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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
08/11/2024 |
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Data da última atualização: |
08/11/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, I. C. B.; CARVALHO, A. M. S.; WENDLAND, A.; ROSSATO, M. |
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Afiliação: |
IAN C. BISPO CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALICE MARIA SILVA CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ADRIANE WENDLAND FERREIRA, CNPAF; MAURICIO ROSSATO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
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Título: |
Colorimetric LAMP assay for detection of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in cassava through genomics: a new approach to an old problem. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Disease, v. 108, n. 10, p. 2993-3000, Oct. 2024. |
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ISSN: |
1943-7692 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1094/PDIS-08-23-1507-RE |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial blight caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) is considered the main bacterial disease that affects cassava, causing significant losses when not properly managed. In the present study, a fast, sensitive, and easy-to-apply method to detect Xpm via colorimetric loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was developed. To ensure the use of a unique-to-the-target pathovar core region for primer design, 74 complete genomic sequences of Xpm together with different bacterial species and pathovars were used for comparative genomics. A total of 42 unique genes were used to design 27 LAMP primer sets, from which nine primers were synthesized, and only one (Xpm_Lp1 primer set) showed sufficient efficiency in preliminary tests. The sensitivity, assessed by a serial dilution of the type strain (IBSBF 278) DNA, yielded high sensitivity, detecting up to 100 fg. The LAMP primers showed high specificity, did not cross-react with other bacterial species or other pathovars tested, and amplified only the Xpm isolates. Tests confirmed the high efficiency of the protocol using infected or inoculated macerated cassava leaves without the need for additional sample treatment. The LAMP test developed in this study was able to detect Xpm in a fast, simple, and sensitive way, and it can be used to monitor the disease under laboratory and field conditions. |
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Palavras-Chave: |
Bacterial blight; Xanthomonas phaseoli pv manihotis. |
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Thesagro: |
Mandioca; Xanthomonas Phaseoli. |
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Thesaurus Nal: |
Bacterial diseases of plants; Cassava; Comparative genomic hybridization; Genomics; Loop-mediated isothermal amplification. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 6. |  | FRANCO, R. A.; REIS, P. R.; ZACARIAS, M. S.; ALTOÉ, B. F.; PEDRO NETO, M. Dinâmica populacional de Oligonychus ilicis (McGregor, 1917) (Acari: Tetranychidae) em cafeeiro e de fitoseídeos associados a ele. COFFEE SCIENCE, Lavras, v.3, n.1, p.38-46, jan./jun. 2008. 38-46| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Local - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 7. | | PEDRO NETO, M.; REIS, P. R.; ZACARIAS, M. S.; SILVA, R. A.; ALCÂNTRA, E. N. Efeito da chuva e do manejo das plantas adventícias na incidência de ácaros predadores (Phytoseeidae) em cafeeiro orgânico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 9. | | PEDRO NETO, M.; SARMENTO, R. A.; OLIVEIRA, W. P. de; PICANÇO, M. C.; ERASMO, E. A. L. Biologia e tabela de vida do ácaro-vermelho Tetranychus bastosi em pinhão-manso. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 4, p. 353-357, abr. 2013. Título em inglês: Biology and life table of the red spider mite Tetranychus bastosi on physic nut.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | SANTOS, A. dos; TEIXEIRA, V. A.; PERES FILHO, O; SERAFIN, M. E.; PEDRO NETO, M.; OLIVEIRA, C. A. de C. Primeiro registro de Tetranychus urticae (Acari: Tetranychidae) em mudas de teca no Brasil. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 34, n. 78, p. 165-167, abr./jun. 2014. Nota científica.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 12. | | SARAIVA, A. S. de; SARMENTO, R. A.; PEDRO NETO, M.; TEODORO, A. V.; ERASMO, E. A. L.; BELCHIOR, D. C. V.; AZEVEDO, E. B. de. Glyphosate sub-lethal toxicity to non-target organisms occurring in Jatropha curcas plantations in Brazil. Experimental & Applied Acarology, Amsterdan, NL, v. 70, n. 2, p. 179-187, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | CRUZ, W. P.; SARMENTO, R. A.; TEODORO, A. V.; ERASMO, E. A. L.; PEDRO NETO, M.; IGNACIO, M.; FERREIRA JUNIOR, D. F. Acarofauna em cultivo de pinhão-manso e plantas espontâneas associadas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 3, p. 319-327, mar. 2012. Título em inglês: Acarofauna in physic nut culture and associated spontaneous weeds.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | DORNELAS, A. S. P.; SARMENTO, R. de A.; PEDRO-NETO, M.; SILVA, D. G. da; SANTOS, G. R. dos; NASCIMENTO, M. O. do; OLIVEIRA, C. A.; SOUZA, D. J. de. Susceptibility of atta sexdens worker ants treated with the immunosuppressant Sandimmun Neoral to Metarhizium anisopliae. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 2, p. 133-136, fev. 2017. Notas científicas. Título em português: Suscetibilidade de operárias de Atta sexdens tratadas com o imunossupressor Sandimmun Neoral a Metarhizium anisopliae.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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