DF: Universidade Católica de Brasília, 2004.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | GONÇALVES, M. F.; VASCONCELOS, R. D. de; QUADROS, B. R. de; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; SILVA, E. S. A. Crescimento e teores de fluoretos em bioindicadores. I. Capsicum sinensis L. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 3., 2004, Brasília, DF. Anais. Brasília, DF: Universidade Católica de Brasília, 2004.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 8. | | QUADROS, B. R. de; GONÇALVES, M. F.; VASCONCELOS, R. D. de; CONCEIÇÃO, H. E. O. da; SILVA, E. S. A. Respostas de crescimento de milho e caupi submetidos a fluoreto de sódio (NaF). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 3., 2004, Brasília, DF. Anais. Brasília, DF: Universidade Católica de Brasília, 2004.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | VASCONCELOS, R. D. de; VIÉGAS, I. de J. M.; FRAZÃO, D. A. C.; BRITO, J. do S. A.; SOUSA, G. O. de; RODRIGUES, E. do S. F. Avaliação da solução nutritiva de Bolle-Jones em plantas de sorriso de maria. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 23, n. 2, p. 581, ago. 2005. Suplemento. Edição dos resumos: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 45.; CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 15.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 2., 2005, Fortaleza, CE.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 10. | | CONCEIÇÃO, H. E. O. da; BARBOSA, A. do S. A.; MONTEIRO, A. L. C.; AGUIAR, M. V.; SILVA, A. do S. D.; VASCONCELOS, R. D. de. Efeitos de concentrações dos sais de N e de P do meio "MS" durante a fase de manutenção de calos de timbo-vermelho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 2., 2003, Porto Seguro. Melhoramento da qualidade de vida: [anais]. Porto Seguro: SBMP, 2003. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 11. | | VIEGAS, I. de J. M.; FRAZAO, D. A. C.; SOUSA, G. O. de; VASCONCELOS, R. D. de; BRITO, J. do S. de A.; RODRIGUES, E. do S. F. Crescimento e sintomas visuais de deficiências de macronutrientes em plantas de Curauá variedade roxo (Ananas erectifolius). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 30., 2005, Recife. Solos, sustentabilidade e qualidade ambiental. Recife: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2005.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | FRAZÃO, D. A. C.; VIEGAS, I. de J. M.; SOUSA, G. O. de; BRITO, J. do S. de A.; RODRIGUES, E. do S. F.; VASCONCELOS, R. D. de. Sintomas visuais de deficiências de macronutrientes em plantas de curauá variedade roxo (Ananas erectifolius). In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82). FERTBIO 2006.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 13. | | SOUSA, G. O. de; VIÉGAS, I. de J. M.; FRAZÃO, D. A. C.; VASCONCELOS, R. D. de; BRITO, J. do S. de A.; RODRIGUES, E. do S. F.; THOMAZ, M. A. A. Efeito de doses de calcário no crescimento de plantas de helicônia cv. Golden Torch em latossolo amarelo barro argilo arenoso. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 23, n. 2, p. 578, ago. 2005. Suplemento. Edição dos resumos: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 45.; CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 15.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 2., 2005, Fortaleza, CE.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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